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外泌體整體實驗

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生物實驗外包實驗

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北京嘉美臻元生物技術(shù)有限公司(嘉美實驗)是一家專注于生命科學(xué)領(lǐng)域的高科技企業(yè),公司創(chuàng)立于2005年,由在國內(nèi)科研試劑、實驗技術(shù)、質(zhì)量管理領(lǐng)域有著十幾年從業(yè)經(jīng)驗的專業(yè)、專家團隊組建而成;2009年在北京重組,先后成立了北京嘉美諾斯生物科技有限公司(主要開展生物相關(guān)產(chǎn)品進、出口業(yè)務(wù)),北京嘉美紐諾生物科技有限公司(主要為大型藥廠、診斷試劑公司提供服務(wù))。為方便實驗服務(wù)項目開展,成立了北京嘉美臻元生物技術(shù)有限公司,以“嘉美實驗”品牌提供實驗外包服務(wù)。近五年來,公司已為全國各類科研用戶提供了近5000個大大小小的專項實驗外包或整體課題外包項目服務(wù),實驗項目涵蓋了生命科學(xué)、醫(yī)學(xué)的各研究領(lǐng)域。經(jīng)過多年努力,公司已成為北京地區(qū)Maximum、Most professionalMost efficient的生物實驗外包服務(wù)平臺。已成功為協(xié)和醫(yī)院、liberation army總醫(yī)院等全國數(shù)百家醫(yī)院提供了優(yōu)質(zhì)的實驗外包服務(wù)。

嘉美實驗面對醫(yī)學(xué)院及其附屬醫(yī)院、醫(yī)藥科研院所、大學(xué)生命*、中科院、藥企等類型單位提供單項和整體課題實驗外包服務(wù)。對于科研任務(wù)繁重但工作繁忙而無暇分身的臨床醫(yī)生而言,我們的實驗外包服務(wù)尤為需要,只需要實驗委托者將課題交付我們,剩下的工作由嘉美實驗完成,這為實驗委托者節(jié)約了大量寶貴的時間和精力,提高了生活品質(zhì)。對于面臨畢業(yè)的廣大碩士、博士而言,我們樂于一起探討課題方案的合理性并給出建議,Maximum degree上優(yōu)化實驗方案和節(jié)約資金。對于課題也許您還只是個設(shè)想,嘉美生物卻能將您的設(shè)想變?yōu)橐粋€個成功的實驗碩果。

嘉美實驗所追求的目標(biāo)不僅僅是一個科研課題實施的過程;我們更多的是關(guān)注實驗前后的每個環(huán)節(jié),真正成為實驗委托者在醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)研究路上的良師益友。“專注生物技術(shù),服務(wù)生命科學(xué)”,為您構(gòu)筑醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)研究的一座座豐碑!

服務(wù)特點
結(jié)果可靠:行業(yè)老牌企業(yè),11年技術(shù)服務(wù)經(jīng)驗沉淀,質(zhì)量全程管控,實驗結(jié)果可靠。
數(shù)據(jù)規(guī)范:326家醫(yī)院,68所高校,近5000個項目的積累,嚴(yán)格遵循行業(yè)學(xué)術(shù)標(biāo)準(zhǔn)。
服務(wù)高效:線上線下7X24小時,多渠道響應(yīng)咨詢及服務(wù)需求,確保溝通及時、暢通。
配套齊全:從課題設(shè)計、試劑購買、實驗開展、SCI論文發(fā)表,可提供一站式配套服務(wù)。
管理精細(xì):公司以客戶需求為中心,管理流程規(guī)范、保密機制嚴(yán)格,成本控制有效。

服務(wù)流程
1、提供項目方案:客戶根據(jù)課題標(biāo)書及需做實驗的主體內(nèi)容,擬定并提供初步的項目方案,含課題申請書,實驗方案,實驗設(shè)計,實驗思路,實驗文獻等與實驗相關(guān)等內(nèi)容和資料;
2、項目評估報價:公司技術(shù)團隊根據(jù)客戶提供的相關(guān)資料,綜合評估項目可行性,與客戶共同確定準(zhǔn)確的實驗項目執(zhí)行方案,給出準(zhǔn)確的實驗價格;
3、簽訂服務(wù)協(xié)議:簽署服務(wù)協(xié)議并預(yù)付部分費用,做好實驗初步準(zhǔn)備及項目預(yù)安排;
4、執(zhí)行服務(wù)項目:正式啟動實驗進程,全面展開實驗,確保項目有效執(zhí)行;
5、溝通項目進展:及時溝通反饋實驗的Newest進展,隨時了解掌控實驗的Newest動態(tài);
6、完成項目交付:支付剩余尾款,交付實驗結(jié)果,正確應(yīng)用實驗結(jié)果,提供售后服務(wù)。

生物實驗外包

產(chǎn)地類別 進口

外泌體整體實驗

1、提供外泌體整體實驗方案:客戶根據(jù)課題標(biāo)書及需做實驗的主體內(nèi)容,擬定并提供初步的項目方案,含課題申請書,實驗方案,實驗設(shè)計,實驗思路,實驗文獻等與實驗相關(guān)等內(nèi)容和資料?;蛘哂杉蚊缹嶒瀰f(xié)助實驗委托者完成外泌體整體實驗方案的設(shè)計。

2、項目評估報價:公司技術(shù)團隊根據(jù)客戶提供的相關(guān)資料,綜合評估項目可行性,與客戶共同確定準(zhǔn)確的實驗項目執(zhí)行方案,給出準(zhǔn)確的實驗價格。嘉美實驗協(xié)助設(shè)計的課題直接給出準(zhǔn)確的報價。
3、簽訂服務(wù)協(xié)議:簽署服務(wù)協(xié)議并預(yù)付部分費用,做好實驗初步準(zhǔn)備及項目預(yù)安排。
4、執(zhí)行服務(wù)項目:正式啟動實驗進程,全面展開實驗,確保項目有效執(zhí)行。
5、溝通項目進展:及時溝通反饋實驗的
Newest進展,隨時了解掌控實驗的Newest動態(tài)。

