對蝦白斑綜合癥病毒檢測試劑盒(實時熒光PCR法)說明書
【產(chǎn)品名稱】
通用名稱:對蝦白斑綜合癥病毒(WSSV)檢測試劑盒(實時熒光PCR法)
英文名稱:White Spot Syndrome Virus Detection Kit (Real-Time PCR Method)
【預期用途】
對蝦白斑綜合癥病毒(White Spot Syndrome Virus,WSSV)是白斑綜合癥桿狀病毒復合體引發(fā)的一種綜合性病癥。白斑綜合癥桿狀病毒復合體主要有皮下及造血組織壞死桿狀病毒、日本對蝦桿狀病毒、系統(tǒng)性外胚層和中胚層桿狀病毒及白斑桿狀病毒。本試劑盒利用實時熒光PCR原理,定性檢測對蝦白斑綜合癥病毒,對對蝦白斑綜合癥病毒的診斷及療效評估有重要指導意義。
【檢驗原理】
本試劑盒針對對蝦白斑綜合癥病毒(WSSV)基因設計特異性引物和探針,在反應體系中含有對蝦白斑綜合癥病毒(WSSV) DNA模板的情況下,PCR反應得以進行并釋放熒光信號。利用儀器對PCR過程中相應通道的信號強度進行實時監(jiān)測和輸出,實現(xiàn)檢測結果的定性分析。
【主要組成成份】
序號 | 組成 | 25T/盒 | 50T/盒 |
1 | WSSV PCR反應液 | 500 μL×1管 | 1000 μL×1管 |
2 | WSSV 陽性對照 | 40 μL×1管 | 40 μL×1管 |
3 | WSSV 陰性對照 | 40 μL 1管 | 40 μL×1管 |
4 | 說明書 | 1份 | 1份 |
注:陰性對照為滅菌純水,陽性對照為含對蝦白斑綜合癥靶基因的質粒。
【儲存條件及有效期】避光-20℃以下保存,避免反復凍融,有效期12個月。
【適用儀器】ABI 系列、Bio-Rad系列、Agilent Stratagene MX系列 、Roche LightCycler 480、Cepheid SmartCycler、Rotor-Gene系列、杭州博日系列等多通道實時熒光定量PCR儀。
【樣本要求】
1. 樣品:受精卵、3cm以下幼蝦、仔蝦、幼體采集整條對蝦作為樣品;成蝦采集上皮、肝胰腺、腸或鰓作為樣品。
2. 標本收集后若不能立即檢測,可置于2~8℃冷藏過夜保存;如需長期保存,標本應凍存于-20℃~-80℃。
3. 標本保存期間應避免反復凍融。
【檢驗方法】
1. 試劑準備(試劑準備區(qū))
(1)從冰箱中取出試劑盒, 從試劑盒中取出實驗所需試劑,充分融化混勻并瞬時離心以去除管壁附著液體。
(2)核算當次實驗所需要的反應數(shù)(n),并根據(jù)如下表所示反應體系計算當次實驗所需要的各種試劑量。
n =陰性對照數(shù)(1T)+陽性對照數(shù)(1T)+誤差預留量(1T)+樣本數(shù)
單反液配制表(每份) | PCR反應液(UNG酶及Taq酶) | 20 μL |
(3)在無菌離心管中加入上述試劑,充分混勻后瞬時離心。按照20 μL/管分裝量將試劑分裝至PCR反應管。
(4)蓋緊PCR反應管蓋后將PCR反應管轉移至樣本處理區(qū)。 剩余試劑放回-20℃以下冰箱冷凍保存。
2.樣本準備(樣本處理區(qū))
用DNA/RNA提取試劑盒提取核酸即可,具體操作按照其試劑盒說明書操作。
3.加樣
在上述制備好的PCR反應樣本管中分別加入處理好的待測標本DNA各5μl、終體積25μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉移到PCR儀器上。陰性對照和陽性對照管則各加5μL試劑盒自帶的陰性對照或陽性對照品,終體積為25μl/管,蓋好PCR反應蓋混勻后瞬時低速離心,轉移到PCR儀器上。
