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小海龜數(shù)字PCR應(yīng)用于胃癌的潛在診斷生物標(biāo)志物篩查

閱讀:357        發(fā)布時(shí)間:2023-10-24

數(shù)字PCR(dPCR)是一種核酸絕對(duì)定量的技術(shù),與傳統(tǒng)的熒光定量PCR技術(shù)(qPCR)相比,dPCR擁有可以精確到單個(gè)核酸分子的高精準(zhǔn)度、適合復(fù)雜樣本的高便捷度、且無(wú)需標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)或參照基因進(jìn)行對(duì)比分析等特點(diǎn)。因此,高靈敏度、絕對(duì)定量、高穩(wěn)定性和更高的抗干擾能力成為數(shù)字PCR的4大優(yōu)勢(shì)。

作為最常見(jiàn)的腫瘤之一,胃癌(GC)具有高死亡率,因?yàn)楫?dāng)前的檢查方法不能實(shí)現(xiàn)早期診斷。核粒梭菌(Fn)主要定居在口腔中,據(jù)報(bào)道與胃腸道腫瘤的發(fā)展有關(guān)。迄今為止,關(guān)于唾液Fn和胃癌之間的關(guān)系知之甚少。該篇來(lái)自山東大學(xué)齊魯醫(yī)院文章確定唾液Fn能否作為診斷胃癌的生物標(biāo)志物,并探討Fn對(duì)胃癌細(xì)胞的影響。

 

 

實(shí)驗(yàn)方法:通過(guò)液滴數(shù)字聚合酶鏈反應(yīng)對(duì)2019年1月至2020年12月山東大學(xué)齊魯醫(yī)院的120例GC患者、31例wei縮性胃炎(AG)患者、35例非AG (NAG)患者、26例胃息肉(GP)患者和20例正常對(duì)照(NC)的唾液中Fn的豐度進(jìn)行定量。進(jìn)行受試者工作特征(ROC)曲線(xiàn)分析,以評(píng)估Fn以及傳統(tǒng)血清腫瘤標(biāo)志物(包括癌胚抗原(CEA)、糖類(lèi)抗原(CA) 19-9和CA72-4)的診斷價(jià)值。Transwell實(shí)驗(yàn)和傷口愈合實(shí)驗(yàn)評(píng)估Fn感染對(duì)GC細(xì)胞的影響。western blot法檢測(cè)上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)標(biāo)記物的表達(dá)。

 

★實(shí)驗(yàn)流程:

  • 研究人員的樣本收集,120例GC患者、31例wei縮性胃炎(AG)患者、35例非AG (NAG)患者、26例胃息肉(GP)患者和20例正常對(duì)照(NC)的唾液樣本的收集,離心后儲(chǔ)存在-80℃。

  • 使用凱杰QIAamp Blood Mini Kit試劑盒提取200ul唾液樣本中的基因組DNA,濃度用Qubit 3熒光計(jì)測(cè)定。

  • 使用上海小海龜數(shù)字PCR儀進(jìn)行Fn的測(cè)定,設(shè)計(jì)Fn的探針進(jìn)行檢測(cè)。

  • GC細(xì)胞的培養(yǎng),F(xiàn)n的菌株培養(yǎng)

  • 將GC細(xì)胞和Fn的菌株共培養(yǎng),進(jìn)行感染

  • 將感染后的GC細(xì)胞進(jìn)行Transwell分析

  • 傷口愈合實(shí)驗(yàn),感染后的GC細(xì)胞進(jìn)行Transwell分析,感染后用200 μL的移液管jian端進(jìn)行直線(xiàn)刮擦,模擬傷口,隨后,除去培養(yǎng)基和漂浮細(xì)胞,用無(wú)血清培養(yǎng)基代替,并捕獲圖像。細(xì)胞培養(yǎng)48小時(shí)后,再次拍攝圖像。

  • Western blot分析,將感染Fn和未感染Fn的GC細(xì)胞裂解進(jìn)行Western blot分析

 

實(shí)驗(yàn)結(jié)果:核粒梭菌(Fn)是一種牙周致病菌,常見(jiàn)于胃腸道腫瘤組織中。在此,研究發(fā)現(xiàn)胃癌患者唾液Fn水平升高,可作為胃癌診斷的潛在生物標(biāo)志物,其診斷能力優(yōu)于傳統(tǒng)的血清腫瘤標(biāo)志物。研究還發(fā)現(xiàn)唾液Fn水平與胃癌TNM分期和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關(guān)。此外,實(shí)驗(yàn)在試管內(nèi)揭示了Fn通過(guò)促進(jìn)上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化過(guò)程來(lái)促進(jìn)GC細(xì)胞的遷移和侵襲。該發(fā)現(xiàn)表明唾液Fn是診斷胃癌的潛在生物標(biāo)志物。該研究表明唾液中Fn含量可作為診斷胃癌的生物標(biāo)志物,F(xiàn)n感染可通過(guò)加速上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化過(guò)程促進(jìn)胃癌轉(zhuǎn)移。