6、完成項目交付:支付剩余尾款,交付實驗結(jié)果,正確應(yīng)用實驗結(jié)果,提供售后服務(wù)。

一、外泌體介紹
外泌體(Exosome),一種能被大多數(shù)細(xì)胞分泌的微小膜泡,具有脂質(zhì)雙層膜結(jié)構(gòu),直徑約為40-100nm。20世紀(jì)80年代,外泌體被描述為一種從網(wǎng)織紅細(xì)胞分泌的內(nèi)體來源的囊泡。在近些年的實驗研究中,人們發(fā)現(xiàn)這種微小膜泡中含有細(xì)胞特異的蛋白、脂質(zhì)和核酸,能介導(dǎo)體內(nèi)不同細(xì)胞類型之間的細(xì)胞間通訊,從而影響正常和病理狀態(tài)。

近的研究發(fā)現(xiàn)細(xì)胞外囊泡(EVs,包括 Exosomes和Microvesicles等)已經(jīng)成為細(xì)胞間通訊的重要介質(zhì),參與原核生物和高等真核生物細(xì)胞之間的生物信號傳遞,以調(diào)節(jié)不同范圍的生物過程。細(xì)胞外囊泡在很多生理病理上也起著重要的作用,如免疫中抗原呈遞、腫瘤的生長與遷移、組織損傷的修復(fù)等。此外,未修飾和工程化的細(xì)胞外囊泡可能在大分子藥物遞送中具有應(yīng)用價值。不同細(xì)胞分泌的外泌體具有不用的組成成分和功能,可作為疾病診斷的生物標(biāo)志物。外泌體具有脂質(zhì)雙層膜結(jié)構(gòu),能很好的保護其包被的物質(zhì),且能靶向特定細(xì)胞或組織,因此是一種很好靶向給藥系統(tǒng)(targeted delivery system)。

外泌體作為一個新型的研究熱點,由于它在體內(nèi)存在的廣泛性和獲取的便捷性,已經(jīng)成為了疾病診斷治療的潛在有效方式,在精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)發(fā)展上有著光明的前景。


二、外泌體部分單項檢測項目
1、外泌體粒徑分析

從細(xì)胞上清、外周血、尿液、腹水等提取分離的外泌體,通常需要對其粒徑進行檢測,已確定不同來源外泌體的粒徑范圍。根據(jù)Stokes-Einstein原理,外泌體顆粒的布朗運動會導(dǎo)致動態(tài)光散射效應(yīng),散射光波動隨時間發(fā)生變化,檢測器將散射光信號轉(zhuǎn)化為電流信號并做運算處理,通過外泌體的溶液擴散系數(shù)得出其粒徑分布。嘉美實驗提供優(yōu)質(zhì)可靠的外泌體粒徑分析服務(wù),作為外泌體整體研究服務(wù)的一項重要內(nèi)容,確保了后續(xù)實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性。

 

 

2、外泌體表面蛋白標(biāo)記檢測
從細(xì)胞上清、外周血、尿液或腹水等中提取的外泌體,常見的特異性標(biāo)記蛋白為CD63 和CD81,使用熒光直標(biāo)抗體和流式細(xì)胞儀檢測,能夠統(tǒng)計出提取分離之后外泌體的陽性百分比,從而判斷外泌體的純度。嘉美實驗提供外泌體表面標(biāo)記物檢測服務(wù),作為外泌體整體研究服務(wù)的一項重要內(nèi)容,確保了后續(xù)實驗結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性。

 

 

3、外泌體Small RNA測序
  1)服務(wù)優(yōu)勢
    (1)
patent外泌體抽提技術(shù),配合*微量RNA建庫方法,提供miRNA測序整體服務(wù)
    (2)采用3個外泌體或囊泡數(shù)據(jù)庫,注釋信息更完善,為深入挖掘結(jié)果提供佐證
    (3)提供腫瘤研究的臨床數(shù)據(jù)分析,使得分析結(jié)果更加飽滿
    (4)4個
Newest數(shù)據(jù)庫預(yù)測靶基因,結(jié)果更準(zhǔn)確
 


 

 2)外泌體中miRNA常見功能
Small RNA主要包含miRNA、piRNA、tsRNA和snoRNA等RNA分子。小RNA參與基因表達與調(diào)控、RNA的加工與剪切、蛋白質(zhì)翻譯、遺傳“入侵”抑制、配子發(fā)生等重要生物學(xué)過程,是生命活動中不可少的調(diào)控因子。微小RNA(microRNA,簡稱miRNA)是小RNA的主要部分,已被證明與包括癌癥、心血管疾病、免疫系統(tǒng)疾病在內(nèi)的多種疾病密切相關(guān)。如:miRNA可以被外泌體運輸?shù)狡渌?xì)胞組織,為癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移創(chuàng)造合適的微環(huán)境,從而促進癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移。此外,外泌體miRNA也可以作為疾病的生物標(biāo)志物,廣泛應(yīng)用于疾病診斷、個性化治療和預(yù)后等領(lǐng)域。高通量測序技術(shù)可以在單次測序中獲得樣品中所有小RNA的序列信息,從而分析不同疾病狀態(tài)、不同樣品來源、不同處理條件下小RNA的表達水平,并精確比較其之間的小RNA表達差異,從而為后續(xù)研究小RNA的生物學(xué)意義提供指引。

  3)外泌體研究全面技術(shù)路線

 
  4)高通量測序與分析流程


 

