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羥甲基化DNA免疫共沉淀測(cè)序(hMeDIP-Seq)

參考價(jià) 1
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  • 公司名稱 深圳市易基因科技有限公司
  • 品牌 其他品牌
  • 型號(hào)
  • 產(chǎn)地
  • 廠商性質(zhì) 生產(chǎn)廠家
  • 更新時(shí)間 2024/8/12 14:41:18
  • 訪問(wèn)次數(shù) 157

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深圳市易基因科技有限公司(簡(jiǎn)稱易基因,E-GENE Co.,Ltd.)專注表觀組學(xué)十余年,以“表觀遺傳學(xué)科學(xué)研究與臨床應(yīng)用”為愿景,依托高通量測(cè)序技術(shù)和云數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。為醫(yī)療機(jī)構(gòu)、科研機(jī)構(gòu)、企事業(yè)單位等提供以表觀遺傳學(xué)技術(shù)為核心的多組學(xué)科研服務(wù)及解決方案,全面覆蓋針對(duì)生命科學(xué)基礎(chǔ)研究、醫(yī)學(xué)及臨床應(yīng)用研究等內(nèi)容。


易基因?qū)W⒈碛^組學(xué)十余年,多組學(xué)科研服務(wù)。技術(shù)團(tuán)隊(duì)在國(guó)際上LHC-BS、HMST-seq、ChIP-BS、cfDNA-TBS等甲基化、羥甲基化技術(shù)流程,研發(fā)建立簡(jiǎn)化基因組甲基化dRRBS、cfDNA-RBS,單細(xì)胞/微量DNA全基因組甲基化及簡(jiǎn)化高通量甲基化測(cè)序技術(shù),RNA甲基化測(cè)序等技術(shù)和方法,并建立易基因科技全自動(dòng)化彈性資源生信分析系統(tǒng)。在Nature、Lancet、Science、Nat Commun、 Cell Res、Genome Biol、Blood、PloS Genet、Epigenetics、Epigenomics 、Clin Epigenetic等期刊發(fā)表論文100余篇,申請(qǐng)發(fā)明12項(xiàng)、軟件著作權(quán)27項(xiàng)。



T:0755 - 28317900 

V:181 2416 7839

生命科學(xué)及生物技術(shù)研發(fā)和推廣,生物技術(shù)服務(wù)

5hmC是新發(fā)現(xiàn)的一種的修飾堿基,由TET家族的酶通過(guò)氧化5mC產(chǎn)生的。5hmC不僅能夠降低MeCP蛋白的甲基化結(jié)合結(jié)構(gòu)域(MBD) 與甲基化DNA的親和性,具有潛在的參與基因表達(dá)調(diào)控的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)功能,而且參與了DNA去甲基化過(guò)程。


羥甲基化DNA免疫沉淀測(cè)序(Hydroxymethylated DNA Immunoprecipitation Sequencing,hMeDIP-Seq)是通過(guò)運(yùn)用5'-羥甲基胞嘧啶特異性抗體富集羥甲基化的DNA pian段,然后結(jié)合高通量測(cè)序技術(shù)在全基因組水平上以較小的數(shù)據(jù)量,快速、高效地尋找羥甲基化區(qū)域。可廣泛應(yīng)用于羥甲基化與疾病關(guān)系研究以及羥甲基化在胚胎發(fā)育過(guò)程中的研究。


技術(shù)優(yōu)勢(shì):

1、檢測(cè)范圍廣:全基因組范圍鑒定甲基化修飾區(qū)域;

2、針對(duì)性強(qiáng):針對(duì)性檢測(cè)基因組內(nèi)具有甲基化修飾的區(qū)域;

3、成本低:大大降低了測(cè)序數(shù)據(jù)量,測(cè)序成本低。


實(shí)驗(yàn)策略:

羥甲基化DNA免疫共沉淀測(cè)序(hMeDIP-Seq)

信息分析:

羥甲基化DNA免疫共沉淀測(cè)序(hMeDIP-Seq)

技術(shù)參數(shù):

羥甲基化DNA免疫共沉淀測(cè)序(hMeDIP-Seq)


研究案例:

小鼠胚胎干細(xì)胞的羥甲基化研究

Wu H,et al. Genome-wide analysis of 5-hydroxymethylcytosine distribution reveals its dual function in transcriptional regulation in mouse embryonic stem cells. Genes Dev. 2011 Apr 1;25(7):679-84.


1、背景:研究證實(shí)TET家族蛋白可以催化5mC轉(zhuǎn)化為5hmC。5mC已經(jīng)被廣泛研究,但對(duì)5hmC的分布和功能知道的還很少。

2、方法:利用hMeDIP-seq測(cè)序技術(shù)對(duì)小鼠胚胎干細(xì)胞的wild-type和Tet1-depleted type的5hmC進(jìn)行研究。

3、結(jié)論:5hmC在轉(zhuǎn)錄活性高的基因的gene bodies區(qū)域和受到Polycomb抑制的發(fā)育調(diào)節(jié)因子的啟動(dòng)子區(qū)域;5hmC可能在基因表達(dá)調(diào)控中起著激活和抑制的雙重功能。

羥甲基化DNA免疫共沉淀測(cè)序(hMeDIP-Seq)


5hmC在全基因組的分布




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