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DAPI 染色的替代方案:活細(xì)胞成像和計(jì)數(shù)
簡(jiǎn)介
DAPI(4',6-二脒基-2-苯基吲哚)是一種熒光染料,常用于核 DNA 染色。它用于熒光顯微鏡、染色體擴(kuò)散、FACS 和細(xì)胞檢測(cè)等成像實(shí)驗(yàn) 【1-4】。然而,紫外光激發(fā)會(huì)導(dǎo)致 DAPI 的光轉(zhuǎn)換,從而在成像系統(tǒng)的 FITC/GFP 通道中檢測(cè) DAPI 熒光,從而導(dǎo)致結(jié)果解釋錯(cuò)誤 【5, 6】。DAPI 還需要固定細(xì)胞以實(shí)現(xiàn)染色。在這個(gè)亮點(diǎn)中,我們展示了 DAPI 染色的一些替代方法,包括 StainFree 技術(shù),該技術(shù)不需要染色,并且可與活細(xì)胞一起使用。
Molecular Devices SpectraMax® i3 多功能微孔板酶標(biāo)儀采用 SpectraMax® MiniMax 300 成像細(xì)胞計(jì)數(shù)儀,使用StainFree 細(xì)胞檢測(cè)技術(shù)來(lái)定量細(xì)胞。這種非標(biāo)記方法使用透射光成像和復(fù)雜的軟件來(lái)識(shí)別單個(gè)細(xì)胞或細(xì)胞群。用戶(hù)可以“教導(dǎo)"軟件通過(guò)監(jiān)督機(jī)器學(xué)習(xí)算法來(lái)識(shí)別細(xì)胞。這使得科學(xué)家能夠?qū)?xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)并監(jiān)測(cè)細(xì)胞生長(zhǎng),而不會(huì)在昂貴的染色程序中損害細(xì)胞或損失時(shí)間和金錢(qián)。
DAPI 的另一種替代方法是 Molecular Devices EarlyTox 活細(xì)胞紅色染料。這種細(xì)胞滲透性紅色熒光染料可對(duì)培養(yǎng)物中所有細(xì)胞的核 DNA 進(jìn)行染色,無(wú)論其活性如何,并可在需要核染色的成像檢測(cè)中用作 DAPI 的替代物。在 622 nm 激發(fā)和 645 nm 峰值發(fā)射的情況下,活的紅色染料在成像檢測(cè)中不會(huì)干擾 FITC 通道。
我們進(jìn)行了一項(xiàng)細(xì)胞計(jì)數(shù)實(shí)驗(yàn),以證明 StainFree 技術(shù)和活細(xì)胞紅色染料方法與 DAPI 染色相比的性能。DAPI 的兩種替代方案均為用戶(hù)提供了對(duì)活細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)的優(yōu)勢(shì),而無(wú)需耗時(shí)的固定步驟。StainFree 技術(shù)使用戶(hù)不受染色程序的限制,并使他們能夠使用細(xì)胞進(jìn)行額外的下游分析。
優(yōu)勢(shì)
• 使用 StainFree 技術(shù)實(shí)現(xiàn)活細(xì)胞計(jì)數(shù),同時(shí)無(wú)需染色前的固定步驟,避免昂貴
的染色程序
,節(jié)省時(shí)間和金錢(qián)
CHO-K1 細(xì)胞以 20,000 至 300 個(gè)細(xì)胞/孔的密度接種到 96 孔板中,連續(xù)進(jìn)行兩倍稀釋?zhuān)⒃?/span> 37°C 下附著并生長(zhǎng)過(guò)夜。 孵育后,在 37°C 下用含 4% 多聚甲醛的磷酸鹽緩沖鹽水 (PBS) 固定孔的子集 30 分鐘。 固定后,用 1X PBS 洗滌細(xì)胞兩次,然后在 0.1% Triton X-100 中孵育 5 分鐘。用 PBS 洗滌細(xì)胞兩次,并用 PBS 中的 2.9 µM DAPI 染色 30 分鐘。染色后,用 PBS 洗滌細(xì)胞三次。
剩余的活細(xì)胞,并用活紅色染料染色。將染料儲(chǔ)備溶液在 PBS 中以 1:2000 的比例稀釋并添加到細(xì)胞中。孵育 30 分鐘后,使用 MiniMax 細(xì)胞儀上的透射光和紅色熒光 (Cy5) 通道對(duì)活細(xì)胞進(jìn)行成像。使用 SoftMax Pro 軟件進(jìn)行 StainFree 分析和核計(jì)數(shù)。圖 1 顯示了使用 StainFree 或 Live Red Dye 節(jié)省的時(shí)間。