  5)生物信息學(xué)分析項目

 

測序類型基本分析高級分析
外泌體
小RNA測序
1、 數(shù)據(jù)質(zhì)量評估及QC
2、 序列比對
3、 全基因組Reads分布圖譜
4、 ncRNA分類與注釋
5、 已知miRNA分析
  5.1 已知miRNA表達量
  5.2 已知miRNA整體表達量分析
  5.3已知miRNA長度
  5.4 已知miRNA堿基偏好性分析 
6、 基因組重復(fù)區(qū)域注釋
7、 功能元件注釋
8、 新miRNA預(yù)測
9、 共有及*序列分析
10、 樣品間miRNA表達差異分析
11、 miRNA家族分析(*于模式物種)
12、 miRNA保守性分析(*于模式物種)
13、 miRNA堿基編輯分析
14、 樣品間相關(guān)性分析
15、 樣品間主成份分析
16、 差異表達miRNA靶基因預(yù)測(已知miRNA,*于人/大鼠/小鼠三個物種)
16.1 miRNA基本信息
16.2 靶基因預(yù)測方法介紹
16.3 靶基因預(yù)測結(jié)果
16.4 候選靶基因
17、 差異表達miRNA靶基因的KEGG通路富集分析
18、 差異表達miRNA靶基因的GO功能富集分析
1、 miRNA靶基因預(yù)測(非模式物種或新miRNA)
2、 新miRNA差異表達分析
3、 miRNA疾病數(shù)據(jù)庫注釋(*于人)
4、 外泌體數(shù)據(jù)庫注釋(*于人/大鼠/小鼠三個物種)
 
 
tsRNA分析
1、 tsRNA來源分析
2、 tsRNA表達量分析
3、 ts差異分析
4、 tsRNA表達聚類分析

 


4、外泌體 lncRNA 測序
  1)服務(wù)優(yōu)勢
    (1)
patent外泌體抽提技術(shù),配合*微量RNA建庫方法,提供lncRNA測序整體服務(wù)
    (2)采用3個外泌體或囊泡數(shù)據(jù)庫,注釋信息更完善,為深入挖掘結(jié)果提供佐證
    (3)多種差異表達計算方法,可根據(jù)項目情況靈活選擇算法,展現(xiàn)更*的數(shù)據(jù)
    (4)全新的比對軟件,分析速度更快,結(jié)果更準(zhǔn)確
    (5)提供腫瘤研究的臨床數(shù)據(jù)分析,使得分析結(jié)果更加飽滿。

  2)外泌體研究全面技術(shù)路線

 

 
3)高通量測序與分析流程

 

 
4)生物信息學(xué)分析項目

 

測序類型基本分析高級分析
外泌體
lncRNA測序
數(shù)據(jù)質(zhì)量評估及QC
核糖體RNA去除率計算
參考基因組比對與全基因組reads分布圖譜
基因表達量整體水平
樣品(組)間基因表達差異分析
差異基因KEGG生物通路富集分析
差異基因 Gene Ontology (GO)功能富集分析
轉(zhuǎn)錄本表達量整體水平
已知mRNA表達量
已知mRNA表達差異分析
已知ncRNA表達量
已知ncRNA表達量差異分析
哺乳動物已知ncRNA保守性分析
· 近緣物種的保守性分析
· Phylop保守性分析
SNP和InDel檢測及注釋
樣品間相關(guān)性分析
樣品間主成分分析
時間序列分析(與分析5二選一)
以下限50條序列分析(*于人、大鼠、小鼠物種)
lncRNA靶基因預(yù)測
lncRNA與靶基因互作分析
lncRNA靶基因KEGG生物通路富集分析
lncRNA靶基因Gene Ontology (GO)功能富集分析
1、共表達分析(樣品>=10)
2、lncRNA Disease注釋
3、腫瘤藥物注釋
3.1 腫瘤耐藥基因注釋
3.2腫瘤靶向藥物注釋
4、基因融合分析
5、可變剪切分析(rMATs)
6、lncRNA-miRNA互作分析
7、基因富集分析(GSEA)
(每組至少3個生物學(xué)重復(fù)樣品)
8、加權(quán)基因共表達網(wǎng)絡(luò)分析
(WGCNA)(加權(quán)基因共
表達網(wǎng)絡(luò)分析,樣品>=10)
9、RNA結(jié)合蛋白預(yù)測
10、已知lncRNA甲基化注釋
11、eRNA分析
12、外泌體*基因注釋


三、外泌體整體實驗成果展
1、華中科技大學(xué)的郭安源教授和李秋柏教授合作發(fā)布FRIST大樣本量的細(xì)胞外膜泡miRNA數(shù)據(jù)庫
Liu, T., et al. (2018). "EVmiRNA: a database of miRNA profiling in extracellular vesicles." Nucleic Acids Res.  IF=11.561

2、中山大學(xué)腫瘤防治中心謝丹教授等:外泌體中的circRNA-PRMT5通過miR-30c海綿促進膀胱尿路上皮癌的轉(zhuǎn)移并誘導(dǎo)EMT
Chen, X., et al. (2018). "PRMT5 Circular RNA Promotes Metastasis of Urothelial Carcinoma of the Bladder through Sponging miR-30c to Induce Epithelial-Mesenchymal Transition." Clin Cancer Res.  IF=10.199

