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腸道微生物與自閉癥相關(guān)性文獻(xiàn)解讀(附微生物研究解決方案)

閱讀:549      發(fā)布時(shí)間:2024-6-27
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微生物組是指一個(gè)特定環(huán)境或生態(tài)系統(tǒng)中全部微生物及其遺傳信息。這些微生物主要括細(xì)菌、古菌、原生動(dòng)物、真菌和病毒等。微生物廣泛分布于我們生活的環(huán)境中,通過復(fù)雜的相互作用表現(xiàn)出生態(tài)系統(tǒng)功能。目前微生物研究非常火熱,主要涉及到海洋、河流、土壤等環(huán)境和個(gè)體的口腔、腸道、皮膚、生殖道等部位的微生物研究。近年來,人體共生微生物和宿主健康、疾病聯(lián)系密切相關(guān),特別是微生物與心腦血管疾病、免疫類疾病、代謝類疾病、抑郁癥、自閉癥、阿爾茲海默癥、腫瘤的關(guān)聯(lián)研究日益火熱。

 

 

今天給大家分享一篇加州理工學(xué)院Gil Sharon等人在《Cell》雜志上發(fā)表的題為《Human Gut Microbiota from Autism Spectrum Disorder Promote Behavioral Symptoms in Mice》的研究性文章,IF:31.398。該研究通過從患有自閉癥兒童和正常兒童的糞便中分離培養(yǎng)功能性細(xì)菌,移植到小鼠腸道中構(gòu)建出具有穩(wěn)定擬人腸道微環(huán)境的動(dòng)物模型,揭示腸道細(xì)菌會(huì)直接促進(jìn)小鼠的自閉癥行為發(fā)生,為治療自閉癥等典型神經(jīng)疾病指明了潛在新方向。

 

 

研究背景:

自閉癥(ASD)表現(xiàn)為復(fù)雜的人類行為改變,包括社會(huì)溝通和刻板印象。除了遺傳的不同外,腸道微生物在正常發(fā)育(TD)和ASD個(gè)體之間也存在差異,但是微生物群是否與癥狀相關(guān)目前還不清楚。

 

研究材料:

 

無菌(GF)雄性和雌性小鼠;自閉癥癥狀小鼠;BTBR T+ tf/J (BTBR)小鼠模型;正常發(fā)育(TD)兒童、自閉癥患者(ASD)兒童糞便。

 

研究技術(shù):

 

16s rDNA分析、非靶代謝組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

 

Highlights

 

1)攜帶人類ASD而非TD的小鼠,其微生物群表現(xiàn)出類似ASD的行為;

2)ASD和TD微生物群在小鼠中產(chǎn)生了不同的代謝組譜;

3)攜帶ASD微生物群的小鼠大腦中風(fēng)險(xiǎn)基因存在廣泛選擇性剪接,而接受5AV或?;撬嶂委煹腂TBR小鼠的重復(fù)和社交行為得到改善。

 

研究結(jié)果

 

1、來自ASD個(gè)體的腸道微生物群足以使小鼠行為改變

 

本研究首先要測(cè)試人類微生物群是否在功能上促進(jìn)了小鼠的ASD行為。選擇人類TD和ASD供者的糞便樣本并移植到GF野生型小鼠腸道中,對(duì)其及其后代進(jìn)行行為學(xué)分析。結(jié)果顯示移植ASD患者糞便的小鼠重復(fù)行為增加,運(yùn)動(dòng)減少,交流減少,表現(xiàn)出明顯的自閉癥癥狀。

 

移植ASD微生物的小鼠可再現(xiàn)人類自閉行為

 

2、TD和ASD移植小鼠不同微生物種群導(dǎo)致了行為的不同

 

對(duì)ASD患者、ASD小鼠及其后代的腸道菌群進(jìn)行系統(tǒng)分析,發(fā)現(xiàn)ASD患者及ASD小鼠的腸道菌群與對(duì)照組均有明顯差異,且這種差異是可以垂直傳遞給子代小鼠。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)特定類型的腸道菌群(Bacteroides、Parabacteroides、Eisenbergiela tayi)是引起ASD的關(guān)鍵。

 

毛縷菌科、擬桿菌科和擬副桿菌科在TD和ASD后代微生物組中含量不同

 

