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WB實(shí)驗(yàn)過(guò)程中常見(jiàn)條帶問(wèn)題分析解決方法
一、除了目的蛋白條帶外有很多條雜帶
1. 一抗抗體差異,部分不常見(jiàn)的分子抗體是多克隆的,雜帶比較多。
2.一抗4℃孵育過(guò)夜時(shí),如果一抗的孵育濃度較高,也容易出現(xiàn)雜帶。 一般可按抗體說(shuō)明書(shū)來(lái)設(shè)定稀釋濃度。
3.二抗孵育時(shí)間過(guò)長(zhǎng)或者二抗?jié)舛冗^(guò)高也會(huì)導(dǎo)致雜帶增多。一般二抗規(guī)定的孵育時(shí)間為室溫1-2小時(shí), 一般1小時(shí)足矣, 時(shí)間過(guò)長(zhǎng)易出現(xiàn)非特異性條帶; 二抗一般1:10000稀釋。
4.一抗與二抗之間TBST洗膜時(shí)間較短,次數(shù)較少,常規(guī)應(yīng)該洗三次,一次10min。
5.在封閉, 或是一抗二抗孵育的這種wb中比較關(guān)鍵的步驟都會(huì)用到TBST,其配方中比較關(guān)鍵的是Tween-20,是一種非離子型表面活性劑,對(duì)抗原抗體蛋白有保護(hù)作用, 也可以減少抗體對(duì)抗原的非特異性作用, 用于洗脫未結(jié)合的抗體,減少非特異性結(jié)合, 一般用量是1ml/L。
6.一般的抗體只能識(shí)別抗原蛋白中的線性序列結(jié)構(gòu)表位即一級(jí)結(jié)構(gòu),煮蛋白目的為打開(kāi)折疊的空間結(jié)構(gòu), 緩沖液中含有的SDS可斷裂蛋白分子內(nèi)和分子間的氫鍵, 使分子去折疊, 破壞蛋白質(zhì)分子的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu),若煮蛋白時(shí)間較短, 或者loading buffer有問(wèn)題, 都會(huì)影響抗原抗體結(jié)合, 影響最后的顯影結(jié)果。對(duì)于容易形成多聚體的蛋白,可以延長(zhǎng)煮樣時(shí)間, 99℃10min。
7.有時(shí)候目的蛋白在所測(cè)蛋白樣品中是低表達(dá)蛋白,顯影后重影也較多。
8. 體內(nèi)表達(dá)的蛋白具有很多種修飾形式, 如甲基化、乙?;?、磷酸化等, 會(huì)影響結(jié)果,可以參考抗體網(wǎng)站信息及查閱文獻(xiàn)來(lái)解決。
9. 蛋白樣本降解, 也會(huì)造成雜帶過(guò)多(比原來(lái)位置低的地方出現(xiàn)主帶, 也會(huì)出現(xiàn)一些其他的帶, 所有的條帶都比正常的低且模糊不清),排除此種原因需注意在冰上裂解蛋白, 時(shí)間不要太長(zhǎng), 裂解液中加入蛋白酶抑制劑, 定量后及時(shí)煮樣, 使其穩(wěn)定,并保存于-20℃中,煮好的樣品盡量減少在室溫中的時(shí)間。
二、WB條帶背景有黑點(diǎn)點(diǎn)
脫脂牛奶封閉時(shí),脫脂奶粉顆粒未完全溶解。
三、WB條帶顯影無(wú)條帶
1.比較簡(jiǎn)單的原因可能是目的蛋白所出現(xiàn)的分子量位置與說(shuō)明書(shū)介紹的分子量位置差距較遠(yuǎn), 切膠時(shí)切掉了, 在第一次跑某目的蛋白時(shí), 可采取整膜轉(zhuǎn),看一下能否跑出條帶。當(dāng)然蛋白分子量偏高或偏低也有可能是因?yàn)檫x擇的膠的濃度與目的蛋白的濃度不對(duì)應(yīng)所致。
2.一抗的濃度較低, 可適當(dāng)增加一抗抗體濃度,或者更換效價(jià)比較高的一抗。一抗孵育的時(shí)間可適當(dāng)延長(zhǎng), 注意不要太長(zhǎng), 一抗蒸發(fā)會(huì)干膜。在實(shí)際操作中, 如果用透明封口袋封膜, 最后孵一抗的效果會(huì)比用孵育盒強(qiáng), 因?yàn)榧瓤梢詼p少一抗的用量, 又可以防止膜在抗體表面漂浮, 孵育不充分, 但是要注意用封口袋封膜時(shí), 排盡氣泡, 切不要一次封太多張膜, 膜重疊在一起也會(huì)導(dǎo)致孵育不充分。同時(shí)也要注意一抗保存要得當(dāng),否則效價(jià)會(huì)降低。