3、東南大學(xué)中大醫(yī)院馬坤嶺教授:血小板微粒介導(dǎo)早期糖尿病腎病的腎小球內(nèi)皮損傷
Zhang, Y., et al. (2018). "Platelet Microparticles Mediate Glomerular Endothelial Injury in Early Diabetic Nephropathy." J Am Soc Nephrol 29(11): 2671-2695.  IF=8.655
腎小球內(nèi)皮功能障礙在早期糖尿病腎病的發(fā)病機制中起著至關(guān)重要的作用,這可能是由循環(huán)代謝異常引起的。血小板微粒、從活化的血小板釋放的細(xì)胞外囊泡,近已被發(fā)現(xiàn)是血管功能障礙的新型調(diào)節(jié)劑。該報道通過鏈脲佐菌素誘導(dǎo)的糖尿病大鼠和原代大鼠腎小球內(nèi)皮細(xì)胞研究了血小板微粒對早期糖尿病腎病腎小球內(nèi)皮損傷的影響。通過流式細(xì)胞術(shù)測量分離的血小板微粒。結(jié)果發(fā)現(xiàn),糖尿病大鼠血漿血小板微粒明顯增加,阿司匹林治療的動物受到抑制。在培養(yǎng)的腎小球內(nèi)皮細(xì)胞中,血小板微粒誘導(dǎo)活性氧的產(chǎn)生,降低一氧化氮水平,抑制內(nèi)皮一氧化氮合酶和SOD的活性,增加腎小球內(nèi)皮屏障的滲透性,以及減少內(nèi)皮表層的厚度。相反,阿司匹林對體內(nèi)血小板微粒的抑制改善了腎小球內(nèi)皮損傷。進一步分析表明,血小板微粒激活了腎小球內(nèi)皮細(xì)胞中mTORC1通路;雷帕霉素或raptor siRNA對mTORC1途徑的抑制在體內(nèi)和體外顯著保護免受微粒誘導(dǎo)的腎小球內(nèi)皮損傷。此外,血小板微粒來源的趨化因子配體7(CXCL7)促成腎小球內(nèi)皮損傷,并且使用CXCL7中和抗體或用CXCR1和CXCR2的競爭性抑制劑阻斷CXCL7受體來拮抗CXCL7顯著減弱了這種損傷。這些研究結(jié)果證明了血小板微粒在腎小球內(nèi)皮功能障礙中的致病作用,并提出了一種潛在的治療靶點CXCL7,用于治療早期糖尿病腎病。

4、武漢大學(xué)謝敏教授、許昱教授:通過ZnO納米線涂覆的三維支架芯片裝置檢測外泌體
Chen, Z., et al. (2018). "Detection of exosomes by ZnO nanowires coated three-dimensional scaffold chip device." Biosens Bioelectron 122: 211-216.  IF=8.173
外泌體有可能成為用于非侵入性癌癥診斷的新型生物標(biāo)志物。然而,在常規(guī)臨床環(huán)境中經(jīng)濟有效地檢測外泌體仍然具有挑戰(zhàn)性。該報道提出了ZnO納米線涂覆的三維(3D)支架芯片裝置,用于有效的免疫捕獲和外泌體的經(jīng)典可視化比色檢測。芯片器件由自立式ZnO納米線陣列覆蓋的3D聚二甲基硅氧烷(PDMS)支架組成。3D支架的互連微孔誘導(dǎo)具有混沌或渦旋特征的流體流動,并且ZnO納米線陣列提供用于固定外泌體特異性抗體的大表面積以及用于保留外泌體的尺寸排阻樣效應(yīng)。這些協(xié)同且顯著增強了外泌體在高流速下的捕獲。通過辣根過氧化物酶(HRP)標(biāo)記的抗體檢測捕獲的外泌體,其可以啟動基于四甲基聯(lián)苯胺(TMB)的比色檢測。外泌體的定量讀數(shù)很容易通過紫外-可見光譜法或酶標(biāo)儀實現(xiàn),線性范圍為2.2×10(5)至2.4×10(7)個顆粒/μL,小可檢測濃度為2.2×10(4)個顆粒/μL。該芯片裝置適用于臨床樣品,其中癌癥患者與健康個體相比顯示出外泌體數(shù)量在統(tǒng)計學(xué)上顯著增加。因此,該芯片設(shè)備具有成本效益且易于使用,便于可見和比色測定,對臨床應(yīng)用具有高靈敏度。


5、南方醫(yī)科大學(xué):通過Au Nanoflare探針原位檢測血漿外泌體miRNA-1246用于乳腺癌診斷
Zhai, L., et al. (2018). "In Situ Detection of Plasma Exosomal MicroRNA-1246 for Breast Cancer Diagnostics by a Au Nanoflare Probe." ACS Appl Mater Interfaces.  IF=8.097
乳腺癌是女性癌癥死亡的第二個原因。早期檢測、治療和轉(zhuǎn)移監(jiān)測對于預(yù)后非常重要。盡管傳統(tǒng)的診斷方法,例如乳房X射線乳房攝影和圖像定位活組織檢查可準(zhǔn)確檢測,但它們可能對患者造成放射性或侵入性損傷。液體活檢作為一種非侵入性方法,便于在臨床癌癥預(yù)后、轉(zhuǎn)移評估和復(fù)發(fā)監(jiān)測中重復(fù)采樣。包裹在循環(huán)外泌體中的微小RNA由于其癌癥特異性表達譜而有希望成為候選癌癥生物標(biāo)志物。該研究報告通過核酸功能化的Au nanoflare探針在人血漿外泌體中原位檢測miR-1246作為乳腺癌生物標(biāo)志物。由于該方法從血漿樣品中分離外泌體不需要耗時太長且叫廉價,也不需轉(zhuǎn)染手段,Au納米熒光探針可以直接進入血漿外泌體特異性靶向miR-1246以定量地產(chǎn)生熒光信號。用探針孵育4小時只需要40 μL血漿,使信號足夠靈敏,可以將乳腺癌樣本與正常對照區(qū)分開來。使用該測定法檢測的血漿miR-1246水平作為標(biāo)記物,從28個健康對照中區(qū)分46個乳腺癌患者,在
optimum截止值下具有100%的靈敏度和92.9%的特異性。Au納米熒光探針的這種簡單、準(zhǔn)確、靈敏且經(jīng)濟的液體活檢有效地被開發(fā)為用于臨床適應(yīng)的非侵入性乳腺癌診斷測定。

