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技術(shù)文章

DNA限制酶批注討論

閱讀:916          發(fā)布時間:2011-1-18

a. 限制酶: 可購自Roche Molecular Biochemicals (即以前的Boehringer Mannheim Biochemicals), Invitrogen (即以前的Life Technologies或Gibco BRL), New England BioLabs (BioLabs) 或其它公司。

 
    b. 限制酶的貯存與取用: 反復(fù)解凍與凍結(jié)是任何酵素的大忌,因此不可存放于無霜冰箱中。大部份限制酶購買來時即保存在50% glycerol中,存放在 -20℃時不會凍結(jié)。 有些限制酶相當(dāng)不穩(wěn)定,必須存放在 -70℃,請避免大量購買,也請對你所用的各種限制酶的性質(zhì)作深入的了解。 自冰箱取出限制酶請立即放入 -20℃冷凍盒或冰浴中,短暫離心 (4℃) 將管壁上或蓋上的酵素離心下后再取用。添加不同限制酶必須更換微量移液器頭,不可污染。請一次取出需要量,置于微量離心管中,再分別加入各反應(yīng)中;取用后請立即放回冰箱。
 
    c. Isoschizomers: 有些不同的限制酶可以作用在相同的DNA 序列上,這些酵素互稱為isoschizomers。 例如︰SstI 與SacI;HincII 與HindII;EspI 與Bpu1102I。相關(guān)的資料均可由工具書或各廠商目錄查到。
 
    d. 限制酶的反應(yīng)條件: 每一廠商生產(chǎn)的限制酶均附有zui適用的10 倍濃度反應(yīng)液 (10×Rx Buf),但必須注意,同一種限制酶若來自不同廠商,其Rx Buf及反應(yīng)溫度可能不同,故使用前請務(wù)必參考其說明書或廠商目錄,廠商目錄中都會表列出各種限制酶在不同Rx Buf反應(yīng)效率。 使用兩種以上的限制酶進(jìn)行切割時,可依照該表選擇適當(dāng)?shù)腞x Buf,并遵循以下幾點(diǎn)原則:
    1. 若各種限制酶所用的Rx Buf 相同,則可同時加入反應(yīng)液中,但須注意glycerol 的zui終濃度不可超過10%,有些酵素對glycerol 濃度的限制更嚴(yán)格,不可超過5%。
    2. 若各種限制酶所用的Rx Buf不同,但差異僅在鹽的濃度時,可先加入需鹽濃度較低者,反應(yīng)*后直接加入NaCl, KCl, MgCl2 等調(diào)整鹽濃度,再加入第二種酵素。
    3. 若各種限制酶所用的Rx Buf *不同時,則以任一種酵素作用*后,先經(jīng)drop dialysis 更換溶液或以酒精沉淀DNA 后,再以另一種酵素作用。
 
    e. 限制酶使用量與反應(yīng)時間: 一單位的限制酶活性通常定義為,在zui適反應(yīng)溫度與條件下,能使1 μg 基質(zhì)DNA 在1 h 被切割*所需的酵素量。通常可加入較多量的酵素或把反應(yīng)時間加長,但有些酵素不穩(wěn)定,反應(yīng)時間加長并不具意義。加入的酵素量需考慮甘油的zui終濃度。以避免甘油濃度太高造成對酵素活性的抑制或改變其作用。
 
    f. 中止反應(yīng): 一般限制酶可以65℃加熱15 min中止反應(yīng),但有些酵素具熱安定性,則可加入EDTA (zui終濃度為10 mM) 或以phenol處理。
 
    g. 限制酶無法作用時:當(dāng)樣品DNA 無法被切割時,請努力回想或檢查:
    1. DNA 是否含有高鹽?
    2. DNA 是否含有雜質(zhì)?
    3. Phenol 或酒精是否去除干凈?
    4. 酵素是否貯存不當(dāng)而失去活性?
    5. 酵素量或Rx Buf 是否加入過多?
    6. 反應(yīng)溫度太高或太低?
    7. 酵素是否無法作用methylated DNA?

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