MiSeq MiSeq 測序系統(tǒng)
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產(chǎn)品介紹:
zui短的時(shí)間內(nèi)獲得答案,智能化的工作流程,廣泛的測序應(yīng)用范圍
Illumina公司推出的MiSeq是目前*一臺(tái)在單個(gè)儀器上整合了擴(kuò)增、測序和數(shù)據(jù)分析的新一代測序儀,每次運(yùn)行能產(chǎn)生超過1 Gb的數(shù)據(jù),且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq有著革命性的流程和*的準(zhǔn)確性,這讓它成為快速且經(jīng)濟(jì)高效的遺傳分析的理想平臺(tái),適合廣泛的應(yīng)用。同時(shí)根據(jù)Illumina的消息,今年9月份左右,MiSeq系統(tǒng)的測序通量將會(huì)升級至7G左右。升級將通過兩個(gè)方面完成,一個(gè)是cluster密度的增大,升級后cluster密度將會(huì)增加至12-15million,而pair-end讀取的reads數(shù)目將會(huì)增加至24-30million;另一方面是通過測序讀長而提升通量,屆時(shí)測序讀長會(huì)達(dá)到2*250bp,同時(shí)測序速度也會(huì)有所提升。目前,Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實(shí)現(xiàn)了單端測序300bp讀長,Illumina目前內(nèi)部測序更是完成了2*400bp的pair-end測序。而這些,都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的。
MiSeq性能參數(shù)
工作流程
4大特性
1、zui短的實(shí)驗(yàn)周期:從樣品制備開始只需要8小時(shí)即可得到超過100M的高質(zhì)量測序結(jié)果。
2、zui便捷的樣品制備流程:只需50ngDNA模板,2小時(shí)的自動(dòng)化操作就可以完成全部樣品制備工作。
3、zui精確的測序原理:MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺(tái)的邊合成邊測序的化學(xué)原理,數(shù)千篇高質(zhì)量的期刊文章是對Illumina NGS平臺(tái)測序結(jié)果可信度zui有力的證明。
4、zui完整的整合功能:MiSeq可以獨(dú)立完成簇生成,雙向測序及數(shù)據(jù)分析工作,讓經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)室空間不再成為NGS研究的障礙。
應(yīng)用范圍
1、轉(zhuǎn)錄組測序
派森諾MiSeq測序平臺(tái)是基因組已測序物種的轉(zhuǎn)錄組分析*平臺(tái)。公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了包括斑馬魚在內(nèi)的多種植物、動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄組測序及分析。
2、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測序
對16s rDNA的單V區(qū)(V3\V4)進(jìn)行高通量測序,鑒定細(xì)菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)使用Illumina MiSeq測序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對雞的腸道環(huán)境細(xì)菌進(jìn)行了鑒定。
3、Small RNA測序
1*35bp的讀長*地配合了小RNA的測序長度,速度快,靈敏度高。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了鵝的小RNA測序和多種中草藥的小RNA測序。
4、重測序:
包括全基因組重測序、簡化基因組測序、外顯子測序。
Illumina MiSeq非常適用于對微生物基因組的重測序,每次運(yùn)行即可完成一個(gè)微生物基因組測序。2011年12月27日,派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)利用MiSeq一次運(yùn)行同時(shí)完成了乳酸菌
(Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8)的重測序,基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍,比對至參考序列,基因組覆蓋率為*,同時(shí)檢測到了多種結(jié)構(gòu)變異,包括插入、缺失和SNP位點(diǎn),并且檢測到了全部質(zhì)粒。
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