6、【綜述】山東大學(xué):藥物納米制劑靶向腦的
Newest進展
Khan, A. R., et al. (2018). "Recent progress of drug nanoformulations targeting to brain." J Control Release 291: 37-64.  IF=7.877
這是一篇關(guān)于跨越血腦屏障(BBB)向腦組織遞送藥物的綜述文章。

7、南京醫(yī)科大學(xué):外泌體傳遞的lncRNA PTENP1抑制膀胱癌進展
Zheng, R., et al. (2018). "Exosome-transmitted long non-coding RNA PTENP1 suppresses bladder cancer progression." Mol Cancer 17(1): 143.  IF=7.776


8、江蘇大學(xué)醫(yī)學(xué)院:腫瘤來源的外泌體誘導(dǎo)中性粒細(xì)胞的N2極化以促進胃癌細(xì)胞遷移
Zhang, X., et al. (2018). "Tumor-derived exosomes induce N2 polarization of neutrophils to promote gastric cancer cell migration." Mol Cancer 17(1): 146.  IF=7.776

 

 


9、山東大學(xué):尿液中外泌體lncRNA的表達特征作為膀胱癌診斷和復(fù)發(fā)預(yù)測的新型非侵入性生物標(biāo)志物
Zhan, Y., et al. (2018). "Expression signatures of exosomal long non-coding RNAs in urine serve as novel non-invasive biomarkers for diagnosis and recurrence prediction of bladder cancer." Mol Cancer 17(1): 142.  IF=7.776
近,已有很多報道提出外泌體長鏈非編碼RNA(lncRNA)的表達特征作為癌癥檢測的潛在的非侵入性生物標(biāo)志物。這項研究的目的是開發(fā)一種尿外泌體(UE)衍生的lncRNA組,用于膀胱癌(BC)的診斷和復(fù)發(fā)預(yù)測。進行定量實時聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)以篩選和評估訓(xùn)練組(208個尿液樣品)和驗證組(160個尿液樣品)中8個候選lncRNA的表達。建立由三種不同表達的lncRNA(MALAT1、PCAT-1和SPRY4-IT1)組成的組用于訓(xùn)練組中的BC診斷。隨后,在驗證組中進一步驗證了該組的性能。此外,Kaplan-Meier分析表明,PCAT-1和MALAT1的上調(diào)與非肌肉浸潤性BC(NMIBC)的無復(fù)發(fā)生存率(RFS)無關(guān),多變量Cox比例風(fēng)險回歸分析顯示,外泌體PCAT-1過表達是NMIBC RFS的獨立預(yù)后因素。總之,研究結(jié)果表明,UE衍生的lncRNAs在BC的診斷和預(yù)后中具有相當(dāng)大的臨床價值。

10、武漢大學(xué)人民醫(yī)院:腫瘤來源的外泌體miR-155激活腫瘤相關(guān)的惡病質(zhì)發(fā)生終促進腫瘤進展
Wu, Q., et al. (2018). "Tumour-originated exosomal miR-155 triggers cancer-associated cachexia to promote tumour progression." Mol Cancer 17(1): 155.  IF=7.776
武漢大學(xué)人民醫(yī)院:腫瘤來源的外泌體miR-155激活腫瘤相關(guān)的惡病質(zhì)發(fā)生終促進腫瘤進展

11、【綜述】鄭州大學(xué)一附院:外泌體miRNA對癌癥生物學(xué)和臨床應(yīng)用的影響
Sun, Z., et al. (2018). "Effect of exosomal miRNA on cancer biology and clinical applications." Mol Cancer 17(1): 147.  IF=7.776

12、香港城市大學(xué):利用3D等離子體光子晶體生物傳感器高度靈敏地檢測外泌體
Zhu, S., et al. (2018). "Highly sensitive detection of exosomes by 3D plasmonic photonic crystal biosensor." Nanoscale 10(42): 19927-19936.  IF=7.233

13、中科院生物物理所&東南大學(xué):用于白血病源外泌體的靈敏熒光生物傳感的雙信號放大平臺
Huang, L., et al. (2018). "A dual-signal amplification platform for sensitive fluorescence biosensing of leukemia-derived exosomes." Nanoscale.  IF=7.233


14、南京醫(yī)科大學(xué):外泌體介導(dǎo)自發(fā)性高血壓大鼠外膜成纖維細(xì)胞轉(zhuǎn)移ACE(血管緊張素轉(zhuǎn)換酶)促進血管平滑肌細(xì)胞遷移
Tong, Y., et al. (2018). "Exosome-Mediated Transfer of ACE (Angiotensin-Converting Enzyme) From Adventitial Fibroblasts of Spontaneously Hypertensive Rats Promotes Vascular Smooth Muscle Cell Migration." Hypertension 72(4): 881-888.  IF=6.823
血管平滑肌細(xì)胞(VSMC)的遷移是高血壓血管重塑的關(guān)鍵。血管外膜成纖維細(xì)胞(AF)在血管結(jié)構(gòu)的穩(wěn)態(tài)中很重要。本研究旨在探討AF外泌體(AFE)在VSMC遷移和基礎(chǔ)機制中的作用。從自發(fā)性高血壓大鼠(SHR)和Wistar-Kyoto(WKY)大鼠的主動脈獲得原代VSMC和AF。用Boyden室測定法和傷口愈合測定法評估VSMC遷移。來自SHR的AFE得到促進,但來自WKY大鼠的AFE對VSMC遷移沒有顯著影響。通過外泌體抑制劑GW4869、AT1R(Ang II [血管緊張素II] 1型受體)拮抗劑氯沙坦或ACE(血管緊張素轉(zhuǎn)換酶)卡托普利的抑制劑來抑制AFE對VSMC遷移的影響。SHR的AFE含量和活性遠(yuǎn)高于WKY大鼠。來自SHR的AFE和來自WKY大鼠的AFE之間的Ang II和AT1R mRNA和蛋白質(zhì)水平?jīng)]有顯著差異。來自SHR的AFE增加WKY大鼠和SHR的VSMC中的Ang II和ACE含量和ACE活性??ㄍ衅绽深A(yù)防Ang II含量和ACE活性的變化。AF中的ACE敲低降低了SHR中AFE的ACE含量和活性,并抑制了AFE誘導(dǎo)的WKY大鼠和SHR大鼠VSMC的遷移。這些結(jié)果表明,來自SHR的AF的外泌體將ACE轉(zhuǎn)移至VSMC,其增加Ang II水平并激活VSMC中的AT1R,從而促進VSMC遷移。

