對樣本開展研究時，為了以納米級分辨率顯示其精細(xì)結(jié)構(gòu)，通常會使用到電子顯微鏡。
電子顯微鏡有兩種類型：掃描電子顯微鏡（SEM）用于對樣本表面成像，以及需要使用極薄電子透明樣本的透射電子顯微鏡（TEM）。因此，使用電子顯微鏡對樣本內(nèi)部的精細(xì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行成像時，此類技術(shù)解決方案需要制作出非常薄的樣本切片。被稱為超薄切片技術(shù)的樣本制備方法可以產(chǎn)生具有最小假象的超薄切片（厚度20-150nm）。
在切片過程中，樣本的塊面（切割切片處）始終保持在一個平直的表面上，可供SEM進(jìn)行研究。當(dāng)截面在陣列中成像時，就可以重建樣本的三維圖像。這種方法稱為陣列斷層掃描（AT）。超薄切片技術(shù)及其在AT中的應(yīng)用概述如下。
超薄切片技術(shù)
超薄切片技術(shù)主要用作透射電子顯微鏡（TEM）的樣本制備方法。它允許樣本的內(nèi)部結(jié)構(gòu)以納米級分辨率進(jìn)行可視化和分析。它以快速、干凈的方式制作超薄的樣本切片。超薄切片技術(shù)的一個主要優(yōu)點(diǎn)是切片內(nèi)電子透明區(qū)域的大小和均勻性以及切片產(chǎn)生的速度。
超薄切片技術(shù)可用于多種類型的樣本，包括生物學(xué)試樣和工業(yè)材料如聚合物（橡膠和塑料）以及韌性、硬質(zhì)或脆性材料（金屬或陶瓷）等。制備這些樣本薄片還有其他技術(shù)，如聚焦離子束（FIB）銑削、離子刻蝕、三腳架拋光和電化學(xué)處理，但超薄切片技術(shù)在速度和清潔度方面具有優(yōu)勢。
陣列斷層掃描 (AT) 是一種用于細(xì)胞和蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析的高分辨率三維圖像重建方法。該技術(shù)利用掃描電子顯微鏡（SEM）或光學(xué)顯微鏡（LM）中超薄、樹脂包埋連續(xù)切片的有序陣列成像。AT技術(shù)能夠?qū)?xì)胞及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)開展定量立體結(jié)構(gòu)分析和可視化觀察。其橫向和空間分辨率比傳統(tǒng)的共焦顯微鏡更理想。此外，通過生物試樣的部分自動化檢測來實(shí)現(xiàn)更高的處理量。
超薄切片原理
利用陣列斷層掃描進(jìn)行TEM觀察以及實(shí)現(xiàn)優(yōu)化3D重建時，超薄有序的切片是一大前提。超薄切片機(jī)（如徠卡顯微系統(tǒng)的EM UC7）則可以制作出此類超薄的樣本切片（厚度20 ~ 150 nm）。
要在透射電子顯微鏡中形成樣本的圖像，電子必須在不出現(xiàn)任何重大速度損失的情況下穿透樣本。樣本對電子輻射的滲透率部分取決于其質(zhì)量和厚度（厚度×密度），部分取決于電子顯微鏡的加速電壓。被試樣吸收的電子會導(dǎo)致熱量積聚，從而在物體中形成假象。
圖1：顯示超薄切片機(jī)樣品臂、刀座和水槽式玻璃刀的側(cè)視圖。
使用超薄切片機(jī)進(jìn)行切片時，需將樣本插入安裝在特殊軸承上的樣品臂當(dāng)中，由該軸承執(zhí)行垂直切割運(yùn)動。切割截面并縮回試樣支臂后，極其準(zhǔn)確的機(jī)電進(jìn)給將試樣稍微向前移動，移動距離與所需截面厚度相對應(yīng)。通過將試樣垂直移動到固定玻璃刀或金剛石刀的鋒利刀片上進(jìn)行切片。由于切片過薄，直接從刀片上取下切片很困難。
因此，它們是在切片程序后從水槽中水面上收集的（或在冷凍切片的情況下借助顯微操作器）。在用電子顯微鏡（EM）檢查之前，可能需要做任何進(jìn)一步的準(zhǔn)備。
陣列斷層掃描的試樣制備
為AT制備生物學(xué)軟試樣時需要完成若干步驟的操作。這些步驟包括：
然后通過SEM或LM（通常為熒光）對切片陣列成像。后續(xù)將陣列中的切片圖像合并在一起進(jìn)行3D圖像重建和分析。
很多超薄切片機(jī)的AT樣本制備涉及多個耗時繁瑣的手動操作步驟。高級超薄切片機(jī)（如徠卡顯微系統(tǒng)ARTOS 3D）則可通過試樣切片的自動化處理來加速整個制備過程，最大限度縮短SEM或LM成像中的切片處理時間。
應(yīng)用圖像
圖2：陣列斷層掃描（ARTOS 3D）高級超薄切片解決方案的金剛石刀頭圖片，可用于執(zhí)行自動連續(xù)切片。可見厚度均勻的無褶皺條帶漂浮在水槽內(nèi)的水面上。
圖3：黃金的切片表面– AFM圖像
圖4：銅與黃金層的橫截面 – TEM圖像。感謝德國WWU Münster提供的圖片
圖5：通過陣列斷層掃描采集到的小鼠淋巴細(xì)胞的3D圖像重建。感謝奧地利克洛斯特新堡科技研究院（IST）提供的圖片。
圖6：酸硫桿狀菌 HV2/2。感謝馬堡大學(xué)Dr. Andreas Klingl提供的圖片。
圖7：大鼠腎臟。感謝德國漢堡大學(xué)L. Edelmann提供的圖片。
圖8：擬南芥。感謝根特大學(xué)Riet De Rycke提供的圖片。
圖9：擬南芥。感謝根特大學(xué)Riet De Rycke提供的圖片。
圖10：小鼠心臟。感謝根特大學(xué)Riet De Rycke提供的圖片。
圖11：小鼠心臟。感謝根特大學(xué)Riet De Rycke提供的圖片。
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