為了進(jìn)行比較,在 ImageXpress® Micro XLS 寬場(chǎng)高內(nèi)涵分析系統(tǒng)中使用 Cy5 和 DAPI 通道對(duì)活(紅色染色)和固定(DAPI 染色)細(xì)胞進(jìn)行成像。按順序?yàn)楸容^兩個(gè)成像系統(tǒng)的細(xì)胞計(jì)數(shù),將目標(biāo)區(qū)域 (ROI) 應(yīng)用于使用
MiniMax 細(xì)胞計(jì)數(shù)器采集的圖像,以匹配 ImageXpress Micro XLS 系統(tǒng)上成像的區(qū)域。使用 SoftMax Pro 軟件創(chuàng)建圖形。
圖 1:使用 StainFree 技術(shù)與活紅色染料與DAPI。 與使用 DAPI 進(jìn)行固定和染色相比,StainFree 工作流程可節(jié)省約 70 分鐘的時(shí)間。此外,使用 StainFree 技術(shù)分析的細(xì)胞仍然存活,并可用于其他檢測(cè)。
用活紅色染料染色并在 MiniMax 細(xì)胞計(jì)數(shù)器的紅色熒光和透射光通道上成像的細(xì)胞如圖 2 所示。對(duì)于紅色熒光圖像,使用 SoftMax Pro 軟件中的預(yù)定義“Nuclei"設(shè)置來(lái)準(zhǔn)確識(shí)別染色的細(xì)胞核。對(duì)于在透射光通道中成像的細(xì)胞,使用 StainFree 技術(shù)來(lái)識(shí)別細(xì)胞。軟件中的預(yù)定義設(shè)置“CellsA"為這些 CHO 細(xì)胞實(shí)現(xiàn)了精確的結(jié)果。StainFree 細(xì)胞計(jì)數(shù)與熒光細(xì)胞核計(jì)數(shù)非常接近(圖 2,圖),表明 MiniMax 細(xì)胞計(jì)數(shù)儀和 SoftMax Pro 軟件可準(zhǔn)確消除對(duì)細(xì)胞核染色計(jì)數(shù)的需求。使用 ImageXpress Micro XLSsystem 和 MetaXpress® 軟件對(duì) DAPI 染色的細(xì)胞進(jìn)行成像和計(jì)數(shù)。對(duì)于比較,使用 Cy5 通道在同一系統(tǒng)上對(duì)活的紅色染料染色細(xì)胞進(jìn)行
成像。染色細(xì)胞的圖像如圖 3 所示。使用兩種染料的細(xì)胞計(jì)數(shù)非常接近(圖 3,圖)。通過(guò)此比較,我們確認(rèn)使用 DAPI 的細(xì)胞計(jì)數(shù)與使用 StainFree 技術(shù)的細(xì)胞計(jì)數(shù)相當(dāng)。
圖 2. 使用 MiniMax 細(xì)胞計(jì)數(shù)器對(duì)細(xì)胞進(jìn)行計(jì)數(shù)。 用活紅色染料染色的細(xì)胞在紅色熒光(左上)或透射光(中上)通道中成像。StainFree 細(xì)胞計(jì)數(shù)(右上角,紫色掩膜)與基于紅色細(xì)胞核染色的細(xì)胞計(jì)數(shù)密切相關(guān),如圖所示(綠色圓圈,StainFree 計(jì)數(shù);紅色圓圈,紅色細(xì)胞核計(jì)數(shù))。兩條曲線的 r2 值為 0.99。
圖 3. 在 ImageXpress XLS 系統(tǒng)中計(jì)數(shù)的細(xì)胞。 對(duì)用活紅色染料(左上)或 DAPI(右上)染色的細(xì)胞進(jìn)行成像,并通過(guò)在 SoftMax Pro 軟件(下圖)中繪制圖表來(lái)證明使用兩種染料獲得的計(jì)數(shù)的密切相關(guān)性。對(duì)于兩條曲線,r2 均為 0.99。
Stain Free 技術(shù) 和 Live Red Dye 在細(xì)胞計(jì)數(shù)方面與 DAPI 一樣有效,DAPI 需要在染色前進(jìn)行固定。StainFree 細(xì)胞計(jì)數(shù)是最大限度地提高細(xì)胞活性和減少細(xì)胞處理時(shí)間的好選擇,因?yàn)樗炔恍枰獰晒馊玖?,也不需要固定。?duì)于需要細(xì)胞核染料的情況,例如,為了監(jiān)測(cè)細(xì)胞核大小或染色水平,可以使用活的紅色染料代替 DAPI,但不需要固定。它也不會(huì)干擾綠色熒光成像,因?yàn)?/span> DAPI 已被證明是如此。使用 StainFree 技術(shù)或 Live RedDye 可實(shí)現(xiàn)活細(xì)胞檢測(cè)的更多多功能性。