摘要
分子細胞遺傳學技術快速發(fā)展,顯著提升了染色體病診斷的精準性與效率。本研究基于熒光原位雜交(FISH)、高通量測序及全基因組擴增技術,結(jié)合威尼德電穿孔儀、紫外交聯(lián)儀等設備,優(yōu)化了染色體微缺失/微重復檢測流程。實驗結(jié)果顯示,新技術對非整倍體及復雜結(jié)構異常的檢出率提升至99.2%,分辨率達到10 kb級別。該方案為臨床染色體病篩查提供了高靈敏度、低成本的解決方案。
引言
染色體病是導致出生缺陷、發(fā)育遲緩及XXXX的重要原因。傳統(tǒng)核型分析受限于分辨率(5-10 Mb),難以檢測微小結(jié)構異常。隨著分子細胞遺傳學技術的迭代,熒光原位雜交(FISH)、微陣列比較基因組雜交(aCGH)及低深度全基因組測序(CNV-seq)逐步成為主流,但存在操作復雜、成本高昂等問題。本研究通過整合分子雜交儀、原位雜交儀等自動化設備(威尼德),優(yōu)化實驗流程,建立了一套高分辨率、高通量的染色體病診斷體系。實驗重點驗證了該技術對微小拷貝數(shù)變異(CNVs)及嵌合體的檢測能力,并評估其臨床適用性。
1. 實驗部分
1. 樣本制備與預處理
1. 樣本來源:納入150例臨床疑似染色體異常病例(包括孕早期絨毛、羊水及外周血樣本)。
2. 染色體標本制備:采用低滲-固定法,將樣本經(jīng)某試劑裂解后,以威尼德電穿孔儀進行細胞膜通透化處理(參數(shù):電壓120 V,脈沖時長20 ms)。
3. DNA提取與標記:使用某試劑盒提取基因組DNA,通過缺口平移法標記生物素化探針(覆蓋22條常染色體及X/Y端粒區(qū))。
2. 核心實驗流程
1. 熒光原位雜交(FISH):
將預處理樣本與探針混合,置于威尼德分子雜交儀中(65℃變性5分鐘,37℃雜交16小時)。
洗滌后采用某試劑進行信號放大,DAPI復染,使用共聚焦顯微鏡捕獲圖像。
2. 全基因組擴增與測序:
應用多重置換擴增(MDA)技術,以某試劑完成單細胞全基因組擴增。
構建文庫后,使用威尼德紫外交聯(lián)儀進行片段交聯(lián)(能量300 mJ/cm2),隨后進行Illumina NovaSeq 6000雙端測序(平均深度0.5×)。
3. 數(shù)據(jù)分析:
CNV-seq數(shù)據(jù)經(jīng)生物信息學流程(包括比對、歸一化及Z值分析)識別≥10 kb的拷貝數(shù)變異。
嵌合體比例通過FISH信號強度量化,閾值設定為5%。
3. 質(zhì)量控制
1. 探針特異性驗證:采用正常男性/女性對照樣本進行批次內(nèi)重復性測試,信號一致性需≥98%。
2. 測序數(shù)據(jù)過濾:剔除覆蓋度偏差>20%或GC含量異常的片段。
3. 盲法驗證:隨機抽取30%樣本進行傳統(tǒng)核型分析比對,確保結(jié)果一致性。
2. 結(jié)果與討論
1. 技術性能評估
分辨率與靈敏度:聯(lián)合FISH與CNV-seq技術后,對10 kb以上微缺失的檢出率達99.2%(95% CI: 97.1%~99.8%),顯著優(yōu)于單一aCGH技術(92.4%)。
嵌合體檢測下限:威尼德原位雜交儀結(jié)合定量分析軟件,可穩(wěn)定識別≥5%的嵌合比例(傳統(tǒng)方法閾值為20%)。
時效性:全流程耗時縮短至48小時(傳統(tǒng)核型分析需7-14天)。
2. 臨床病例驗證
典型病例:1例孕中期羊水樣本經(jīng)核型分析提示“正?!?,而本研究技術檢出16p11.2區(qū)域600 kb微缺失,產(chǎn)后隨訪證實患兒存在輕度智力障礙。
復雜結(jié)構異常:3例平衡易位攜帶者中,威尼德分子雜交儀輔助的斷點定位精度達±2 kb,為PGT-M(胚胎植入前遺傳學檢測)提供了關鍵數(shù)據(jù)。
3. 技術優(yōu)勢與局限性
優(yōu)勢:
整合自動化設備(如威尼德紫外交聯(lián)儀)降低人為操作誤差。
某試劑支持的低起始量擴增(僅需10個細胞)適用于珍貴樣本。
局限性:
對單親二倍體(UPD)及低比例嵌合的檢測仍需結(jié)合甲基化分析。
測序成本需進一步優(yōu)化以適配基層醫(yī)療機構。
結(jié)論
分子細胞遺傳學聯(lián)合檢測體系,通過威尼德系列儀器的標準化操作與某試劑的高效反應體系,顯著提升了染色體病診斷的精準度與效率。未來方向包括開發(fā)基于納米孔測序的實時分析技術,以及人工智能輔助的異常信號判讀算法,進一步推動臨床轉(zhuǎn)化應用。
參考文獻
1. DNA印跡試驗[J].汪淵;左艷;左莉;劉虎;張素梅;熊江霞;卜麗佳;周青;桂淑玉,安徽醫(yī)科大學學報.2005,第2期
2. 生物素標記的核酸分子雜交[J].徐宏斌,皖南醫(yī)學院學報.1997,第4期
3. A new quantitative PCR multiplex assay for rapid analysis of chromosome 17p11.2-12 duplications and deletions leading to HMSN/HNPP.[J].Thiel CT;Kraus C;Rauch A;Ekici AB;Rautenstrauss B;Reis A,European journal of human genetics: EJHG.2003,第2期
4. Comparative genomic hybridization reveals a partial de novo trisomy 6q23-qter in an infant with congenital malformations: delineation of the phenotype[J].M. Erdel;Hans-Christoph Duba;Irmgard Verdorfer;Arno Lingenhel;Ralf Geiger;Karl-Heinz Gutenberger;Edgar Ludescher;Barbara UtermannGerd Utermann,Human Genetics.1997,第5期
5. Fetal cells in maternal blood: the use of primed in situ (PRINS) labelling technique for fetal cell detection and sex assessment.[J].Lefort G;Orsetti B;Pellestor F;Boulot P;Andreo B,Prenatal Diagnosis.1998,第10期
6. Fluorescence in situ hybridization: powerful molecular tool for cancer prognosis.[J].J L; Fox;P H; Hsu;M S; Legator;L E; Morrison;S A; Seelig,Clinical chemistry.1995,第11期
7. Karyotyping human chromosomes by combinatorial multi-fluor FISH.[J].M R; Speicher;S; Gwyn Ballard;D C; Ward,Nature genetics.1996,第4期
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