對生態(tài)系統(tǒng)呼吸進行估算的一種方法就是通過氣室來進行，（i）可以是全封閉的生態(tài)系統(tǒng)（例如中型實驗生態(tài)系，更小的植物群落例如草地），并對凈生態(tài)系統(tǒng)二氧化碳交換量NEE進行直接測量，（ii）也可以是封閉部分生態(tài)系統(tǒng)組成（例如葉片，土壤等）的氣室，這就需要在規(guī)模上進行額外的擴大。這兩種方法在一定環(huán)境條件下都能收到很好的效果——溫度和濕度的變化必須被降到低或者至少要記錄下來。

    VSI可以提供用于野外和實驗室內(nèi)，定制式的生態(tài)系統(tǒng)呼吸室，它們通過各種大小的透明的聚碳酸酯（高透光性）材料板構(gòu)成，通常用于溫室氣體的測量。如有需要，可提供模塊化設(shè)計，用以在植物生長過程中調(diào)整氣室的大小。每個襯圈周圍的密封，和底板（如果需要使用中型實驗生態(tài)系）的孔洞都保證了充分的氣密性。對于野外的應(yīng)用，可以在氣室底部安裝金屬框架，來確保對于土壤的氣密性。通過一個或者多個可調(diào)節(jié)的（方向和風(fēng)速）風(fēng)扇來實現(xiàn)室內(nèi)氣體流通，以實現(xiàn)室內(nèi)氣體的均勻性。通風(fēng)設(shè)備的大小，風(fēng)速和角度都是可調(diào)的，以避免對植物和紅外氣體分析（IRGA）測量產(chǎn)生不良影響。VSI可以提供用于一般紅外氣體分析（IRGA）的管連接板。環(huán)境監(jiān)測系統(tǒng)，由溫度（空氣/葉片），rH(相對濕度)監(jiān)測設(shè)備組成，內(nèi)/外置的光合作用有效輻射（PAR）傳感器可以基于需要進行開發(fā)。右圖的氣室（1250cm x 1250cm x 30-2000cm， W x D x H）是為Vienna大學(xué)定制的版本，用來測量不同生態(tài)系統(tǒng)的凈生態(tài)系統(tǒng)碳交換量（NEE）。其他版本的生態(tài)系統(tǒng)呼吸室則是帶有為使用方便和適于中型試驗生態(tài)系自動封閉放置而設(shè)置鋁支架的氣室。