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人類基因組研究--大片段外源DNA克隆體系
閱讀:442 發(fā)布時(shí)間:2011-1-25(1)酵母人工染色體克隆體系(YAC)
這種克隆體系是20世紀(jì)80年代末發(fā)展起來的,并于1990年底漸趨完善的大片段外源DNA克隆體系。插入YAC載體的外源DNA片段可達(dá)
(2)黏??寺?,n噬菌體和細(xì)菌人工染色體
黏??寺〉某霈F(xiàn)早于YAC,其主要特點(diǎn)是插入的外源片段比入噬菌體DNA大得多。因此在篩選基因文庫(kù)時(shí)可以減少一半工作量。P1噬菌體的溶源狀態(tài)奇特,不整合到宿主的染色體上,像質(zhì)粒一樣作為一個(gè)自主復(fù)制單位游離于宿主染色體以外??梢杂糜诳寺?span lang="EN-US">75—110kb的外源DNA片段。電穿孔技術(shù)的發(fā)展為提高大質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化效率創(chuàng)造了條件,已經(jīng)可以構(gòu)建和轉(zhuǎn)化幾十到幾百kb的細(xì)菌人工染色體克隆(BAC)。
(3)構(gòu)建重疊度zui低的連續(xù)克隆系
構(gòu)建能覆蓋每條人類染色體而重疊度又zui小的連續(xù)克隆系,是進(jìn)行大規(guī)模基因組DNA測(cè)序的基本條件。由于這一做法很花時(shí)間,當(dāng)測(cè)序中心將大規(guī)模測(cè)序計(jì)劃上升至每年75Mb或更多時(shí),連續(xù)克隆系的構(gòu)建速度可能跟不上測(cè)序產(chǎn)出的速度。1996年,有人提議對(duì)高覆蓋率的BAC文庫(kù)的克隆進(jìn)行末端測(cè)序,形成順序標(biāo)簽接頭(sequencetaggedconnector,STC),利用STC與克隆間的對(duì)應(yīng)關(guān)系,可以在計(jì)算機(jī)上快速地發(fā)現(xiàn)局部連續(xù)克隆系。