詳細介紹
本頁描述的產(chǎn)品僅供科學實驗研究使用,不用于臨床,非醫(yī)療器械,不做其他用途。
產(chǎn)品編號:HL20024.2.1
名稱:基因甲基化特異性PCR擴增(MSP)試劑盒
規(guī)格:60次
價格:客服
技術背景
在基因的啟動子區(qū)域(promotor region)通常存在一些富含重復雙核苷酸“”的區(qū)域,稱為“島”( island)。在人類基因組內,存在有近3萬個島。這些島不僅是基因的一種標志,而且還參與基因表達的調控和影響染色質的結構,更是DNA甲基化的*位置。島甲基化形態(tài)的掃描分析是基因表達和表觀基因組學的主要課題。
產(chǎn)品內容
擴增液(Reagent A) 微升
補充液(Reagent B) 毫升
產(chǎn)品說明書 1份
保存方式
保存在-20℃冰箱里;有效保證6月
用戶自備
轉化樣品:經(jīng)過亞硫酸鹽轉化的目標DNA分子
特異引物:用于甲基化基因擴增的引導DNA分子
PCR儀:用于樣品擴增
PCR管或平板:用于PCR反應的容器
實驗步驟
實驗開始前,從-20℃冰箱中取出試劑,放進冰槽里融化。然后進行下列操作:
- 針對一個樣本,每次移出xx微升擴增液(Reagent A)到PCR管
- 加入1微升用戶自備的的轉化或野生型DNA樣品(總量100納克)
- 分別加入1微升用戶自備的甲基化特異性的引物F和引物R(各350納克或25微摩爾)
- 再加入xx微升補充液(Reagent B)(反應總量為25微升)
- 即刻放進微型臺式離心機瞬時離心5秒,速度為500g(或2000RPM;例如eppendorf 5415)
- 加入50微升PCR級礦物油(注意:參見注意事項10)
- 即刻進行熱啟動PCR反應:
溫度(℃) | 時間 | 循環(huán) |
95 | 9分鐘 | 1 |
95 Tm 72 | 30秒 30秒 30秒 |
35 |
72 | 5分鐘 | 1 |
- 反應完畢后,移取5微升進行1.8%瓊脂糖凝膠電泳或15%聚丙烯酰胺凝膠
- 如果進行測序鑒定,膠回收PCR產(chǎn)物(建議使用高質純化一步法膠回收試劑盒;HL20051.1)
- 分別移出2微升反應液到2個不同的新的1.5毫升離心管(每微升100納克)
- 加入1微升用戶自備的甲基化特異性的巢式引物F(每微升350納克)到其中一個1.5毫升離心管,作好標記
- 加入1微升用戶自備的甲基化特異性的巢式引物R(每微升350納克)到另一個1.5毫升離心管,作好標記
- 進行后續(xù)的直接測序反應
注意事項
- 本產(chǎn)品為60次操作
- 操作時,須戴手套
- 建議使用帶濾芯的槍頭,避免污染
- 轉化后的DNA樣本須保存在-20℃冰箱里,否則容易降解;同時盡快進行擴增等后續(xù)操作
- 一個特定基因的甲基化檢測通常包括轉化、PCR和直接測序三步。PCR用于篩選和定位,可以發(fā)現(xiàn)0.1%甲基化;測序是準確定位,是分析金標準
- 一個特定基因的甲基化特異性PCR通常包括三組PCR:
- 甲基化特異性PCR的引物設計原則:引物以SENSE的DNA鏈為模板;引物含有足夠多的C(后面不和G相連);引物含有1-3個位點;位點須在3端;PCR片段長度在80-250堿基;三組引物取自同一位點,通過長度變化獲得相同的Tm,并在電泳上有所區(qū)別。
- 直接測序的引物設計原則是:引物不能含有位點;引物含有足夠多的C(不和G相連);采用巢式引物
- 基因甲基化區(qū)域選擇原則:如果是一個*檢測的基因,首先,選擇啟動子部位;第二,選擇足夠多的位點;第三、
- 通過1.8%瓊脂糖凝膠或15%聚丙烯酰胺凝膠電泳來檢測PCR擴增后的結果。假如DNA樣品在修飾前是未甲基化的,那么僅僅“U”Primers將產(chǎn)生擴增產(chǎn)物;相反,已甲基化的DNA樣品僅僅用“M”Primer能被擴增
- 組織樣品或雜合子樣品常常出現(xiàn)“U”和“M”同時呈現(xiàn)陽性;建議使用基因甲基化程度定量分析試劑盒(HL20024.3)予以分析
- 根據(jù)用戶PCR儀的性能,決定是否加入礦物油(Mineral Oil)
- 建議使用軟件測算Tm溫度;在-20℃冰箱里儲存的產(chǎn)品避免反復凍融
- 本公司提供甲基化特異性引物設計服務
- 本公司同時提供數(shù)字化表觀基因組*分析(全部甲基化基因)技術試劑盒和外包服務(HL90002)
- 本公司提供系列甲基化分析試劑產(chǎn)品
質量標準
- 本產(chǎn)品經(jīng)鑒定性能穩(wěn)定
- 本產(chǎn)品經(jīng)鑒定轉化保證
- 本產(chǎn)品經(jīng)鑒定無核酶污染
- 本產(chǎn)品經(jīng)鑒定反應產(chǎn)量高