15、武漢大學(xué):黑色素瘤細(xì)胞分泌的外泌體miR-155-5p通過SOCS1/JAK2/STAT3信號通路誘導(dǎo)癌相關(guān)成纖維細(xì)胞的促血管生成
Zhou, X., et al. (2018). "Melanoma cell-secreted exosomal miR-155-5p induce proangiogenic switch of cancer-associated fibroblasts via SOCS1/JAK2/STAT3 signaling pathway." J Exp Clin Cancer Res 37(1): 242.  IF=6.217
背景:癌癥相關(guān)成纖維細(xì)胞(CAF)促進腫瘤血管生成已被廣泛報道。然而,CAF的促血管生成的潛在機制仍然知之甚少。本研究旨在闡明CAF促血管生成的機制。用B16和B16F10衍生的外泌體處理NIH/3T3細(xì)胞。然后通過RT-PCR和Western印跡檢測CAFs標(biāo)記和促血管生成因子。進行CCK-8測定、transwell遷移測定,管形成測定和體內(nèi)Matrigel栓測定以確定CAF的促血管生成能力。Western blot和AG490用于研究JAK2/STAT3信號通路在CAF促血管生成中的作用。使用生物信息學(xué)分析,熒光素酶報告基因測定,microRNA模擬物和抑制劑以及異種移植物模型來研究mmu-miR-155-5p(miR-155)在CAF的促血管生成中的作用。結(jié)果顯示黑色素瘤細(xì)胞分泌的外泌體可以誘導(dǎo)成纖維細(xì)胞重編程為CAFs,并且外泌體miR-155可以觸發(fā)CAF的促血管生成。通過直接靶向細(xì)胞因子的抑制劑,機制上可將外泌體miR-155遞送到成纖維細(xì)胞中并通過靶向SOCS1促進促血管生成因子的表達,包括VEGFa、FGF2和MMP9。SOCS1的下調(diào)激活JAK2/STAT3信號傳導(dǎo)途徑并提高成纖維細(xì)胞中VEGFa、FGF2和MMP9的表達水平。用含有過表達miR-155的外泌體處理可以促進血管生成,并且黑素瘤細(xì)胞分泌的外泌體中miR-155的減少在體外和體內(nèi)減緩血管生成。這些結(jié)果表明,通過SOCS1/JAK2/STAT3信號通路促進受體成纖維細(xì)胞中促血管生成因子的表達,黑素瘤細(xì)胞分泌的外泌體miR-155可誘導(dǎo)CAF的促血管生成。盡管腫瘤血管生成受各種因素的調(diào)節(jié),但外泌體miR-155可能是控制黑素瘤血管生成的潛在靶標(biāo),并可用于建立治療黑素瘤的新策略。

16、清華大學(xué):基于通用Ti3C2 MXenes的自標(biāo)準(zhǔn)比率熒光共振能量轉(zhuǎn)移平臺用于高靈敏度檢測外泌體
Zhang, Q., et al. (2018). "Universal Ti3C2 MXenes Based Self-Standard Ratiometric Fluorescence Resonance Energy Transfer Platform for Highly Sensitive Detection of Exosomes." Anal Chem.  IF=6.042
外泌體作為疾病預(yù)測和診斷的新型非侵入性生物標(biāo)志物,在監(jiān)測與癌癥相關(guān)的公共衛(wèi)生問題方面顯示出了令人著迷的前景。該研究將*的Cy3標(biāo)記的CD63適體(Cy3-CD63適體)/Ti3C2 MXenes納米復(fù)合物構(gòu)建為用于定量檢測外泌體的自標(biāo)準(zhǔn)比率熒光共振能量轉(zhuǎn)移(FRET)納米探針。Cy3-CD63適體可以通過適體和MXenes之間的氫鍵和金屬螯合物相互作用選擇性地吸附到Ti3C2 MXene納米片上,并且由于Cy3和MXenes之間的FRET,來自Cy3-CD63適體的熒光信號被快速淬滅。加入外泌體后Cy3的熒光大大恢復(fù),外泌體可以與適體特異性結(jié)合,并且由于適體和CD63蛋白在外泌體表面上的高親和力而從Ti3C2 MXenes的表面釋放。同時,MXenes在整個過程中的自發(fā)熒光信號變化不大,可作為標(biāo)準(zhǔn)參考。基于自標(biāo)準(zhǔn)開啟的FRET生物傳感平臺,外泌體的檢測極限為1.4×10(3)顆粒mL(-1),比常規(guī)ELISA方法低1000倍以上。該熒光傳感器還可結(jié)合熒光共聚焦掃描顯微鏡圖像用于鑒定外泌體表面上的多種生物標(biāo)志物和不同種類的外泌體。所提出的策略不僅為外泌體提供了通用的納米平臺,而且可以廣泛地擴展到多種生物標(biāo)記物檢測,這可能有望使MXenes成為生物學(xué)領(lǐng)域的強大候選者。

