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一、按照不同用途，DNA合成儀可分為實(shí)驗(yàn)室型，工業(yè)型和大規(guī)模合成三種主要類型。
1，實(shí)驗(yàn)室型：主要指合成通量較小，且單柱合成產(chǎn)物為10-1000nmol的DNA合成儀，一般為合成柱數(shù)低于48柱（含）的DNA合成儀，主要適用于化學(xué)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室，或某些剛起步的商業(yè)機(jī)構(gòu)。
2，工業(yè)型
工業(yè)型合成儀,主要指合成通量大，且單柱合成產(chǎn)物為10-1000nmol的DNA合成儀。工業(yè)型合成儀常見的合成柱數(shù)為96柱、192柱，384柱或更多合成柱數(shù)的合成儀較為鮮見。主要適用于大型實(shí)驗(yàn)室，公用實(shí)驗(yàn)平臺(tái)及商業(yè)合成機(jī)構(gòu)。
該類型DNA合成儀較實(shí)驗(yàn)室型品牌相對(duì)較少。在歐洲，polygen96柱合成工作站及384柱合成塔也是較常見的工業(yè)型合成儀之一。
3，大規(guī)模合成型
大規(guī)模合成型主要指單柱合成產(chǎn)物量可達(dá)數(shù)克，甚至數(shù)公斤的合成儀，主要用于原料藥制備等科研或商業(yè)用途。
二、按試劑堿基添加方式分類，DNA合成儀可分為電磁閥氣動(dòng)驅(qū)動(dòng)，蠕動(dòng)泵驅(qū)動(dòng)兩種類型。
1，電磁閥氣動(dòng)驅(qū)動(dòng)型：采用高于大氣壓的惰性氣體（氬氣，氮?dú)饣蚝猓閴A基試劑溶液的驅(qū)動(dòng)方式，通過微量電磁閥的開合添加試劑或堿基溶液。
2，采用蠕動(dòng)泵驅(qū)動(dòng)型：采用精密蠕動(dòng)泵為堿基試劑溶液的驅(qū)動(dòng)方式，通過蠕動(dòng)泵驅(qū)動(dòng)，滑塊的相互滑動(dòng)選擇添加不同堿基試劑溶液。
三、按產(chǎn)物承載容器分，可分為需要一次性合成柱，無需一次性合成儀兩類。
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