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Thermo Fisher熱循環(huán)儀與實(shí)時(shí)熒光PCR儀的區(qū)別與應(yīng)用解析
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)作為分子生物學(xué)的基礎(chǔ)技術(shù)之一,已經(jīng)從基礎(chǔ)擴(kuò)增發(fā)展出更高級(jí)的實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)。而賽默飛(Thermo Fisher Scientific)作為PCR技術(shù)的設(shè)備制造商,其旗下的**熱循環(huán)儀系列(如ProFlex、SimpliAmp)與實(shí)時(shí)熒光PCR系統(tǒng)(如QuantStudio系列)**在全球范圍內(nèi)廣泛應(yīng)用。
雖然它們都以“PCR"為核心,但在功能定位、檢測(cè)方式、硬件配置和應(yīng)用目的上存在顯著區(qū)別。本文將圍繞這兩類儀器的不同,從技術(shù)角度展開(kāi)解析,并為實(shí)驗(yàn)選型提供參考建議。
一、概念與原理差異
1. 熱循環(huán)儀(Thermal Cycler)
熱循環(huán)儀,也被稱為“PCR儀",是用于擴(kuò)增DNA模板的設(shè)備。其工作原理是通過(guò)反復(fù)加熱與降溫,實(shí)現(xiàn)DNA模板的變性、退火和延伸,最終形成成千上萬(wàn)倍的DNA片段。
主要功能:精確控制溫度循環(huán),使PCR反應(yīng)體系進(jìn)行擴(kuò)增。
檢測(cè)方式:不帶檢測(cè)功能,需擴(kuò)增完成后使用凝膠電泳等方法進(jìn)行檢測(cè)。
2. 實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀(Real-Time PCR / qPCR)
實(shí)時(shí)熒光PCR儀在傳統(tǒng)PCR的基礎(chǔ)上集成了熒光檢測(cè)模塊,可在每個(gè)循環(huán)結(jié)束后通過(guò)檢測(cè)熒光信號(hào)強(qiáng)度,實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)產(chǎn)物的擴(kuò)增情況,實(shí)現(xiàn)定量分析。
主要功能:擴(kuò)增+定量+分析,可得出Ct值、擴(kuò)增曲線等數(shù)據(jù)。
檢測(cè)方式:通過(guò)熒光染料或探針檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的數(shù)量。
二、硬件結(jié)構(gòu)對(duì)比
部件 | 熱循環(huán)儀(如ProFlex) | 實(shí)時(shí)熒光PCR儀(如QuantStudio) |
---|---|---|
控溫模塊 | 有(加熱/冷卻模塊) | 有(精密控溫) |
熒光檢測(cè)系統(tǒng) | 無(wú) | 有(激發(fā)光源+檢測(cè)器) |
軟件系統(tǒng) | 控溫程序管理 | 控溫+熒光監(jiān)控+數(shù)據(jù)分析 |
數(shù)據(jù)輸出 | 溫度程序/運(yùn)行日志 | 實(shí)時(shí)擴(kuò)增曲線/Ct值/標(biāo)準(zhǔn)曲線 |
屏幕操作 | 彩色觸屏為主 | 彩色觸屏 + 軟件界面 |
三、功能與用途比較
熱循環(huán)儀主要功能:
基因擴(kuò)增
載體構(gòu)建(如限制性酶切連接)
突變引入
RT-PCR第一步逆轉(zhuǎn)錄
梯度PCR優(yōu)化反應(yīng)體系
實(shí)時(shí)熒光PCR儀主要功能:
基因表達(dá)定量分析(qPCR)
微生物/病原體定量檢測(cè)
SNP 分型
DNA甲基化研究
藥物敏感性篩查
臨床分子診斷研究(如病毒核酸檢測(cè))
簡(jiǎn)而言之:熱循環(huán)儀偏向“擴(kuò)增",而實(shí)時(shí)熒光PCR偏向“定量分析"。
四、具體產(chǎn)品介紹與差異
1. 熱循環(huán)儀代表產(chǎn)品:ProFlex™ PCR系統(tǒng)
模塊可更換(3×32、96孔、384孔)
支持梯度PCR
無(wú)熒光檢測(cè)系統(tǒng)
彩色觸控屏幕,操作簡(jiǎn)潔
程序可存儲(chǔ)與USB導(dǎo)出
