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二代測(cè)序

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上海翼和應(yīng)用生物技術(shù)有限公司至今已有十八年歷史。公司具備ISO9001與CMA資質(zhì),上海翼和專家團(tuán)隊(duì)富有開(kāi)創(chuàng)精神,朝氣蓬勃,秉承“專業(yè)、協(xié)作、進(jìn)取”的企業(yè)精神,為國(guó)內(nèi)科研工作者和生物醫(yī)藥企業(yè)提供細(xì)胞質(zhì)控類(lèi)、健康檢測(cè)類(lèi)與科研技術(shù)類(lèi)的服務(wù)與產(chǎn)品。

翼和專注為工業(yè)客戶提供:細(xì)胞STR鑒定,種屬鑒定,PDX模型質(zhì)控,支原體檢測(cè)服務(wù)/試劑盒,端粒長(zhǎng)度檢測(cè)/試劑盒,端粒酶活性檢測(cè)/試劑盒等服務(wù)及產(chǎn)品。為科研客戶提供:實(shí)驗(yàn)大小鼠遺傳背景鑒定,線粒體拷貝數(shù)變異檢測(cè),超高重SNP分型檢測(cè),目標(biāo)區(qū)間重測(cè)序,目標(biāo)區(qū)域甲基化測(cè)序等服務(wù)。





主要技術(shù)服務(wù):細(xì)胞STR鑒定;支原體檢測(cè);細(xì)胞種屬檢測(cè);端粒長(zhǎng)度檢測(cè);端粒酶活性檢測(cè)等。

二代測(cè)序介紹:

表觀遺傳學(xué)(epigenetics)是目前分子生物學(xué)研究的熱點(diǎn)之一,DNA甲基化測(cè)序是表觀遺傳學(xué)的重要內(nèi)容,是基因組DNA的主要表觀遺傳修飾形式之一。DNA甲基化是指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMTs)的催化下,將甲基基團(tuán)轉(zhuǎn)移到胞嘧啶堿基上的一種修飾方式。它主要發(fā)生在富含雙核苷酸CpG島的區(qū)域。正常情況下CpG島是以非甲基化形式(活躍形式)存在的,DNA甲基化可導(dǎo)致基因表達(dá)沉默。DNMTs的活性異常與疾病有密切的關(guān)系。對(duì)于維持正常細(xì)胞功能、傳遞基因組遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類(lèi)腫瘤發(fā)生,起著至關(guān)重要的作用。

上海翼和生物通過(guò)亞硫酸氫鹽(bisulfite)處理,用多重PCR擴(kuò)增目的片段,添加barcode和測(cè)序通用接頭,在Illumina X10二代測(cè)序平臺(tái)對(duì)PCR產(chǎn)物進(jìn)行高通量測(cè)序,利用生物信息學(xué)方法,精確定量計(jì)算目標(biāo)區(qū)間內(nèi)的甲基化位點(diǎn)的甲基化狀態(tài),在完成目標(biāo)區(qū)域檢測(cè)的同時(shí)大幅降低研究費(fèi)用。

Hi-MethylSeq結(jié)合了亞硫酸鹽轉(zhuǎn)換、靶向擴(kuò)增子高通量測(cè)序技術(shù),可實(shí)現(xiàn)多區(qū)段、多位點(diǎn)的甲基化精確定量分析。本方法適用于感興趣的目的片段的甲基化研究,在大樣本中進(jìn)一步確認(rèn)全基因組甲基化研究挑選的陽(yáng)性位點(diǎn)。

重亞硫酸鹽處理是DNA甲基化測(cè)序中基因組DNA處理的金標(biāo)準(zhǔn),是一個(gè)化學(xué)過(guò)程,可造成DNA的損傷,很難同時(shí)實(shí)現(xiàn)100%的轉(zhuǎn)換效率和保持DNA的完整性,二者需要做出一定的平衡。Hi-MethylSeq目標(biāo)區(qū)域之外選取3段非CpG島序列作為內(nèi)對(duì)照,準(zhǔn)確評(píng)估樣本的轉(zhuǎn)化率。

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