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WB過程中需要注意的細(xì)節(jié)

來源:上海滬震生物科技有限公司   2021年11月29日 15:43  

WB是檢測蛋白質(zhì)及蛋白質(zhì)翻譯后修飾的經(jīng)典方法,可在簡單或復(fù)雜的生物樣品中提供有關(guān)靶蛋白的半定量或定量數(shù)據(jù),WB步驟復(fù)雜,

通常包括:蛋白樣本制備→電泳→轉(zhuǎn)膜→封閉→孵育一抗→孵育二抗→顯影→分析,



圖片

WB任何過程中出現(xiàn)的漏洞均可影響結(jié)果的靈敏度和重復(fù)性,必須注意將WB的每個步驟標(biāo)準(zhǔn)化,今天給大家分享WB各個過程中需要注意的細(xì)節(jié)?。。?/span>

01

蛋白樣品的制備

按組織凈重(g):裂解液體積(ml)=1:10的比例加入相應(yīng)體積的裂解液(加入終濃度為1mM的PMSF、適當(dāng)濃度的蛋白酶抑制劑和磷酸化酶抑制劑,以避免內(nèi)源性酶分解蛋白,影響蛋白質(zhì)的抽提)進(jìn)行勻漿。

蛋白質(zhì)的樣品制備是westemblotting的第一步,也是關(guān)鍵步驟,要想獲得所有蛋白質(zhì),應(yīng)注意以下問題:

(1)在合適的鹽濃度下,應(yīng)保持蛋白質(zhì)的最大溶解性和可重復(fù)性;

(2)選擇合適的表面活性劑和還原劑,破壞所有非共價結(jié)合的蛋白質(zhì)復(fù)合物和共價二硫鍵,使其形成各自多肽的溶液;

(3)盡量去除核酸,多糖,脂類等分子的干擾,在裂解完畢離心之后小心取中層澄清溶液,注意不要吸到底層沉淀和上層脂類;

(4)防止蛋白在處理過程中的人為修飾,制備過程必須在低溫下進(jìn)行,以避免細(xì)胞破碎釋放出各種酶類的修飾。(注意:可以適當(dāng)加入PMSF等酶抑制劑)

(5)樣本制備完后分裝保存,但是注意不要反復(fù)凍融。

02

凝膠的制備

30%的PAG配置完后過濾于4C保存,10% SDS室溫保存。AP不穩(wěn)定,用時現(xiàn)配。(注意:分子量較小的蛋白選用較大濃度的凝膠)

制膠關(guān)鍵是聚合時間,分離膠聚合控制在從加入10% AP和TEMED至開始凝膠,時間為10-20min(未*凝聚),濃縮膠最佳聚合時間為8-10min,可通過控制AP和TEMED量來控制。AP和TEMED的量過高,局部膠疑的太快,會使疑膠不均勻,電泳蛋白條帶會彎曲。環(huán)境溫度較高時,應(yīng)減少AP和TEMED的量??諝庵醒鯕庖矔绊懩z的聚合,所以在分離膠上面應(yīng)加一層水或正丁醇以隔絕氧氣。

03

電泳常見問題

(1)條帶出現(xiàn)微笑現(xiàn)象(中間凹兩邊翹起):主要是凝膠中間部分凝固不均所致,應(yīng)待凝膠充分凝固后電泳,或者催化劑加入后充分混勻;

(2)條帶出現(xiàn)“皺眉”現(xiàn)象(中間鼓坡兩邊向下):兩玻璃板之間底部氣泡所致,應(yīng)排除底部氣泡;

(3)帶出現(xiàn)拖尾現(xiàn)象:主要是樣本溶解效果不佳,分離膠濃度過大,電泳緩沖液放置時間過長。建議:加樣前離心,選擇適當(dāng)?shù)臉颖揪彌_液,加適量的樣品促溶劑;使用新配置的電泳緩中液,降低凝膠濃度或使用梯度凝膠。

(4)蛋白條帶出現(xiàn)紋理現(xiàn)象:樣品不溶性顆粒引起的。建議:加樣前離心,加入適量的促溶劑。

(5)指示的澳酚藍(lán)已跑出底板,但蛋白質(zhì)未跑下來:與緩沖液和分離膠的濃度有關(guān)應(yīng)更換正確PH值的緩沖液,降低凝膠濃度或使用梯度凝膠。

