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技術(shù)文章

院士研究組文章公布蛋白質(zhì)組新技術(shù)

閱讀:731          發(fā)布時(shí)間:2011-9-2

摘要: 來(lái)自中科院大連化學(xué)物理研究所,第二軍醫(yī)大學(xué)等處的研究人員發(fā)展了基于糖蛋白固載的無(wú)標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),并應(yīng)用于肝癌臨床診斷標(biāo)志物的初步篩選中,發(fā)現(xiàn)了一系列在肝癌血清中異常表達(dá)的糖基化蛋白。這一研究成果公布在蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域刊物Molecular & Cellular Proteomics上。

生物通報(bào)道:來(lái)自中科院大連化學(xué)物理研究所,第二軍醫(yī)大學(xué)等處的研究人員發(fā)展了基于糖蛋白固載的無(wú)標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),并應(yīng)用于肝癌臨床診斷標(biāo)志物的初步篩選中,發(fā)現(xiàn)了一系列在肝癌血清中異常表達(dá)的糖基化蛋白。這一研究成果公布在蛋白質(zhì)組學(xué)領(lǐng)域刊物Molecular & Cellular Proteomics上。

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這項(xiàng)研究由第二軍醫(yī)大學(xué)王紅陽(yáng)院士研究組,與中科院大連化學(xué)物理研究所鄒漢法研究組合作完成,其中王紅陽(yáng)院士早年畢業(yè)于第二軍醫(yī)大學(xué),是教育部“長(zhǎng)江學(xué)者獎(jiǎng)勵(lì)計(jì)劃”特聘教授,中國(guó)工程院院士。長(zhǎng)期從事腫瘤的基礎(chǔ)與臨床研究,對(duì)腫瘤的跨膜信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、肝癌新分子標(biāo)志物鑒定及應(yīng)用、酪氨酸磷酸酶的網(wǎng)絡(luò)調(diào)控研究等有重要建樹。

蛋白質(zhì)糖基化是目前已知的zui為復(fù)雜的翻譯后修飾之一,與癌癥的發(fā)生密切相關(guān),目前已知的診斷標(biāo)志物都是糖基化蛋白質(zhì)。然而,由于糖基化位點(diǎn)存在微觀不均一性,傳統(tǒng)的基于糖肽的定量方法不能準(zhǔn)確的反映生物樣品中糖基化蛋白的表達(dá)水平。

在這篇文章中,研究人員發(fā)展了新型的基于非糖肽的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),較好地解決了高通量糖基化蛋白定量中的準(zhǔn)確性和可靠性問(wèn)題,并將這一方法運(yùn)用于肝癌臨床診斷差異表達(dá)定量蛋白質(zhì)組學(xué)分析中,發(fā)現(xiàn)了一系列在肝癌血清中異常表達(dá)的糖基化蛋白,采用傳統(tǒng)的基于抗體的ELISA方法對(duì)其中的3個(gè)糖蛋白質(zhì)進(jìn)行大樣本量(50-100個(gè)臨床樣品)的驗(yàn)證,進(jìn)一步證明了所發(fā)展的方法對(duì)糖蛋白質(zhì)組學(xué)定量分析的可靠性。這一方法的發(fā)展不僅為疾病蛋白質(zhì)組學(xué)的研究提供了新的技術(shù)途徑,而且也篩選出一系列可供臨床驗(yàn)證的差異糖基化蛋白質(zhì)。

除此之外,近期來(lái)自斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院等處的研究人員還利用一種高精度蛋白質(zhì)組學(xué),識(shí)別出了與Jourbert綜合癥(Joubert syndrome, JS)等疾病相關(guān)的基因。這一發(fā)現(xiàn)增加了人們對(duì)JS這種病的進(jìn)一步認(rèn)識(shí)和了解。這種基因的發(fā)現(xiàn)讓研究人員進(jìn)一步了解大腦、視網(wǎng)膜和腎臟的發(fā)育,更好地了解正常和異常的大腦并zui終找到治療相關(guān)疾病的有效方法。

注:

無(wú)標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)

目前,蛋白質(zhì)組研究的實(shí)驗(yàn)技術(shù)流程一般為樣品(蛋白混合物) 經(jīng)二維凝膠電泳,染色,膠上蛋白酶切,進(jìn)入質(zhì)譜鑒定;或樣品(蛋白混合物) 直接經(jīng)酶切,色譜分離,進(jìn)入質(zhì)譜進(jìn)行鑒定。在二維凝膠電泳的實(shí)驗(yàn)中,可以通過(guò)比較染色后的2 張2DE-gel 圖像中蛋白點(diǎn)的光密度值進(jìn)行差異定量,或比較同種蛋白經(jīng)同位素標(biāo)記和未經(jīng)標(biāo)記的串聯(lián)質(zhì)譜峰面積進(jìn)行差異定量。 但這2 種常用技術(shù)由于在樣品處理上費(fèi)時(shí)費(fèi)力,不利于大規(guī)模的蛋白質(zhì)組定量。因此,興起了無(wú)標(biāo)記的質(zhì)譜定量方法,這種方法只需分析大規(guī)模鑒定蛋白時(shí)所產(chǎn)生的質(zhì)譜數(shù)據(jù), 用蛋白相應(yīng)肽段的質(zhì)譜數(shù)據(jù)進(jìn)行定量。

非標(biāo)記定量技術(shù)在定量蛋白質(zhì)組學(xué)研究中受到了眾多科學(xué)工作者的推崇。目前,已經(jīng)有一系列配套的非標(biāo)記定量分析軟件,其中包括的GE公司開(kāi)發(fā)的DeCyder MSTM商業(yè)化軟件,實(shí)踐證明其具有很好的定量準(zhǔn)確性和可信性。 (生物通:萬(wàn)紋)

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