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液相色譜和氣相色譜都是常用的檢測分析儀器，各擅長的區(qū)域也不盡相同，下面主要說明液相色譜相較于氣相色譜的部分優(yōu)勢。
液相色譜和氣相色譜相比較，在以下幾個(gè)方面具有優(yōu)勢：
（1）氣相色譜不適用于不揮發(fā)物質(zhì)和對熱不穩(wěn)定物質(zhì)，而液相色譜卻不受樣品的揮發(fā)性和熱穩(wěn)定性的限制有些樣品因?yàn)殡y以汽化而不能通過柱子，熱不穩(wěn)定的物質(zhì)受熱會發(fā)生分解，也不適用于氣相色譜法。這使氣相色譜法的使用范圍受到了限制。據(jù)統(tǒng)計(jì)，目前氣相色譜法所能分析的有機(jī)物，只占全部有機(jī)物的15%~20%。另一方面，液相色譜卻不受樣品的揮發(fā)性和熱穩(wěn)定性的限制所以液相色譜非常適合于分離生物、醫(yī)藥有關(guān)的大分子和離子型化合物，不穩(wěn)定的天然產(chǎn)物，種類繁多的其它高分子及不穩(wěn)定的化合物。
（2）對于很難分離的樣品，用液相色譜常比用氣相色譜容易完成分離，主要有以下三個(gè)方面的原因：
①液相色譜中，由于流動相也影響分離過程，這就對分離的控制和改善提供了額外的因素。而氣相色譜中的載氣一般不影響分配，也就是說，在液相色譜中，有兩個(gè)相與樣品分子發(fā)生選擇性的相互作用。
②液相色譜中具有獨(dú)*能的柱填料（固定相）的種類較多，這樣就使固定相的選擇余地更大，從而增加了分離的可能性。
③液相色譜使用較低的分離溫度，分子間的相互作用在低溫時(shí)更為有效，因此降低溫度一般會提高色譜分離效率。
（3）和氣相色譜相比，液相色譜對樣品的回收比較容易，而且是定量的，樣品的各個(gè)組分很容易被分離出來。因此，在很多場合，液相色譜不僅作為一種分析方法，而且可以作為一種分離手段，用以提純和制備具有中等純度的單一物質(zhì)。在氣相色譜中所分離出的各樣品組分雖也可以回收，但一般都不太方便，而且定量性差。液相色譜法由于具有這些氣相色譜法不具備的優(yōu)點(diǎn)，因此在許多領(lǐng)域得到廣泛的應(yīng)用。