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DNA RNA單分子富集液滴系統(tǒng)

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產(chǎn)品型號(hào)DNAdrop

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更新時(shí)間:2022-03-02 14:16:36瀏覽次數(shù):204次

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DNA RNA單分子富集液滴系統(tǒng)

采用*專有微流體技術(shù),跨越基因和細(xì)胞研究的下一個(gè)前沿。它的*設(shè)計(jì)能幫助研究人員對(duì)人類、
動(dòng)物、植物和微生物的細(xì)胞和基因組獲得高分辨率的信息。

可以在用戶友好型的工作流程中生成和分類雙乳液滴,不需要任何使用過熒光細(xì)胞分類器的經(jīng)驗(yàn)。

DNA RNA單分子富集液滴系統(tǒng)

高通量單細(xì)胞單分子液滴分選與封裝系統(tǒng)


可實(shí)現(xiàn)DNA或細(xì)胞封裝和高吞吐量分選。 這使得能夠以很快的速度篩選大型復(fù)雜的基因庫。

該系統(tǒng)是一種多功能和用戶友好型皮升級(jí)液滴發(fā)生器,觸摸屏化操作,*自動(dòng)化液滴生成。用于準(zhǔn)備DNA,細(xì)胞和其他生物材料樣品,然后用于下游的高分辨率分析。 可以安全、快速地將單個(gè)分子、DNA文字片段、單個(gè)細(xì)胞或單個(gè)細(xì)胞器與生化反應(yīng)試劑一起封裝在高度穩(wěn)定的雙乳狀或單乳狀液滴中。這些液滴能在PCR、渦旋、孵育和長(zhǎng)期儲(chǔ)存過程中保持穩(wěn)定。

封裝液體藥物的系統(tǒng)

采用*專有微流體技術(shù),跨越基因和細(xì)胞研究的下一個(gè)前沿。它的*設(shè)計(jì)能幫助研究人員對(duì)人類、

動(dòng)物、植物和微生物的細(xì)胞和基因組獲得高分辨率的信息。


可以在用戶友好型的工作流程中生成和分類雙乳液滴,不需要任何使用過熒光細(xì)胞分類器的經(jīng)驗(yàn)。

工作流程從將100 kb的DNA的文字片段、小單細(xì)胞或其他生物材料捕捉在高度穩(wěn)定的液滴中開始,以用于諸如PCR和酶活性評(píng)價(jià)等測(cè)試當(dāng)中。

然后,根據(jù)內(nèi)含物的熒光對(duì)液滴進(jìn)行分類,分離得到只含有感興趣內(nèi)容物的液滴,用于下游高分辨率分析,如:


●驗(yàn)證CRISPR基因編輯沒有隱藏意外重組的PCR偏差。

●識(shí)別重排,如融合和倒置。

●*。

●識(shí)別病毒和轉(zhuǎn)基因整合位點(diǎn)。

●在單細(xì)胞水平評(píng)估酶活性。

●進(jìn)行高通量GFP篩選。綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)是一種常用

的報(bào)告基因

提供該系統(tǒng)所需的全系列試劑,用于包裹封裝DNA、RNA、細(xì)胞器或小細(xì)胞。生成高度穩(wěn)定的微納雙乳化液滴,

這些數(shù)以百萬計(jì)的液滴分別封裝分子,細(xì)胞器,或小細(xì)胞(高達(dá)6µm直徑)。每一個(gè)液滴都相當(dāng)于一個(gè)反應(yīng)室在其內(nèi)進(jìn)行單個(gè)分子或單個(gè)細(xì)胞分辨率水平的分析。

液滴是什么樣子

基于微流體,在一個(gè)簡(jiǎn)單的工作過程中將數(shù)百萬個(gè)分子分成液滴,從而能夠高質(zhì)量地靶向富集大片段(3E100 kb),

d用于后續(xù)測(cè)序 ,允許從幾毫微克的脫氧核糖核酸開始靶向富集長(zhǎng)脫氧核糖核酸分子。該系統(tǒng)是基于分離數(shù)百萬個(gè)液滴中的長(zhǎng)DNA文字片