 

 

17、湖北中醫(yī)藥大學(xué):基于適體納米探針的外泌體表面蛋白質(zhì)分析和檢測新方法——ExoAPP
Jin, D., et al. (2018). "ExoAPP: Exosome-Oriented, Aptamer Nanoprobe-Enabled Surface Proteins Profiling and Detection." Anal Chem.  IF=6.042
攜帶親代細(xì)胞遺傳分子標(biāo)記的腫瘤外泌體正在作為癌癥診斷中的細(xì)胞“替代物”出現(xiàn)。外泌體的分子譜和檢測提供了對癌癥進展?fàn)顟B(tài)的*途徑,但在技術(shù)上仍然具有挑戰(zhàn)性。該研究報告了一種外泌體導(dǎo)向,基于適體納米探針的分析(ExoAPP)測定,以鑒定表面蛋白質(zhì)表型和量化癌癥外泌體。ExoAPP將石墨烯氧化物(GO)與靶向響應(yīng)適配體連接,通過補充酶輔助的外泌體再循環(huán)來分析五種細(xì)胞類型的外泌體標(biāo)記,揭示異質(zhì)模式。該測定實現(xiàn)了低至1.6 x 10(5)粒子的檢測限/mL,比其他同類方法降低了幾個數(shù)量級。這種靈敏的ExoAPP測定可通過異質(zhì)外泌體監(jiān)測上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)變,而不涉及經(jīng)常在基于GO的貨物遞送中發(fā)生的細(xì)胞內(nèi)化。使用ExoAPP分析來自前列腺癌患者的血液樣本,發(fā)現(xiàn)可以通過表面PSMA鑒定靶外泌體,表明它們在臨床診斷中的潛力。

18、清華大學(xué):從血漿中快速分離和可視化檢測腫瘤來源的外泌體
Chen, J., et al. (2018). "Rapid Isolation and Visible Detection of Tumor-derived Exosomes from Plasma." Anal Chem.  IF=6.042
外泌體是從多種細(xì)胞釋放的納米級細(xì)胞外囊泡(30-120 nm),其為癌癥的非侵入性診斷提供了有希望的生物標(biāo)志物。然而,傳統(tǒng)的外泌體分離方法繁瑣,非標(biāo)準(zhǔn)化,并且需要龐大的儀器,因此限制了其臨床應(yīng)用。本文*提出了一種基于陰離子交換(AE)的分離方法,在30分鐘內(nèi)通過AE磁珠直接從血漿和細(xì)胞培養(yǎng)基中分離外泌體。通過AE磁珠分離的外泌體具有比UC更高的回收效率(> 90%)和更少的蛋白質(zhì)雜質(zhì)。然后,*用適體封端的Fe3O4納米顆粒以可視化、無標(biāo)記和定量方式檢測血漿中的前列腺癌(PCa)外泌體。PCa外泌體的線性范圍估計為0.4×10(8)至6.0×10(8)個顆粒/mL,檢測限為3.58×10(6)個顆粒/mL。本研究為外泌體的快速分離和可視化檢測提供了一種有效而實用的方法,有望用于早期診斷PCa。

19、南京醫(yī)科大學(xué)一附院:微小RNA和長鏈非編碼RNA在抗癌治療中的潛在調(diào)節(jié)作用
Xie, M., et al. (2018). "Potential Regulatory Roles of MicroRNAs and Long Noncoding RNAs in Anticancer Therapies." Mol Ther Nucleic Acids 13: 233-243.  IF=5.66

20、哈爾濱醫(yī)科大學(xué):外泌體15-LO2在體內(nèi)和體外介導(dǎo)缺氧誘導(dǎo)的肺動脈高壓
Zhang, M., et al. (2018). "Exosomal 15-LO2 mediates hypoxia-induced pulmonary artery hypertension in vivo and in vitro." Cell Death Dis 9(10): 1022.  IF=5.638

 

 

21、南京醫(yī)科大學(xué):DNA甲基化介導(dǎo)的miR-486-5p沉默通過激活PLAGL2信號通路促進結(jié)直腸癌增殖和轉(zhuǎn)移
Liu, X., et al. (2018). "DNA-methylation-mediated silencing of miR-486-5p promotes colorectal cancer proliferation and migration through activation of PLAGL2/IGF2/beta-catenin signal pathways." Cell Death Dis 9(10): 1037.  IF=5.638

22、安徽醫(yī)科大學(xué):hsa-miR-500a-3P通過靶向腎上皮細(xì)胞中MLKL介導(dǎo)的壞死性凋亡來減輕腎損傷
Jiang, L., et al. (2018). "hsa-miR-500a-3P alleviates kidney injury by targeting MLKL-mediated necroptosis in renal epithelial cells." FASEB J: fj201801711R.  IF=5.595

23、鄭州大學(xué):間充質(zhì)干細(xì)胞衍生的外泌體通過下調(diào)脊髓損傷中磷酸化的NFkappaB P65亞基來減少A1星形膠質(zhì)細(xì)胞
Wang, L., et al. (2018). "Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosomes Reduce A1 Astrocytes via Downregulation of Phosphorylated NFkappaB P65 Subunit in Spinal Cord Injury." Cell Physiol Biochem 50(4): 1535-1559.  IF=5.5

24、南京大學(xué):在外泌體上進行Lectin介導(dǎo)的原位滾環(huán)擴增,用于探測癌癥相關(guān)的聚糖模式
Feng, Y., et al. (2018). "Lectin-mediated in situ rolling circle amplification on exosomes for probing cancer-related glycan pattern." Anal Chim Acta 1039: 108-115.  IF=5.123