該篇研究用的是小海龜數(shù)字PCR儀設(shè)備進(jìn)行Fn數(shù)字PCR檢測(cè)。上海小海龜科技有限公司立足于基因檢測(cè)上游儀器、芯片耗材與試劑開(kāi)發(fā)的高新技術(shù)企業(yè),其以微流控芯片技術(shù)為核心,已成功推出BioDigital 青數(shù)字PCR分體機(jī)、以及BioDigital • 炎和SCI Digital系列數(shù)字PCR全自動(dòng)一體機(jī),實(shí)現(xiàn)了基因檢測(cè)與分子診斷前沿技術(shù)領(lǐng)域的重大原始材料科技創(chuàng)新和產(chǎn)業(yè)化突破。

 

BioDigital 青--真正的液滴制備全自動(dòng)PCR

  • china第yi張計(jì)量評(píng)價(jià)證書(shū)

  • 獲得醫(yī)療器械注冊(cè)

  • 兼容超多重技術(shù)

  • 分體機(jī)

 

性能特點(diǎn):

  • 操作簡(jiǎn)單:全封閉自動(dòng)化液滴制備,上樣、制備無(wú)人工操作,設(shè)有4℃樣本保存功能

  • 使用成本低廉:個(gè)位數(shù)芯片成本,支持單樣本開(kāi)機(jī)

  • 平臺(tái)開(kāi)放:可兼容第三方qPCR Mix

  • 高通量:1~96樣,4路熒光

  • 液滴數(shù)量:>2萬(wàn),有效液滴比例:95%以上

  • 有一類(lèi)醫(yī)療器械證,適用于醫(yī)院系統(tǒng)

 

序號(hào)產(chǎn)品類(lèi)碼型號(hào)/規(guī)格產(chǎn)品名稱(chēng)適用范圍
1A00124測(cè)試/盒數(shù)字PCR通用試劑盒適配青系列,用于DNA樣本的檢測(cè)
2A00148測(cè)試/盒數(shù)字PCR通用試劑盒適配青系列,用于DNA樣本的檢測(cè)
3A00224測(cè)試/盒病毒核酸提取試劑盒(磁珠法)用于病毒總核酸樣本提取
4A00324測(cè)試/盒游離DNA提取試劑盒(磁珠法)用于血液中cfDNA提取
5A00424測(cè)試/盒新型guan狀病毒核酸檢測(cè)試劑盒(熒光PCR法)適用于熒光定量PCR儀
6A00524測(cè)試/盒新型guan狀病毒核酸檢測(cè)試劑盒(數(shù)字PCR法)適配青系列
7A00624測(cè)試/盒人EGFR基因T790M突變檢測(cè)試劑盒(dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
8A00724測(cè)試/盒人EGFR基因L858R和19del突變檢測(cè)試劑盒(dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
9A00824測(cè)試/盒人BRAF基因V600E突變檢測(cè)試劑盒(dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
10A00924測(cè)試/盒數(shù)字PCR系統(tǒng)裝機(jī)測(cè)試試劑盒僅用于青裝機(jī)
11A01048測(cè)試/盒逆轉(zhuǎn)錄數(shù)字PCR通用試劑盒適用于青系列,用于RNA樣本一步法檢測(cè)
12A01124測(cè)試/盒人EGFR基因T790M和C797S順?lè)词酵蛔儥z測(cè)試劑盒(dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
13A01224測(cè)試/盒乙型肝炎病毒(HBV)、丙型肝炎病毒(HCV)和人類(lèi)免疫缺陷病毒(HIV)核酸檢測(cè)試劑盒(RT-dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
14A01324測(cè)試/盒人EML4-ALK基因融合突變檢測(cè)試劑盒(RT-dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
15A01424測(cè)試/盒人ROS1基因融合突變檢測(cè)試劑盒(RT-dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
16A01524測(cè)試/盒人免疫缺陷病毒HIV-1核酸檢測(cè)試劑盒(RT-dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
17A01624測(cè)試/盒人NRAS基因突變檢測(cè)試劑盒(dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
18A01724測(cè)試/盒人HER2基因突變檢測(cè)試劑盒(dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
19A01924測(cè)試/盒人BCR-ABL1基因融合突變檢測(cè)試劑盒(RT-dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
20A02024測(cè)試/盒人ABL1基因T315I突變檢測(cè)試劑盒(dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列
21A02124測(cè)試/盒人JAK2基因V617F突變檢測(cè)試劑盒(dPCR-熒光探針?lè)ǎ?/span>適配青系列

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