段,其中含有感興趣目標(biāo)序列的液滴被熒光標(biāo)記,并使用流式細(xì)胞術(shù)進(jìn)行分類。該系統(tǒng)程序的終產(chǎn)品是可以通過測(cè)序研究的長(zhǎng)脫氧核糖核酸分子的富集群體。是研究復(fù)雜基因組區(qū)域的有效富集技術(shù)。


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在一項(xiàng)新的研究中,來自美國卡內(nèi)基科學(xué)研究所的Ethan Greenblatt和Allan Spradling揭示出導(dǎo)致脆性X綜合征(fragile X syndrome)和潛在其他的自閉癥相關(guān)疾病的遺傳因素都源于細(xì)胞產(chǎn)生異常大的蛋白結(jié)構(gòu)的能力存在缺陷。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2018年8月17日的 Science期刊上,論文標(biāo)題為“Fragile X mental retardation 1 gene enhances the translation of large autism-related proteins"。


為什么要選擇該系統(tǒng):

它提供了從大基因文庫中準(zhǔn)備基因材料的手段以用于高分辨率的篩查分析。

幫助回答一系列的基因組學(xué)和分子生物學(xué)問題。

支持合成生物學(xué)的工作流程,如酶進(jìn)化及其路徑工程。
具有用戶友好型接口,具有將微液體技術(shù)接入各實(shí)驗(yàn)室的能力


DNA RNA單分子富集液滴系統(tǒng)   微液滴數(shù)字PCR儀


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典型應(yīng)用:

與適當(dāng)?shù)囊旱畏蛛x、測(cè)序和分析技術(shù)相結(jié)合,該系統(tǒng)可應(yīng)用于以下等幾個(gè)方面:

●長(zhǎng)或短讀測(cè)序

●基因編輯分析

●無偏全基因組擴(kuò)增

●酶活性評(píng)價(jià)

近年來,液滴的質(zhì)譜分析技術(shù)、基于液滴的梯度技術(shù)、雙重液滴技術(shù)及基于液滴的基因篩選等取得了較大進(jìn)展,使液滴微流控在單細(xì)胞分析、酶動(dòng)力學(xué)、蛋白質(zhì)合成及高通量篩選等研究領(lǐng)域的潛力逐漸顯現(xiàn)出來。

實(shí)現(xiàn)單分子或單細(xì)胞分辨率

確保您為單分子或單細(xì)胞分析捕獲了正確的材料。該系統(tǒng)通過將生命的構(gòu)建模塊封裝在微微升雙乳液或單乳液液滴中,支持高分辨率的基因組學(xué)、宏基因組學(xué)和分子生物學(xué)工作流程。這種*的方法使以前未知的基因組區(qū)域可用于長(zhǎng)讀和短讀測(cè)序,提高了全基因組擴(kuò)增的分辨率,支持單細(xì)胞酶活性的評(píng)估等等。

1、基因組學(xué)應(yīng)用

提高基因組學(xué)和宏基因組學(xué)研究的分辨率。使用我們系統(tǒng)以及測(cè)序建議和生物信息學(xué)工具來執(zhí)行一系列基因組學(xué)工作流程該系統(tǒng)在人類、其他動(dòng)物、植物和微生物DNA的長(zhǎng)讀和短讀測(cè)序工作流程中證明了其性能。

聚光燈:植物基因組學(xué)

克服對(duì)植物龐大而復(fù)雜的基因組進(jìn)行測(cè)序的挑戰(zhàn)。該系統(tǒng)在支持各種植物基因組學(xué)工作方面表現(xiàn)出色,包括:

  • 特征不明顯的基因簇分析

  • 由于參考基因組和植物品種之間的低對(duì)應(yīng)性導(dǎo)致的間隙閉合

  • 植物基因組結(jié)構(gòu)重排的解析

  • 生物合成基因簇的檢查

2、基于細(xì)胞的應(yīng)用

使用該系統(tǒng)封裝單個(gè)小細(xì)胞,包括微生物和藻類,以及生物活性分子。我們高度穩(wěn)定的雙乳化液滴提供了一種方法,可以孵育單個(gè)活細(xì)胞進(jìn)行分析,并對(duì)它們進(jìn)行分類,以在基于細(xì)胞的工作流程中獲得高分辨率。Xdrop在封裝細(xì)胞核方面也有良好的表現(xiàn),其他細(xì)胞器的工作流程正在測(cè)試中。


新應(yīng)用

胞通過控制信使RNA(mRNA)降解在任何給定的時(shí)間里控制特定蛋白的數(shù)量。鑒于mRNA的核苷酸尾巴在這個(gè)過程中起作用,在一項(xiàng)新的研究中,來自韓國基礎(chǔ)科學(xué)研究院(IBS)RNA研究中心的研究人員鑒定出由不同核苷酸組成的混合尾巴(mixed tail)如何保護(hù)mRNA在 更長(zhǎng)的時(shí)間內(nèi)免受降解。這些發(fā)現(xiàn)可能為理解基因調(diào)節(jié)在健康和疾病狀態(tài)下的作用提供新的見解。相關(guān)研究結(jié)果于2018年7月19日在線發(fā)表在Science期刊上,論文標(biāo)題為“Mixed tailing by TENT4A and TENT4B shields mRNA from rapid deadenylation"。

直到近,mRNA尾巴被認(rèn)為僅是由數(shù)百個(gè)被稱作腺苷酸(A)的核苷酸組成的,因此通常被稱為poly(A)尾巴。特定的酶通過在poly(A)尾巴的末端添加和剪除核苷酸A來延長(zhǎng)和縮短這個(gè)尾巴:poly(A)聚合酶添加大約200個(gè)核苷酸A;脫腺苷化酶(deadenylase),比 如CNOT復(fù)合物,從poly(A)尾巴的末端移除核苷酸A,一段時(shí)間之后縮短這個(gè)尾巴的長(zhǎng)度。

2014年,IBS研究人員已發(fā)現(xiàn)mRNA尾巴并不限于核苷酸A。他們開發(fā)出一種高通量測(cè)序方法TAIL-seq,并利用這種方法在全基因組范圍內(nèi)準(zhǔn)確地測(cè)量poly(A)尾巴的長(zhǎng)度。他們發(fā)現(xiàn)除了核苷酸A之外,其他核苷酸,如鳥苷酸(G),尿苷酸(U)和胞苷酸(C),也會(huì)裝飾 mRNA尾巴。人們已在包括人類、小鼠、青蛙和魚類在內(nèi)的多種物種中報(bào)道了這個(gè)混合尾巴的存在。

在當(dāng)前的這項(xiàng)新的研究中,IBS研究人員發(fā)現(xiàn)一些將核苷酸A插入到mRNA尾巴的酶也能夠添加核苷酸G、U和C,從而產(chǎn)生一個(gè)混合尾巴。特別地,核苷酸轉(zhuǎn)移酶TENT4A/B在延長(zhǎng)mRNA尾巴時(shí)間歇性地添加核苷酸G。有趣的是,在細(xì)胞中,核苷酸G主要位于mRNA尾巴的末端,或者 位于倒數(shù)第二個(gè)位置。這能夠通過以下事實(shí)加以解釋:修剪poly(A)尾巴的酶在這個(gè)尾巴的末端遇到核苷酸G而不是A時(shí)停下來。換句話說,這些研究人員發(fā)現(xiàn)核苷酸G的添加可能會(huì)減慢這個(gè)尾巴的修剪速度,從而保護(hù)mRNA。

















































































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