3、ASD微生物群可促進(jìn)大腦中ASD相關(guān)基因的廣泛選擇性剪接

 

社會(huì)行為是由包括前額葉皮層(PFC)和紋狀體(STR)在內(nèi)的多個(gè)大腦區(qū)域介導(dǎo)的,突觸功能障礙和異常的發(fā)育軌跡可能會(huì)導(dǎo)致重復(fù)行為的增加。通過大規(guī)模分析,研究者比較了TD和ASD個(gè)體大腦中表達(dá)的各種基因和非編碼RNA的差異表達(dá),結(jié)果顯示差異表達(dá)的基因較少。深入研究ASD大腦是否表現(xiàn)出選擇性剪接(AS)的差異模式(這是人類ASD大腦中發(fā)現(xiàn)的一種特征),檢測(cè)ASD相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)基因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)有569個(gè)基因的可變剪接發(fā)生明顯改變(神經(jīng)元中高表達(dá)),其中有52種基因是自閉癥相關(guān)基因。

 

微生物組影響小鼠大腦中ASD基因的表達(dá)和選擇性剪接

 

4、TD、ASD移植小鼠的微生物產(chǎn)生了代謝產(chǎn)物

 

大腦中的基因表達(dá)、剪接和神經(jīng)元功能可以通過小分子代謝物進(jìn)行調(diào)節(jié)。代謝組改變與自閉癥譜系障礙有關(guān)。因此對(duì)oTD和oASD小鼠的結(jié)腸內(nèi)容物和相應(yīng)的血清進(jìn)行了非靶向代謝組學(xué)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)oASD小鼠的結(jié)腸內(nèi)容物中有27種與oTD小鼠有顯著差異,抑制γ -氨基丁酸(GABA)和甘氨酸受體的幾種激動(dòng)劑和拮抗劑存在差異,具體來說,5-氨基戊酸(5AV)和?;撬嵩趏ASD小鼠中顯著降低。后期對(duì)代謝過程進(jìn)行功能預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn):對(duì)照組小鼠腸道中L-脯氨酸和或反式-4-羥基-L-脯氨酸最終產(chǎn)生了5AV;而ASD小鼠腸道中最后生成了谷氨酸。

 

oTD和oASD微生物組對(duì)小鼠結(jié)腸和血清代謝組的影響

 

宏基因組分析證實(shí)oASD小鼠氨基酸代謝缺乏

 

5、調(diào)控ASD小鼠代謝物可改善ASD樣行為

 

腸道內(nèi)的微生物代謝物會(huì)影響神經(jīng)系統(tǒng)的預(yù)后,為了測(cè)試5AV和牛磺酸是否對(duì)小鼠行為有影響,作者通過Spearman相關(guān)性分析,發(fā)現(xiàn)多種代謝物含量與小鼠模型的行為學(xué)異常存在相關(guān)性包括?;撬岷?AV,可能保護(hù)小鼠不發(fā)生ASD樣行為。后期通過采用BTBR T+ tf/J (BTBR)小鼠模型,當(dāng)BTBR小鼠自受孕開始口服?;撬峄?AV至成年,其重復(fù)性行為均明顯減少,而社交行為明顯增加。最后通過電生理和鈣成像實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),5AV能降低BTBR小鼠前額皮質(zhì)中的神經(jīng)元興奮性。

 

微生物代謝物影響B(tài)TBR小鼠模型的行為和腦生理

 

微生物研究思路

 

 

Absin微生物研究產(chǎn)品解決方案:


分類

貨號(hào)

產(chǎn)品名稱

描述

 

abs9268

RNA樣品保存液

適用于動(dòng)物的組織和細(xì)胞樣本

核酸純化

abs60028

植物RNA快速提取試劑盒(含DNase Ⅰ)

