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北京諾博萊德科技有限公司

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3MM濾紙 WHATMAN 3030-861

點擊次數(shù):2926 發(fā)布時間:2016-4-25

3MM濾紙 WHATMAN 3030-861

3MM濾紙 WHATMAN 3030-861

3MM層析濾紙20x20cm/張 

 

【實驗?zāi)康摹?/span>

掌握RNA印跡技術(shù)的基本原理,學(xué)習(xí)RNA印跡技術(shù)的操作方法,了解RNA印跡技術(shù)的意義與應(yīng)用。

【實驗原理】

將RNA變性及電泳分離后,轉(zhuǎn)移到固相支持物上,用于與DNA探針雜交以鑒定其中特定RNA分子的大小與含量?;驹砼cSouthern印跡相同,但RNA變性方法與DNA不同,不能用堿變性,因為堿會導(dǎo)致RNA的水解。

Northern印跡主要用于組織細(xì)胞靶基因表達(dá)水平的研究以及對同一組織細(xì)胞的不同基因間的表達(dá)水平進(jìn)行比較,或者對不同組織細(xì)胞間相同基因的表達(dá)水平進(jìn)行比較。

【實驗對象】

待測RNA樣品。

【試劑與器材】

1. 焦碳酸二乙酯 (DEPC)。

2. 甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳所需試劑。

3. 0.5 mol / L乙酸銨(NH4Ac)。

4. 溴化乙啶 (EB):0.5μg/ml,溶于0.5mol/L乙酸銨中。

5. 0.05mol / L NaOH/1.5mol/L NaCI(選用)。

6. 0.5mol / L Tris·CI (pH 7.4) /1.5mol/L NaCl(選用)。

7. 20×SSC、6×SSC和2×SSC。

8. 亞甲藍(lán)(終濃度為0.03%),溶于0.3mol / L (pH 5.2)的乙酸鈉緩沖液中 (選用)。

9. *纖維素 (NC) 膜或尼龍膜。

【實驗方法與步驟】

1. RNA甲醛變性凝膠電泳(5V/cm, 3h),(見附錄三)。

電泳結(jié)束后用EB染色:取出凝膠,切下需要染色的泳道,放置于無RNA酶的玻璃平皿,加入0.5mol /L乙酸銨浸泡20min。換液再浸泡20min以除去甲醛,將凝膠轉(zhuǎn)入含0.5(g / ml EB的0.5mol /L乙酸銨溶液中染色40min,必要時,以0.5mol / L乙酸銨脫色1h。

3.在紫外透射儀中使凝膠中的RNA顯跡,沿凝膠的邊緣放一把尺子拍照,以便隨后能確定膜中的條帶。

4.將非染色的部分凝膠放置于無RNA酶的玻璃平皿中,加足夠的DEPC處理的去離子水浸洗幾次以除去甲醛。

5. 凝膠浸泡在10倍體積的0.05mol/L NaOH / 1.5mol/LNaCl中30min,使RNA部分水解。接著浸泡于10倍體積的0.5mol/L Tris·C1(pH 7.4) / 1.5mol/LNaCl緩沖液中和30min (可選), 將膠的多余部分切除,并切邊標(biāo)記。

6. 將溶液換成10倍體積的20×SSC,浸泡45min。

7. 在一玻璃或塑料平皿中放置-塊比凝膠略大的有機玻璃作為平臺(必要時,可并排放兩塊或更多) ,加入足夠的20×SSC以使平臺半淹沒在液體中。

8. 構(gòu)筑轉(zhuǎn)移平臺,剪3張與平臺同樣大小的Whatman 3MM濾紙,放在平臺表面,以20×SSC潤濕。把凝膠置于濾紙表面,用玻棒滾動表面以壓擠去除氣泡。切4條塑料保鮮膜覆蓋在凝膠的邊緣。

9.剪一片與凝膠暴露面積大小相當(dāng)?shù)哪猃埬せ騈C膜,在一個無RNA酶的玻璃平皿中加入約0.5mm深的用DEPC處理的去離子水,將膜漂在水面使之潤濕,直至膜沉沒在水中。如果是尼龍膜,只需讓膜在水中泡上5min,如果是NC膜,則換成20×SSC再浸泡10min。

10.將潤濕的膜放在凝膠表面,用干凈刀片切去濾膜一角,使其與凝膠的切角相對應(yīng),排去氣泡,以20×SSC漂洗膜表面。切 3張與膜大小相當(dāng)?shù)臐駶櫟腤hatman3MM濾紙,放于膜的表面。趕出氣泡。然后將與膜大小相當(dāng)?shù)募埥碚R地堆放在濾紙的表面,高約4cm。

11. 在紙堆的頂部放一塊玻璃平板,壓一重物 (0.2~0.4kg),放置12h左右。

12.拆卸轉(zhuǎn)移裝置,回收膜和壓扁了的凝膠。在膜上用鉛筆標(biāo)上加樣孔的位置和方向。

 

13.用2×SSC洗膜,然后放于濾紙上,讓膜于室溫干燥30分鐘。NC膜則應(yīng)夾于2張Whatman 3MM濾紙之間,80℃真空干烤2h。將干的轉(zhuǎn)印膜置于可透過紫外線的塑料保鮮膜中,帶有RNA的一面朝下,置于紫外透射儀(波長在254nm)上,以合適的照射強度進(jìn)行紫外線交聯(lián),以固定RNA。備作核酸雜交。

14. 凝膠可按步驟2,用EB染色以檢查轉(zhuǎn)印效率。

【注意事項】

1.為了抑制RNA酶的活性,所有用于Northern印跡的溶液,均須用經(jīng)DEPC處理過的無菌去離子水配制。DEPC是一種致癌劑,須小心操作。尤其在用DEPC處理乙酸銨時,因為DEPC能與銨離子反應(yīng)產(chǎn)生氨基甲酸乙酯(一種潛在的致癌劑),故在以DEPC處理乙酸銨時,更須分外小心。

2.RNA極易被環(huán)境中存在的RNA酶降解,因此須特別警惕RNA酶的污染

 用途:本品僅供科研,不得用于其它用途。

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