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實(shí)驗(yàn)原理：
在保持組蛋白和DNA聯(lián)合的同時(shí)，染色質(zhì)被切成很小的片斷，通過運(yùn)用對(duì)應(yīng)于一個(gè)特定組蛋白標(biāo)記的生物抗體，將目標(biāo)片段（組蛋白發(fā)生特異標(biāo)記的片段）沉淀下來。ChIP是利用抗原和抗體的特異性結(jié)合以及細(xì)菌蛋白質(zhì)的“protein A”特異性地結(jié)合到免疫球蛋白的Fc片段的現(xiàn)象合用開發(fā)出來的方法（免疫磁珠結(jié)合proteinA，proteinA結(jié)合抗體Fc段，抗體結(jié)合抗原即發(fā)生特異標(biāo)記的組蛋白，這里要注意組蛋白是和DNA結(jié)合的，這樣就把目標(biāo)組蛋白和DNA的復(fù)合體沉淀下來了）。再將組蛋白與DNA分離，用獲得的DNA去做PCR分析和序列測定等檢測技術(shù)，從而進(jìn)一步檢測哪些基因的組蛋白發(fā)生了修飾。