25、南京醫(yī)科大學(xué)&東南大學(xué):外泌體——癌細(xì)胞耐藥性的新型介質(zhì)
Zhang, H. D., et al. (2018). "Exosome: a novel mediator in drug resistance of cancer cells." Epigenomics.  IF=4.979

26、中山大學(xué)第三附屬醫(yī)院:MSC衍生的外泌體通過在海綿體神經(jīng)損傷的大鼠模型中減輕海綿體平滑肌細(xì)胞凋亡來改善勃起功能障礙
Ouyang, X., et al. (2018). "MSC-derived exosomes ameliorate erectile dysfunction by alleviation of corpus cavernosum smooth muscle apoptosis in a rat model of cavernous nerve injury." Stem Cell Res Ther 9(1): 246.  IF=4.963

27、中山大學(xué)*附屬醫(yī)院:源自miR-92a-3p過表達人間充質(zhì)干細(xì)胞的外泌體通過靶向WNT5A增強軟骨形成并抑制軟骨降解
Mao, G., et al. (2018). "Exosomes derived from miR-92a-3p-overexpressing human mesenchymal stem cells enhance chondrogenesis and suppress cartilage degradation via targeting WNT5A." Stem Cell Res Ther 9(1): 247.  IF=4.963


28、天津醫(yī)科大學(xué)總醫(yī)院:過表達IL-35的間充質(zhì)干細(xì)胞——一種新的免疫抑制策略和誘導(dǎo)移植耐受的治療靶點
Guo, H., et al. (2018). "Mesenchymal stem cells overexpressing IL-35: a novel immunosuppressive strategy and therapeutic target for inducing transplant tolerance." Stem Cell Res Ther 9(1): 254.  IF=4.963

29、同濟大學(xué):表征三種不同類型的細(xì)胞外囊泡及其對細(xì)菌生長的影響
Yu, S., et al. (2019). "Characterization of three different types of extracellular vesicles and their impact on bacterial growth." Food Chem 272: 372-378.  IF=4.946

30、蘇州大學(xué)一附院:具有缺血心肌靶向肽的工程化外泌體用于心肌梗死的靶向治療
Wang, X., et al. (2018). "Engineered Exosomes With Ischemic Myocardium-Targeting Peptide for Targeted Therapy in Myocardial Infarction." J Am Heart Assoc 7(15): e008737.  IF=4.45

 31、第四軍醫(yī)大學(xué):外泌體介導(dǎo)的腫瘤進展中的細(xì)胞通訊
Wan, Z., et al. (2018). "Exosome-mediated cell-cell communication in tumor progression." Am J Cancer Res 8(9): 1661-1673.  IF=3.998

 


32、南昌大學(xué)二附院:外泌體調(diào)節(jié)癌癥干細(xì)胞穩(wěn)態(tài)中癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)化
Xu, J., et al. (2018). "Exosomes Regulate the Transformation of Cancer Cells in Cancer Stem Cell Homeostasis." Stem Cells Int 2018: 4837370.  IF=3.989

33、蘇州大學(xué):間充質(zhì)干細(xì)胞外泌體遞送miRNA-132促進心肌梗死中的血管生成
Ma, T., et al. (2018). "MicroRNA-132, Delivered by Mesenchymal Stem Cell-Derived Exosomes, Promote Angiogenesis in Myocardial Infarction." Stem Cells Int 2018: 3290372.  IF=3.989

34、【綜述】昆山*人民醫(yī)院:外泌體在病原體感染中的潛在功能
Wang, J., et al. (2018). "Host derived exosomes-pathogens interactions: Potential functions of exosomes in pathogen infection." Biomed Pharmacother 108: 1451-1459.  IF=3.457

35、吉林大學(xué):外泌體介導(dǎo)mir-193b對RAB22A的調(diào)節(jié)抑制乳腺癌生長和轉(zhuǎn)移
Sun, L., et al. (2018). "Regulation of RAB22A by mir-193b inhibits breast cancer growth and metastasis mediated by exosomes." Int J Oncol.  IF=3.333

 


36、南京市六合區(qū)人民醫(yī)院:MSC外泌體通過lncRNA-KLF3-AS1/miR-206/GIT1軸在骨關(guān)節(jié)炎中促進增殖并抑制軟骨細(xì)胞凋亡
Liu, Y., et al. (2018). "MSC-derived exosomes promote proliferation and inhibit apoptosis of chondrocytes via lncRNA-KLF3-AS1/miR-206/GIT1 axis in osteoarthritis." Cell Cycle.  IF=3.304
 
37、山東大學(xué)齊魯醫(yī)院:子宮內(nèi)膜異位癥的正位間質(zhì)細(xì)胞通過外泌體途徑促進
Nerve and blood vessels生成。
Sun, H., et al. (2018). "Eutopic stromal cells of endometriosis promote neuroangiogenesis via exosome pathway." Biol Reprod.  IF=3.184

38、哈爾濱醫(yī)科大學(xué):外泌體microRNA-29a介導(dǎo)肥胖相關(guān)性心肌病的心功能不全和線粒體失活
Li, F., et al. (2018). "Exosomal microRNA-29a mediates cardiac dysfunction and mitochondrial inactivity in obesity-related cardiomyopathy." Endocrine.  IF=3.179

39、武漢大學(xué):口腔扁平苔蘚中循環(huán)外泌體microRNAs表達譜的差異
Peng, Q., et al. (2018). "Differentially circulating exosomal microRNAs expression profiling in oral lichen planus." Am J Transl Res 10(9): 2848-2858.  IF=3.061

 



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