04

轉(zhuǎn)印

濕式電轉(zhuǎn)印注意事項(xiàng):

(1)要使蛋白質(zhì)組分能有效的從凝膠轉(zhuǎn)移到固相紙膜上,緩沖液的PH值很重要,有些分子量不是很大的蛋白質(zhì)區(qū)帶,即使延長電轉(zhuǎn)印時間也不能從凝膠轉(zhuǎn)移到膜上。這是由于蛋白質(zhì)在轉(zhuǎn)移緩沖液中恰好處于等電點(diǎn)狀態(tài)造成的,因此應(yīng)適當(dāng)改變轉(zhuǎn)移緩沖液的PH,以利于轉(zhuǎn)膜。另外,對于分子量較小的蛋白質(zhì),可在緩沖液中加入適量甲醇,因?yàn)榧状寄艽龠M(jìn)它們固定在固相膜上。但是對于大分子量的蛋白質(zhì),尤其是堿性蛋白質(zhì),緩沖液中是不宜加入甲醇的,因?yàn)榧资鼓z孔徑變小,不利于分子量較大的蛋白的轉(zhuǎn)移,甲醇能將結(jié)合在堿性蛋白質(zhì)上的SDS解離出來而使其帶正電或呈電中性蛋白質(zhì)就更難從凝膠中轉(zhuǎn)移出來;

(2)電轉(zhuǎn)印膜的選擇:有NC膜、重氮化膜和陽離子尼龍膜,PVDF膜。其中NC膜使用的最為普遍,它的蛋白質(zhì)容量大,可用各種染色方法進(jìn)行檢測,但是它與蛋白質(zhì)的結(jié)合是非價性的,膜干燥后很脆。此外膜的孔徑大小也是考慮的重要因素,目的蛋白30KD以下用0.22 um孔徑的NC膜,30KD以上用0.45 um孔徑的NC膜;

(3)轉(zhuǎn)印選擇恒流,每個轉(zhuǎn)印槽150 mA,10KD以下轉(zhuǎn)印40min,10-30KD轉(zhuǎn)印50min,30-100KD轉(zhuǎn)印70min,100kd以上轉(zhuǎn)印80min,轉(zhuǎn)印完畢可用麗春紅S染膜檢測轉(zhuǎn)印是否成功,轉(zhuǎn)印結(jié)束后去除NC膜置于麗春紅S溶液中,室溫5-10min即可看見紅色條帶,用TBS洗數(shù)次即可洗掉紅色條帶進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

05

封閉

(1)電泳轉(zhuǎn)膜過后,膜上其他沒有結(jié)合蛋白質(zhì)的空白位置需要用封閉液加以封閉,以避免一抗或二抗非特異性結(jié)合。這是由于WB的靈敏度很大程度上取決于封閉的好壞,封閉時間過長(過度封閉)導(dǎo)致抗原表位的遮蔽,從而降低檢測靈敏度,封閉時間過短(不*封閉)又會導(dǎo)致最終背景增高或信噪比太低,因此封閉液的選擇和條件的優(yōu)化很重要;

(2)封閉液中應(yīng)加入適量的防腐劑,避免封閉蛋白變性影響封閉效果。

06

抗體的雜交

(1)若非特異性條帶過多,可適當(dāng)降低抗體的濃度,增加洗膜次數(shù),蛋白電泳前延長變性時間,減少上樣蛋白量,延長封閉時間;

(2)若信號弱,可能轉(zhuǎn)膜不*,可優(yōu)化轉(zhuǎn)移時間和電流,增加抗體的濃度,適當(dāng)延長曝光時間;

(3 )若背景較高,可適當(dāng)降低抗體的濃度,過濾二抗,延長封閉時間,增加漂洗時間,減少曝光時間。

07

檢測

(1)膠片曝光幾秒到數(shù)分鐘,具體情況要看膜上化學(xué)發(fā)光條帶明暗強(qiáng)度而定。膠片曝光時間不宜過長,時間過長會照成膠片背景變深。沖洗膠片以確定所測抗原的正確曝光時間;

(2)沖洗膠片的步驟:曝光完的膠片先在顯影液中沖洗至出現(xiàn)條帶為止,一般在1min以內(nèi),時間過長也會照成膠片背景變深。再放入定影液中漂洗,十秒即可顯影液漂洗完后,要多用清水沖洗,以免定影液中成分殘留在膠片上。

08

WB疑難解析

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