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單細(xì)胞水平的miRNA表達(dá)譜分析

Fluidigm在C1系統(tǒng)上實(shí)現(xiàn)的第三個(gè)單細(xì)胞基因組學(xué)應(yīng)用。之前，它推出了單細(xì)胞mRNA測(cè)序和單細(xì)胞基因表達(dá)分析。C1系統(tǒng)在去年上市，基于Fluidigm創(chuàng)新的微流體技術(shù)，能夠讓研究人員快速可靠地分離單個(gè)細(xì)胞并進(jìn)行基因組分析。生物通 www.ebiotrade.com 
microRNA（miRNA）這個(gè)小小的非編碼RNA分子，行使著重要的調(diào)控功能。研究表明，miRNA可調(diào)控?cái)?shù)千個(gè)蛋白編碼基因，從而參與了多個(gè)生物學(xué)過(guò)程，包括分化、發(fā)育和細(xì)胞周期管理。miRNA還與許多常見病存在關(guān)聯(lián)，如癌癥和心血管疾病。
研究人員都希望揭開miRNA的更多秘密，然而，miRNA表達(dá)譜分析也存在兩方面的挑戰(zhàn)。首先，單個(gè)miRNA可靶定多個(gè)mRNA靶點(diǎn)，從而調(diào)控多個(gè)生物學(xué)系統(tǒng)。這種生物學(xué)現(xiàn)象是細(xì)胞間差異的一個(gè)促進(jìn)因素，讓miRNA靶點(diǎn)的解釋變得困難。在單細(xì)胞水平研究miRNA的表達(dá)讓研究人員可測(cè)定同一群體中某些細(xì)胞所發(fā)生的快速、動(dòng)態(tài)變化。其次，傳統(tǒng)的芯片分析費(fèi)時(shí)費(fèi)力，靈敏度不高，且內(nèi)容不夠靈活。而定量PCR雖提供了比芯片更高的靈敏度，但在大規(guī)模研究時(shí)成本高、時(shí)間長(zhǎng)。生物通 www.ebiotrade.com 
如今有了C1系統(tǒng)和miRNA表達(dá)譜分析方案，研究人員可在不到24小時(shí)的時(shí)間內(nèi)，平行處理96個(gè)單細(xì)胞，在一張GE 96.96芯片對(duì)每個(gè)單細(xì)胞分別檢測(cè)多達(dá)96種miRNA。配套的SINGuLAR™ 2.0分析軟件可以對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行非監(jiān)督式聚類分析及PCA分析，有效地根據(jù)miRNA表達(dá)類型在單細(xì)胞水平揭示細(xì)胞群體的異質(zhì)性，為研究miRNA調(diào)控提供更多數(shù)據(jù)。
C1單細(xì)胞全自動(dòng)制備系統(tǒng)是*zui先推出的全自動(dòng)單細(xì)胞分離和制備系統(tǒng)。C1系統(tǒng)為每次運(yùn)行處理96個(gè)單細(xì)胞提供了簡(jiǎn)單輕松、高度重復(fù)的流程，而手工操作所需的時(shí)間極少。它地讓分離細(xì)胞、提取、逆轉(zhuǎn)錄和擴(kuò)增過(guò)程實(shí)現(xiàn)全面自動(dòng)化，使細(xì)胞活性的檢測(cè)和分析成為可能，并減少了多平臺(tái)技術(shù)錯(cuò)誤所引起的可變性。單細(xì)胞水平的miRNA表達(dá)譜分析