3. 當(dāng)所測(cè)蛋白樣品中目的蛋白的含量很低時(shí), 也會(huì)出現(xiàn)無(wú)條帶, 注意增加上樣量, 設(shè)置好陽(yáng)性對(duì)照以利于結(jié)果分析, 提蛋白時(shí)也要注意操作時(shí)間, 冰上操作,在裂解液中加蛋白酶抑制劑,提的細(xì)胞或者組織樣品越新鮮越好。
4.轉(zhuǎn)膜問(wèn)題。轉(zhuǎn)膜的時(shí)間和電壓或者電流強(qiáng)度要依據(jù)目的蛋白的分子量來(lái)設(shè)定。時(shí)間過(guò)短, 電壓過(guò)低, 沒(méi)轉(zhuǎn)上或是時(shí)間過(guò)長(zhǎng), 電壓過(guò)高轉(zhuǎn)過(guò)了, 都會(huì)影響最后的結(jié)果??梢宰鲱A(yù)實(shí)驗(yàn)或者根據(jù)前輩的經(jīng)驗(yàn)來(lái)設(shè)定轉(zhuǎn)膜條件。當(dāng)目的蛋白分子量過(guò)小時(shí)(10KDa),可以選擇兩張膜疊在一起轉(zhuǎn),選用小孔徑的膜,縮短轉(zhuǎn)膜時(shí)間。當(dāng)然, 轉(zhuǎn)膜時(shí)電極插反或者膜和膠在轉(zhuǎn)膜夾的位置擺放不正確,或者轉(zhuǎn)膜夾與轉(zhuǎn)膜芯方向不對(duì),膜轉(zhuǎn)反了會(huì)直接導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)失敗。
5.洗膜時(shí)時(shí)間過(guò)長(zhǎng)次數(shù)過(guò)多也會(huì)影響結(jié)果。
6. 發(fā)光液失效, 發(fā)光液過(guò)期或者未注意避光, 記得現(xiàn)配現(xiàn)用, 若樣品中目的蛋白表達(dá)量較低,可適當(dāng)延長(zhǎng)顯影時(shí)間。
7. Tween-20濃度過(guò)高時(shí), 也會(huì)干擾抗體相互作用, 洗去PVDF膜上的目的蛋白。
8.最不應(yīng)該犯的錯(cuò)誤是一抗和二抗種屬不搭配。
四、WB條帶有邊緣規(guī)則白點(diǎn)
1. 轉(zhuǎn)膜時(shí)PVDF膜與膠之間氣泡未趕凈。轉(zhuǎn)膜過(guò)程要盡量去除氣泡, 使膜、濾紙和膠緊密結(jié)合。
2.用封口袋孵一抗時(shí),未除凈氣泡。
五、顯影后膠片背景太高
1. 洗膜不充分。
2. 二抗?jié)舛冗^(guò)高,降低二抗?jié)舛取?/span>
3. 一抗特異性不強(qiáng)。
4. 曝光時(shí)間過(guò)長(zhǎng),適當(dāng)減少顯影時(shí)間。
5. 封閉不充分,延長(zhǎng)封閉時(shí)間或者更換封閉液。
六、WB條帶歪斜
1. 最可能出現(xiàn)的問(wèn)題是凝膠制備的問(wèn)題, 灌膠時(shí)膠不平整。例如APS與TEMED加的量過(guò)多, 凝膠凝固速度過(guò)快。加完各組成成分后沒(méi)有很好地混勻, 濃度不一。灌膠后用醇類(lèi)壓膠效果好于蒸餾水, 用蒸餾水壓膠后, 可輕微上下磕桌面,減小水的表面張力。在平整的桌面上配膠。配膠時(shí)室內(nèi)溫度也很重要,太低凝固時(shí)間較長(zhǎng), 分離膠漏的較多, 膠面較低, 蛋白不能充分分離。室內(nèi)溫度過(guò)高膠凝固時(shí)間過(guò)快, 不易平整。拔梳子時(shí)要左右手用力均勻, 速度不要太快, 否則上樣孔扭曲。每個(gè)孔上樣量要一致。另外, 如果配置好的膠板有氣泡或者配膠時(shí)用的水有雜質(zhì)等不溶性顆粒,也會(huì)影響跑膠, 導(dǎo)致條帶扭曲。
2.轉(zhuǎn)膜夾老舊,海綿變薄,三明治結(jié)構(gòu)不緊湊。
3.如果整個(gè)泳道左右歪曲, 可能是上樣時(shí)多余的膠孔沒(méi)有用空的loading buffer補(bǔ)齊。
4.電泳時(shí)玻璃板未夾緊漏液,電壓不穩(wěn),溴酚藍(lán)的線在膠上有可見(jiàn)扭曲。
七、條帶中央?yún)^(qū)發(fā)白
上樣過(guò)多,導(dǎo)致信號(hào)瞬間淬滅。
八、左右孔道條帶粘連
1.上樣量過(guò)多,或者分離膠與濃縮膠間有空隙。
2.由于電泳完成后沒(méi)有及時(shí)轉(zhuǎn)膜,樣品彌散。
九、顯影時(shí)出現(xiàn)不均一的背景
在一抗、二抗、封閉、或者洗膜時(shí)可能出現(xiàn)了干膜。
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