適合日常分子克隆、常規(guī)DNA擴(kuò)增、PCR條件優(yōu)化等。
2. 實(shí)時(shí)熒光PCR代表產(chǎn)品:QuantStudio™系列
常見(jiàn)型號(hào):
QuantStudio 3/5:適合科研初級(jí)用戶,96孔設(shè)計(jì)
QuantStudio 6/7 Flex:中高通量,支持96/384孔模塊轉(zhuǎn)換
QuantStudio 12K Flex:超高通量,支持OpenArray平臺(tái)
核心特征:
多通道熒光檢測(cè)(FAM、VIC、ROX等)
可實(shí)時(shí)生成擴(kuò)增曲線、溶解曲線
支持標(biāo)準(zhǔn)曲線法、ΔΔCt法進(jìn)行定量分析
軟件分析功能豐富,可輸出報(bào)告、熱圖、分型圖等
適合基因表達(dá)分析、臨床研究、病原檢測(cè)和基因分型等高要求實(shí)驗(yàn)。
五、軟件與數(shù)據(jù)處理差異
熱循環(huán)儀軟件特點(diǎn):
著重程序編排與管理
僅提供控溫和運(yùn)行日志
無(wú)數(shù)據(jù)分析模塊
實(shí)時(shí)熒光PCR軟件特點(diǎn):
包含實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)采集、擴(kuò)增曲線分析等功能
可設(shè)置標(biāo)準(zhǔn)品濃度生成標(biāo)準(zhǔn)曲線
支持樣本定量、分型判定、熔解曲線分析等
實(shí)時(shí)熒光PCR的軟件功能更全面,處理的數(shù)據(jù)量也更大,需要一定的培訓(xùn)基礎(chǔ)。
六、實(shí)驗(yàn)應(yīng)用差異化舉例
實(shí)驗(yàn)?zāi)康?/th> | 適用儀器 |
---|---|
克隆驗(yàn)證、基因擴(kuò)增 | 熱循環(huán)儀 |
熒光探針?lè)ú《緳z測(cè)(如SARS-CoV-2) | 實(shí)時(shí)熒光PCR |
梯度溫度優(yōu)化 | 熱循環(huán)儀(帶梯度功能) |
微量樣本絕對(duì)定量 | 實(shí)時(shí)熒光PCR |
教學(xué)與培訓(xùn)用基礎(chǔ)PCR | 熱循環(huán)儀(如SimpliAmp) |
七、實(shí)驗(yàn)室選型建議
實(shí)驗(yàn)室類型 | 推薦設(shè)備 |
---|---|
分子生物學(xué)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)室 | 熱循環(huán)儀(SimpliAmp、ProFlex) |
藥物研發(fā)、轉(zhuǎn)錄組分析實(shí)驗(yàn)室 | 實(shí)時(shí)熒光PCR(QuantStudio 5/7) |
臨床或檢測(cè)中心 | 實(shí)時(shí)熒光PCR(QuantStudio 6/12K) |
教學(xué)、教學(xué)科研結(jié)合平臺(tái) | 熱循環(huán)儀 + 熒光PCR組合配置 |
八、常見(jiàn)誤區(qū)澄清
實(shí)時(shí)熒光PCR儀不是“版"熱循環(huán)儀,它們工作目標(biāo)不同,一個(gè)側(cè)重?cái)U(kuò)增,一個(gè)側(cè)重實(shí)時(shí)檢測(cè)和數(shù)據(jù)分析。
熱循環(huán)儀無(wú)法進(jìn)行定量分析,需后續(xù)用電泳或其他分析手段才能判斷擴(kuò)增效果。
實(shí)時(shí)熒光PCR設(shè)備雖然價(jià)格較高,但在病毒檢測(cè)、基因表達(dá)分析等場(chǎng)景中不可替代。
九、結(jié)語(yǔ)
賽默飛熱循環(huán)儀和實(shí)時(shí)熒光PCR儀是分子實(shí)驗(yàn)室中各司其職的工具。前者是PCR技術(shù)的基礎(chǔ)設(shè)備,后者則是在其基礎(chǔ)上擴(kuò)展出的數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。選擇哪一種設(shè)備,應(yīng)基于實(shí)驗(yàn)?zāi)康?、預(yù)算、操作人員的技能水平等綜合考慮。
對(duì)于基礎(chǔ)DNA擴(kuò)增實(shí)驗(yàn),熱循環(huán)儀即可滿足;而涉及基因定量、分型分析等高級(jí)實(shí)驗(yàn),則必須依賴實(shí)時(shí)熒光PCR系統(tǒng)完成。