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2022年6月，北京協(xié)和醫(yī)院國家婦產疾病臨床研究中心和內分泌科研究組發(fā)表了以《光學基因組圖譜技術在染色體結構變異檢出的效能及初步應用評估》為題的中文文章，該研究納入了10例染色體核型檢出異常的樣本，在9例樣本中檢出結構變異，其中3例為非平衡性結構變異，6例為平衡性結構變異，包括5例易位和1例臂內倒位，檢測結果與核型、芯片等技術一致，并能精細化斷裂點位置、確定重復或插入的片段方向。另有 1 例斷裂和重接位點位于著絲粒的易位樣本未被檢出。

OGM檢測非平衡結構變異
其中前3例為非平衡的結構變異，OGM檢測到了易位和拷貝數缺失或增加的斷裂點及額外的拷貝的插入方向，圖1展示了樣本1非平衡性易位 t （7；X）（p14.1；p11.3）在OGM可視化軟件Bionano Access的結果視圖。樣本2由核型結果可見顯示16q22區(qū)帶處附加了未知來源的片段。CNVseq 顯示該樣本在15q14q21.3 區(qū)段存在 17.3 Mb 片段重復（表 2），為致病性變異。OGM檢測到15號染色體40，044，538-57，297，589片段拷貝數為3，且發(fā)現(xiàn)該片段反向插入至16號染色體長臂，其中 Chr15 斷裂點 57，297，589-57，303，241 bp 插入到Chr16：75， 399， 363-75， 405， 350 bp 之 間 ，形 成CFDP1TCF12（MIM：615314）融合基因，另一個 Chr15 斷裂點 40，034，290-40，044，538 bp 插 入 Chr16：75，399，363-75，405，350 bp 之 間 ，形 成 FSIP1-CFDP1 融合基因（表2）。

OGM檢測平衡結構變異
樣本 4~10均表型正常，因反復流產或多次不良孕產史行遺傳學診斷。限于核型的分辨率，易位片段低于 5~10 Mb 的隱匿型平衡易位易被漏檢。在本研究中，多個樣本的易位片段小于 10 Mb，如樣本5，7 號染色體長臂末端易位片段為 4.5 Mb；樣本 8，16 號染色體短臂末端易位片段僅有499 kb。OGM技術以高靈敏度檢測到了隱匿型平衡易位的檢出有助于不明原因反復流產或不孕患者的遺傳診斷。樣本4和樣本6的OGM結果展示見圖2和圖3。

OGM檢測技術優(yōu)勢
如下表1對比了OGM技術、染色體核型、FISH、SNP array, CNV-seq技術在血液樣本檢測中的優(yōu)劣勢，OGM檢測無需細胞培養(yǎng)，可以>500bp分辨率檢測全基因組范圍內檢測結構變異和拷貝數變化?？偨Y來說，OGM檢測結構變異和拷貝數變化具有如下優(yōu)勢：（1）直觀檢測平衡性和非平衡性結構異常，并確定變異片段位置和方向；（2）精細化斷裂點位置及斷裂位點是否累及基因，并發(fā)現(xiàn)融合基因；（3）高分辨率發(fā)現(xiàn)隱匿型平衡易位：

結論
光學基因組圖譜技術（OGM）作為一種新型分子檢測技術，不僅能夠發(fā)現(xiàn)拷貝數變異等非平衡性結 構變異以及易位、倒位等平衡性結構變異，更重要的是能夠精細化斷裂點位置以及確定重復或插入片 段的方向，有助于遺傳病的診斷，預防出生缺陷的發(fā)生。但目前該技術還無法檢測斷裂點位于著絲粒等參考基因組(GRCh37或GRCh38)空白區(qū)域的平衡性結構變異。