泵，對于液相色譜來說就像人體的心臟一樣，是液相色譜的核心部件。泵分為：單元泵，二元泵和四元泵。

單元泵包括一個(gè)泵組件和一個(gè)阻尼器。泵組件含有兩個(gè)大部分相同的活塞泵單元。兩個(gè)泵單元均由一個(gè)滾珠絲杠驅(qū)動(dòng)器和一個(gè)帶有一個(gè)藍(lán)寶石活塞的泵頭組成，藍(lán)寶石活塞在里面作往復(fù)運(yùn)動(dòng)。用一個(gè)伺服-控制可變磁阻電機(jī)從兩個(gè)相反的方向來驅(qū)動(dòng)兩個(gè)滾珠絲杠驅(qū)動(dòng)器。滾珠絲杠驅(qū)動(dòng)器的齒輪有不同的周長（比例為2:1），使第一個(gè)活塞運(yùn)動(dòng)速度為第二個(gè)活塞的兩倍。溶劑從泵頭的最底部進(jìn)入，從泵頭的頂部離開。活塞的外徑比泵腔的內(nèi)徑要小一些，這樣可以讓溶劑充滿二者之間的間隙。根據(jù)流速的不同，第一個(gè)活塞的沖程體積為20-100 μL之間。微處理器可以控制所有流速在1μL-10 mL/min范圍內(nèi)。液體從流動(dòng)相瓶流到入口主動(dòng)閥，第一個(gè)泵單元的入口和入口主動(dòng)閥相連，該入口主動(dòng)閥的啟閉受處理器的控制，從而允許溶劑被吸入到第一個(gè)活塞泵單元。

二元泵包含兩個(gè)相同的泵，這兩個(gè)泵集成在一個(gè)腔體內(nèi)，它通過高壓混合來產(chǎn)生梯度。每個(gè)通道由一個(gè)泵組件組成，包括泵驅(qū)動(dòng)器、泵頭、帶有可更換濾芯的主動(dòng)輸入閥和輸出閥。兩個(gè)通道在一個(gè)低容積混合腔中連接，混合腔通過毛細(xì)管連接到緩沖單元（阻尼器）和混合器上。帶有 PTFE 過濾芯的沖洗閥裝在泵的出口處，便于向泵頭灌注流體。

四元泵包括一個(gè)真空脫氣機(jī)和一個(gè)四通道梯度泵。四通道的梯度泵包括一個(gè)高速配量閥(也稱為：多通道梯度閥，英文為MCGV)和一個(gè)泵組件。在使用四元泵是需要注意的是：當(dāng)鹽溶液和有機(jī)溶劑混合時(shí)，鹽溶液可能與有機(jī)溶劑完全混溶，而不會出現(xiàn)沉淀。但是在梯度閥的混合點(diǎn)、在兩種溶劑的邊界處，可能出現(xiàn)微量沉淀。重力作用使鹽顆粒沉淀下來。通常，閥的A通道用于含水/鹽溶液，而泵的B通道用于有機(jī)溶劑。如果使用的是這樣的配置，鹽將落回到鹽溶液中并被溶解。當(dāng)泵使用的不同配置（例如，D -鹽溶液，A -有機(jī)溶劑）時(shí)，鹽可能會落到有機(jī)溶劑的端口中，從而導(dǎo)致性能問題。