免疫共沉淀（CHIRP）實驗
- 公司名稱 上海研謹生物科技有限公司
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- 更新時間 2024/8/30 15:53:25
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| 供貨周期 | 一個月以上 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,化工,生物產(chǎn)業(yè) |
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免疫共沉淀（CHIRP）實驗
RNA綁定的DNA和蛋白相互作用: CHIRP
免疫共沉淀實驗(Chromatin Isolation by RNA Purification, CHIRP)是-種檢測體內(nèi)與RNA綁定的DNA和蛋白相互作用的方法，可同時分析IncRNAcircRNA、蛋白及DNA三者互作關(guān)系。
CHIRP實驗意義
IncRNA可與蛋白質(zhì)、DNA和RNA相互作用，實現(xiàn)多樣化功能，CHIRP可以探討IncRNA與其互作的DNA.蛋白質(zhì)的功能與作用機制，是相關(guān)科學(xué)研究工作的有力工具。IncRNA的研究在表觀遺傳調(diào)控等生命活動中發(fā)揮重要作用，CHIRP是研究
IncRNA的重要技術(shù)手段，可在全基因組范圍內(nèi)鑒定RNA與染色質(zhì)的互作，并對其進行定性、定量及定位的分析。
CHIRP實驗原理
CHIRP (Chromatin Isolation by RNA )是通過結(jié)合生物素的核酸探針，將目標RNA拉下來,與之共同作用的DNA染色體片段(DNA與蛋白質(zhì)復(fù)合體)就會被吸附下來，后可以通過qRT-PCR. WB.測序分析和質(zhì)譜分析等檢測RNA. DNA和蛋白質(zhì)。
CHIRP的實驗流程
①探針設(shè)計:設(shè)計反義穿核苷酸探針:
②細胞培養(yǎng)
③破碎細胞
④生物素標記的DNA探針與RNA雜交
⑤CHIRP
⑥RNA、DNA及核酸結(jié)合蛋白提取;
⑦分析檢測。
結(jié)果展示
實驗完成周期及交付標準
1.實驗周期: 1-3個月
2.交付標準: CHIRP鑒定結(jié)果報告、分析報告、實驗報告(試劑、 耗材、實驗步驟)、原始數(shù)據(jù)等
實驗需與客戶確認的信息
1.目的基因與蛋白信息。
2.樣本類型與種屬
3.是否需要生信分析
參考文獻
[1]lyer S , Modali S D , Agarwal S K. The Long Non-Coding RNA MEG3 is an Epigenetic Determinant of Oncogenic
Signaling in Functional Pancreatic Neuroendocrine Tumor Cells[J]. Molecular and Cellular Biology, 2017:MCB.00278-
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[2] Chu C , Chang H Y . Understanding RNA-Chromatin Interactions Using Chromatin Isolation by RNA Purification
(ChIRP).[J]. Methods in Molecular Biology, 2016, 1480.
[3]ZhuJJ,FuHJ , Wu Y G , et al. Function of IncRNAs and approaches to IncRNA-protein interactions[J]. Science
China Life Sciences, 2013, 56(10):876-885.
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