PCR實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)要求、污染預(yù)防和控制,看懂秒變PCR實(shí)驗(yàn)室大神!
一、PCR實(shí)驗(yàn)室平面布局
PCR實(shí)驗(yàn)室布局圖
PCR實(shí)驗(yàn)室原則上分為四個(gè)單獨(dú)的工作區(qū)域:試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增反應(yīng)混合物配置和擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū),為了避免交叉污染,進(jìn)入各個(gè)工作區(qū)域必須嚴(yán)格遵循單一方向進(jìn)行,即只能從試劑貯存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū),各實(shí)驗(yàn)區(qū)之間的試劑及樣品傳遞應(yīng)通過傳遞窗進(jìn)行。
二、實(shí)驗(yàn)室空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)設(shè)計(jì)及壓力控制
實(shí)驗(yàn)室空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)
PCR實(shí)驗(yàn)室并沒有嚴(yán)格的凈化要求,但是為避免各個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)域間交叉污染的可能性,適合用全送全排的氣流組織形式。同時(shí),要嚴(yán)格控制送、排風(fēng)的比例以保證實(shí)驗(yàn)區(qū)的壓力要求。
二、1 實(shí)際貯存和準(zhǔn)備區(qū)
PCR實(shí)驗(yàn)室主要進(jìn)行的操作為貯存試劑的制備、試劑的分裝盒主反應(yīng)混合液的制備。試劑和用于樣品制作的材料應(yīng)直接運(yùn)送到這個(gè)區(qū),不得經(jīng)過其他區(qū)域。試劑原料必須貯存在本區(qū)內(nèi),并再本區(qū)內(nèi)制備成所需的貯存試劑。該區(qū)對(duì)與氣流壓力的控制沒有嚴(yán)格的要求。
二、2 標(biāo)本制備區(qū)
該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為樣本的保存、核酸(RNA、DNA)提取、貯存及其加入值擴(kuò)增反應(yīng)管和測(cè)定DNA的合成。壓力梯度要求為:相對(duì)領(lǐng)巾區(qū)域?yàn)檎龎?,以避免從鄰近區(qū)進(jìn)入本區(qū)的氣溶膠污染,另外由于在加樣操作中可能會(huì)發(fā)生氣溶膠所致的污染,所以應(yīng)避免在本區(qū)內(nèi)不必要的走動(dòng)。
二、3 擴(kuò)增反應(yīng)混合物配制和擴(kuò)增區(qū)
該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為DNA擴(kuò)增,此外,已制備的DNA模板(來自樣本制備區(qū))的加入和主反應(yīng)混合液(來自試劑貯存和制備區(qū))制備成反應(yīng)混合液等也可以在本區(qū)內(nèi)進(jìn)行。本區(qū)的壓力梯度要求為:相對(duì)于鄰近區(qū)域?yàn)樨?fù)壓,以避免氣溶膠從本區(qū)漏出。為避免氣溶膠所致的污染,應(yīng)盡量減少在本區(qū)內(nèi)的布必要走動(dòng),個(gè)別操作如加樣等應(yīng)在超凈臺(tái)內(nèi)進(jìn)行。
二、4 擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)
該區(qū)域主要進(jìn)行的操作為擴(kuò)增片段的測(cè)定,本區(qū)是zui主要的擴(kuò)增產(chǎn)物污染來源,因此對(duì)本區(qū)的壓力梯度要求為相對(duì)鄰近區(qū)域?yàn)樨?fù)壓,以避免擴(kuò)增產(chǎn)物從本區(qū)擴(kuò)散至其他區(qū)域。
三、污染的預(yù)防與控制
PCR實(shí)驗(yàn)室設(shè)計(jì)的核心問題是如何避免污染,在試劑工作中,常見的有以下幾種污染類型:擴(kuò)增產(chǎn)物的污染;天然基因組DNA的污染;試劑的污染以及標(biāo)本間的污染。一旦發(fā)生污染,實(shí)驗(yàn)就必須停止,直到找到污染源為止,而且實(shí)驗(yàn)結(jié)果必須作廢,需要重新進(jìn)行實(shí)驗(yàn),所以發(fā)生污染后再圍繞實(shí)驗(yàn)室來尋找污染源不但耗時(shí)而且繁瑣,浪費(fèi)人力物力。因此要避免污染,首先應(yīng)該是預(yù)防,而不是排除。
三、1 工作區(qū)域的嚴(yán)格劃分
1、各個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)域設(shè)置合理;
2、各個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)域要有明顯的標(biāo)記(如醒目的門牌或不同顏色的地面等等),以避免各個(gè)不同實(shí)驗(yàn)區(qū)域設(shè)備物品、試劑等發(fā)生混淆。
三、2 合理的系統(tǒng)設(shè)置
1、合理的空調(diào)通風(fēng)系統(tǒng)設(shè)置,盡量采用全送全排的空調(diào)系統(tǒng);
2、嚴(yán)格的氣流壓力控制,保證不同的實(shí)驗(yàn)區(qū)內(nèi)不同的壓力要求。
三、3 規(guī)范的操作
1、擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室的技術(shù)人員必須進(jìn)行上崗培訓(xùn),經(jīng)培訓(xùn)合格后才能從事臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)的工作;
2、在實(shí)驗(yàn)操作過程中,操作者必須戴手套,并經(jīng)常更換。此外,操作中使用一次性帽子也是一個(gè)有效防止污染的措施;
3、清潔工作及時(shí)、正確。實(shí)驗(yàn)工作結(jié)束后,必須立即對(duì)本區(qū)進(jìn)行清潔。除了常規(guī)的消毒液體對(duì)表面進(jìn)行擦拭消毒或紫外燈的消毒外,對(duì)一些實(shí)驗(yàn)設(shè)備還應(yīng)進(jìn)行高壓消毒處理。
三、4 嚴(yán)格的管理
1、嚴(yán)格控制進(jìn)出實(shí)驗(yàn)室的人員,與實(shí)驗(yàn)無關(guān)的人員不得隨意進(jìn)出實(shí)驗(yàn)室,有條件的情況下要設(shè)置獨(dú)立的通道和進(jìn)出整個(gè)實(shí)驗(yàn)區(qū)的門;
2、盡量減少在實(shí)驗(yàn)區(qū)內(nèi)不必要的走動(dòng)以及減少交叉污染的可能;
3、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)是zui主要的擴(kuò)增產(chǎn)物污染來源,廢液不能再實(shí)驗(yàn)室中傾倒,必須經(jīng)消毒液浸泡消毒后在遠(yuǎn)離實(shí)驗(yàn)室的地方棄掉,用過的吸頭等一次性材料也應(yīng)該經(jīng)過消毒液浸泡后統(tǒng)一處理,如焚燒等;
4、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)可能會(huì)用到某些可致基因突變和有毒物質(zhì),應(yīng)特別注意實(shí)驗(yàn)室人員的安全防護(hù);
三、5 完善的實(shí)驗(yàn)室配套設(shè)備
完備的實(shí)驗(yàn)室設(shè)施是保證實(shí)驗(yàn)工作的必要條件,應(yīng)根據(jù)各個(gè)實(shí)驗(yàn)室實(shí)驗(yàn)內(nèi)容的不同配備相應(yīng)的設(shè)備和儀器,如超凈工作臺(tái),離心機(jī)。加樣器等等。
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