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分子膠研究“雙子星”:探索HTRF/Lance和Alpha技術(shù)

2025-4-14  閱讀(69)

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分子膠(Molecular Glue)是一類(lèi)靶向蛋白降解(TPD)的小分子化合物,通過(guò)促進(jìn)E3連接酶與新底物間的相互作用,觸發(fā)泛素-蛋白酶系統(tǒng),精準(zhǔn)誘導(dǎo)靶蛋白降解。與蛋白降解靶向嵌合體(PROTAC)技術(shù)相比,分子膠具有分子量小、成藥性高、脫靶效應(yīng)低等優(yōu)勢(shì)[1]。



目前,F(xiàn)DA批準(zhǔn)的來(lái)那度胺和泊馬度胺等分子膠藥物,在抗腫瘤、免疫調(diào)節(jié)等領(lǐng)域療效顯著,惠及數(shù)百萬(wàn)患者并創(chuàng)造數(shù)百億美元收入[2]。然而,分子膠研發(fā)仍面臨挑戰(zhàn),如發(fā)現(xiàn)過(guò)程缺乏系統(tǒng)性篩選方法,靶點(diǎn)確認(rèn)和機(jī)制研究耗資巨大,限制了其進(jìn)一步發(fā)展。



圖1. 分子膠作用原理[1]

隨著高通量篩選技術(shù)的不斷發(fā)展,分子膠有望在生物驗(yàn)證、靶點(diǎn)確認(rèn)和機(jī)制研究領(lǐng)域取得更多突破性進(jìn)展。HTRF/Lance和Alpha技術(shù)具有均相免洗、操作簡(jiǎn)單高效、信號(hào)穩(wěn)定、靈敏度高、適用于高通量檢測(cè)等優(yōu)勢(shì),已被廣泛用于潛在分子膠靶標(biāo)和效應(yīng)蛋白之間親和力的驗(yàn)證。

Lance及Alpha技術(shù)在分子內(nèi)二價(jià)膠親和力測(cè)定中的應(yīng)用

BRD4在多種癌細(xì)胞中過(guò)表達(dá), 在癌細(xì)胞的遷移、代謝和惡性發(fā)展中發(fā)揮重要作用。BRD4作為溴結(jié)構(gòu)域和末端外結(jié)構(gòu)域 (BET) 家族的成員,其特征在于具有兩個(gè)串聯(lián)溴結(jié)構(gòu)域(BD1、BD2)。最近的一項(xiàng)描述了一種分子內(nèi)二價(jià)膠的降解劑IBG1。IBG1能夠結(jié)合BRD4的兩個(gè)串聯(lián)溴結(jié)構(gòu)域,并將BRD4結(jié)合到DCAF16(Cullin RING E3 泛素連接酶)上,從而誘導(dǎo)BRD4的降解。

為了在生化水平驗(yàn)證IBG1與BRD4和DCAF16的結(jié)合結(jié)構(gòu)域,Oliver等[3]使用Lance Anti-His-Eu、His-BRD4及Cy5標(biāo)記的DCAF16測(cè)定三元復(fù)合物的形成,他們發(fā)現(xiàn)IBG1能增強(qiáng)BRD4Tandem*和DCAF16之間的相互作用,而非通過(guò)單一BD1或BD2結(jié)構(gòu)域(圖2b,c)。



圖2. IBG1增強(qiáng)BRD4 Tandem結(jié)構(gòu)域和DCAF16之間的相互作用[3]

* Tandem: BRD4包含兩個(gè)溴結(jié)構(gòu)域(BD1 和 BD2)的構(gòu)建體

*JQ1: BET 家族溴結(jié)構(gòu)域抑制劑

隨后,他們使用biotinylated-JQ1*, SA-Donor beads, His-BRD4, Nickel Chelate Acceptor beads,構(gòu)建AlphaLISA displacement實(shí)驗(yàn)(圖2e),驗(yàn)證IBG1競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合BRD4的能力。

實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)三元復(fù)合物BRD4Tandem: IBG1: DCAF16的親和力顯著強(qiáng)于BRD4BD1: IBG1: DCAF16,進(jìn)一步證實(shí)了兩個(gè)溴結(jié)構(gòu)域?qū)τ趶?fù)合物形成都是必需的。總之,Lance及Alpha的實(shí)驗(yàn)確立了IBG1能夠增強(qiáng)BRD4和DCAF16的親和力,并且需要BRD4兩個(gè)溴結(jié)構(gòu)域的存在。



HTRF技術(shù)在分子膠親和力測(cè)定中的應(yīng)用

SMAD4是TGF-β通路的核心介質(zhì),在TGF-β的刺激下,SMAD4與SMAD3等形成復(fù)合物,將信號(hào)從細(xì)胞外傳遞至細(xì)胞核,調(diào)控基因表達(dá)。SMAD4R361H突變是多種腫瘤中的常見(jiàn)突變,會(huì)損害SMAD4和SMAD3之間的相互作用,從而阻斷TGF-β誘導(dǎo)的抗增殖信號(hào)傳導(dǎo)。

為了檢測(cè)Ro-31-8220和Go-6983對(duì)His-SMAD4/SMAD4 R361H和Flag-SMAD3的相互作用的影響,Cong Tang等[4]使用HTRF Anti-FLAG-Tb Donor及Anti-His-d2 Acceptor構(gòu)建了靈敏且可擴(kuò)展的高通量篩選平臺(tái)。Ro-31-8220和Go-6983被鑒定為分子膠,可誘導(dǎo)SMAD4 R361H/SMAD3的相互作用。



圖3. Ro-31-8220和Go-6983被鑒定為分子膠誘導(dǎo)SMAD4 R361H/SMAD3的相互作用[4]



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