50-100mg植物組織樣本高效RNA純化

abs60010

廣譜植物基因組DNA快速提取試劑盒

100mg新鮮或20mg干燥的植物樣品DNA提取

abs60016

細(xì)菌基因組DNA快速提取試劑盒

細(xì)菌培養(yǎng)液1-5mL的DNA提取

abs60022

唾液基因組DNA快速提取試劑盒

唾液DNA提取,內(nèi)含carrier RNA助力微量核酸洗脫

abs60173

土壤基因組DNA提取試劑盒

500mg土壤樣本DNA提取,適合多種土壤樣本

abs60352

水體基因組DNA提取試劑盒

水體樣本DNA純化,最多克達(dá)到4L

abs60288

拭子RNA提取試劑盒

口腔拭子、泌尿生殖道拭子、痰液等樣本RNA提取

abs60287

拭子DNA提取試劑盒

口腔拭子、泌尿生殖道拭子、痰液等樣本DNA提取

abs60292

尿液RNA提取試劑盒

1-5mL尿液樣本RNA純化,無需酚氯仿提取

abs60291

尿液DNA提取試劑盒

1-5mL尿液樣本DNA純化,無需酚氯仿提取

abs60011

快捷型植物基因組DNA提取試劑盒

從植物干粉或新鮮植物樣品進(jìn)行DNA提取

abs60017

酵母基因組DNA快速提取試劑盒

酵母培養(yǎng)物DNA提取

abs60290

糞便RNA提取試劑盒

200mg糞便RNA純化,去除抑制劑,獲得高純度RNA

abs60289

糞便DNA提取試劑盒

200mg糞便DNA純化,去除抑制劑,獲得高純度DNA

abs60030

病毒基因組DNA/RNA快速提取試劑盒

200uL體液樣本病毒核酸提取,
carrier RNA助力微量核酸洗脫

PCR(RT-PCR)

abs60246

逆轉(zhuǎn)錄一管化三代預(yù)混液

一步法逆轉(zhuǎn)錄試劑盒

abs601510

First-strand cDNA Synthesis Mix With gDNA Remover

經(jīng)典逆轉(zhuǎn)錄試劑盒,去除殘留gDNA

abs60074

One-Step RT-PCR Kit

一步法RT-PCR試劑盒

abs60036

2×Taq PCR Mix

Taq酶,內(nèi)含紅色染料

abs60034

2×Xerox PCR Master Mix

高保真酶,保真度是普通Taq酶的60倍

abs60037

2×Taq PCR Master Mix(for PAGE)

Taq酶 for PAGE,適合微量樣本

qPCR

abs601511

2 × 預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系

染料法qPCR預(yù)混液

abs601512

2 × 預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系(高濃度ROX)

abs601513

2 × 預(yù)混實(shí)時(shí)熒光定量快速PCR反應(yīng)體系(低濃度ROX)

abs60305

探針法熒光定量PCR試劑盒

探針法qPCR預(yù)混液

abs60306

UDG探針法熒光定量PCR試劑盒(防污染系統(tǒng))

UDG防污染系統(tǒng),可高效消減氣溶膠對(duì)PCR檢測(cè)的污染

abs60307

探針法超級(jí)多重?zé)晒舛縋CR試劑盒

探針法多重PCR預(yù)混液

abs60308

UDG多重探針法熒光定量PCR試劑盒(防污染系統(tǒng))

探針法多重PCR預(yù)混液,UDG防污染系統(tǒng)






參考文獻(xiàn)


[1] Sharon G, Cruz NJ, Kang DW, et al. Human Gut Microbiota from Autism Spectrum Disorder Promote Behavioral Symptoms in Mice.Cell. 2019;177(6):1600-1618.e17. doi:10.1016/j.cell.2019.05.004

 

Absin產(chǎn)品線:

爆款產(chǎn)品:試劑盒(mIHC、IHC、凋亡、ELISA、ChIP、Co-IP、TR-FRET、生化檢測(cè)、殘留檢測(cè)、多因子檢測(cè));細(xì)胞培養(yǎng)(類器官試劑盒+基質(zhì)膠,胎牛血清+培養(yǎng)添加劑+細(xì)胞因子)、分化試劑盒;分子(mRNA合成服務(wù)+提取試劑盒);化合物大包裝;輔助試劑、耗材/儀器、定制服務(wù)(抗體/多肽/蛋白/標(biāo)記/檢測(cè))...

特色產(chǎn)品:雞胚提取物CEE、B27、N2、霍亂毒素B亞單位CTB、牛腦垂體提取物BPE、百日咳毒素PTX、重組人胰島素Insulin、人源低密度脂蛋白LDL...


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