4.PCR(PCR擴增區(qū))
(1)取樣本處理區(qū)準備好的PCR反應管,放置在實時熒光定量PCR儀樣品槽相應位置,并記錄放置順序。
(2)按下表設置儀器核酸擴增相關參數(shù)進行PCR擴增。
反應體積 | 25 μL | 通道選擇 | FAM通道采集 WSSV 熒光信號 |
PCR 反應 條件 | 步驟 | 條件 | 循環(huán)數(shù) |
UNG處理 | 37℃:2分鐘(min) | 1 | |
預變性 | 95℃:3分鐘(min) | 1 | |
PCR擴增 | 95℃:5秒(s) | 40 | |
55℃:40秒(s) (此階段結束時采集熒光信號) |
注:ABI系列熒光PCR儀在設置時不選ROX校正,設置淬滅基團選擇None。
【參考值(參考范圍)】
1.試劑盒有效性判定:
(1)陽性對照:有典型S型擴增曲線或Ct值≤35。
(2)陰性對照:Ct值>38或無Ct值,線形為直線或輕微斜線,無指數(shù)增長期。
2.標本結果判定:
(1)陽性:標本檢測結果Ct值≤35或有明顯指數(shù)增長期。
(2)可疑:標本檢測結果Ct值在35~38范圍內。此時應對標本進行重復檢測,如重復實驗結果Ct值仍在35~38范圍內,有明顯指數(shù)增長期,則判定為陽性,否則為陰性。
(3)陰性:標本檢測結果Ct值>38或無Ct值。
【檢驗結果的解釋】
通道及檢測結果 | 標本檢測結果解釋 |
FAM | |
陽性(+) | 標本中檢測出WSSV |
陰性(-) | 標本中未檢出WSSV |
【檢驗方法的局限性】
1. 當檢測樣本中被檢核酸濃度低于本試劑盒的最di檢出限shi可能會發(fā)生假陰性的結果。
2. 被檢樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中操作方式不當容易造成DNA降解而產(chǎn)生假陰性結果。
3. 樣本在采集、運輸、儲存以及處理過程中發(fā)生交叉污染,則容易得到假陽性結果。
【產(chǎn)品性能指標】 產(chǎn)品的最di檢出限為103Copies/mL,產(chǎn)品CV值≤3%。
【注意事項】
1. 使用本試劑盒的實驗室,應嚴格按照國家有關部分頒布的有關基因擴增檢驗實驗室管理規(guī)范進行管理;
2. 為避免DNA降解,樣本處理過程應在0-4℃條件下操作,且完成實驗后立即上機檢測;樣本處理過程中使用的器具耗材應經(jīng)過無核酶處理;
3. 各區(qū)域物品均為專用,不得交叉使用,以免污染;檢測結束后,應立即對工作臺清潔;
4. 吸取反應液時,應盡量避免產(chǎn)生氣泡;上 PCR 儀前,應注意檢查各反應管是否蓋緊,以免液體蒸發(fā)造成結果不準確;
5. 試劑盒所有試劑在使用前應該在常溫下充分融化混勻,并應瞬時離心;
6. 試劑盒內所配陰性和陽性對照在第一次使用前應全部轉移至標本準備區(qū),并單獨存放;
7. 為防止熒光干擾,應避免裸手直接接觸PCR反應管,并應避免在PCR反應管上進行任何標記;
8. 檢測過程中使用過的吸頭,應直接打到盛有 10%次氯酸的廢物缸內,檢測結束的PCR 反應管,切忌開蓋,并與其他廢棄物品一同滅菌后丟棄;工作臺及各種實驗用品應定期用 10%次氯酸、75%酒精或紫外燈進行消毒;
9. 儀器擴增相關參數(shù)應按照本說明書相關要求進行設置;不同批號試劑不能混用;并在有效期內使用。
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