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研究揭示檢測人體外源DNA的新技術(shù)

來源:上海撫生科技發(fā)展有限公司   2014年12月17日 12:46  

    研究人員早就懷疑一些類型的癌癥和自體免疫疾病可能是由于細(xì)菌或病毒的遺傳物質(zhì)溜進(jìn)我們?nèi)梭w的DNA而引起的,但要跟蹤這些入侵DNA是一項(xiàng)艱巨的任務(wù)。一項(xiàng)公布于《自然遺傳學(xué)》上的新遺傳學(xué)技術(shù),可能會幫助研究人員查出這些潛藏在病人基因內(nèi)的“內(nèi)奸”。

    子宮癌的研究為傳染性疾病能夠?qū)е掳┌Y這一觀點(diǎn)提供了的證據(jù)。人體乳頭瘤病毒(human papillomavirus ,HPV)能夠引起生殖器疣,在90%以上的子宮癌腫瘤中都有出現(xiàn)。哈佛大學(xué)波士頓醫(yī)學(xué)院的病理學(xué)家Matthew Meyerson和他的同事利用子宮癌作為檢測實(shí)例來檢測病人體內(nèi)的外源基因。

    將收集自人體子宮癌細(xì)胞的7073個活化基因序列組成的計(jì)算機(jī)文庫與人類基因組計(jì)劃測序完畢的基因組J數(shù)據(jù)庫以及其它人類和小鼠序列數(shù)據(jù)庫做了比較,所有這些基因都假定來自健康個體。文庫中有22個基因與數(shù)據(jù)庫中的序列不符。研究人員排除了其中的20個基因,剩下的zui后兩個基因序列是來自HPV-18病毒的無效環(huán)狀DNA。HPV-18是早先查明的與子宮癌有關(guān)聯(lián)的感染原。

    斯坦福大學(xué)的微生物學(xué)家David Relman認(rèn)為這個方法很有前途。但他警告說;“當(dāng)你偶然碰到1個轉(zhuǎn)錄不符合的HPV和子宮癌實(shí)例時(shí),挑戰(zhàn)就來了。”他懷疑我們的DNA也許已積累了相當(dāng)一部分無害的微生物小DNA片段,因而要從這些雜亂的“無害合居者”背景中發(fā)現(xiàn)病原體的蹤跡是一項(xiàng)艱巨的任務(wù)。

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