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專業(yè)銷售 德國 DECODON Delta2D蛋白質(zhì)雙向電泳凝膠分析軟件

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更新時間:2024-06-18 18:58:25瀏覽次數(shù):1193

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德國 DECODON Delta2D蛋白質(zhì)雙向電泳凝膠分析軟件

詳細介紹

德國 DECODON 公司之 Delta2D 分析軟件在雙向凝膠(2D 及DIGE)分析中*應(yīng)用點對點圖像變形技術(shù)(warping) ,通過簡單步驟,使用TIGR Multiple Experiment Viewer 數(shù)學程式 (MeV, version 4.0, tm4.org/mev.html, Saeed et al. 2003) 并配合全新*智能向量技術(shù) (SmartVectors™ Technology)更快, 更有效, 更準確進行2D凝膠圖像處理

1. 有效消除不同2D凝膠間于跑膠時所產(chǎn)生的微少區(qū)別, 免去一系列冗長枯燥的斑點匹配和邊界確定的編輯工作,并可視化比較斑點, 達致* 斑點匹配 (* Spot Matching)。

2. 配合融合圖像技術(shù)(Image Fusion),把多個圖像透過點對點變形合并到一個新的圖像中。從而創(chuàng)建一個擁有所有能收集到的斑點的蛋白組圖譜(proteome map) 或 把多個平行實驗精簡到單個平均圖像來進行分析。

3. 實時網(wǎng)上偵察和量化分析 (GenBank , GenoList 及其它),你能更快更簡單分析眾多的2-D膠和DIGE膠, 并能取得更多信息。
4. 能完整及準確表達2-D 及DIGE 電泳圖像, 并能進行管理和注釋斑點信息, 報告和導(dǎo)出結(jié)果。5. 2010年發(fā)表的相關(guān)文章:Delta2D 和 Proteomweaver:兩款2-DE分析工具的性能評估
主要內(nèi)容如下:
Delta2D 和 Proteomweaver:兩款2-DE分析工具的性能評估
 
Delta2D and Proteomweaver: Performance evaluation of  two different
approaches  for 2-DE analysis
 
Electrophoresis 2010,  31, 1311–1317
Renato Millioni1、Manuela Miuzzo2、Stefano Sbrignadello、Ellen  Murphy11,3、Lucia  Puricelli1、Andrea Tura3、Elisa  Bertacco1、Marcello Rattazzi1、Elisabetta Iori1、Paolo Tessari1
 
電泳學雜志《Electrophoresis》于2010年31卷發(fā)表了一篇Decodon公司的2-DE(2D凝膠電泳)分析軟件Delta2D (D2D)與另一款同類分析軟件Proteomweaver (PW)性能比較的文章,題目是:《Delta2D 和 Proteomweaver:兩款2-DE分析工具的性能評估》。主要內(nèi)容如下:
 
2-DE是研究蛋白質(zhì)組的重要手段。然而,盡管2-DE技術(shù)能夠同時高效分離多個蛋白質(zhì),但該技術(shù)的不足之處在于重復(fù)性差,特別是在比較不同實驗室的實驗數(shù)據(jù)時尤為明顯。2-DE電泳產(chǎn)生差異的原因主要可分為兩類:實驗過程中造成的和實驗后造成的。實驗過程中差異的出現(xiàn)主要是由物理和化學參數(shù)決定的;而實驗后造成差異的主要原因是使用不同的分析軟件,特別是工作程序的不同。用于分析2-DE的軟件很多,對凝膠圖像的識別與處理方式各不相同;目前為止尚未有相關(guān)研究說明這些分析軟件在2-DE分析過程中的優(yōu)劣。在Electrophoresis 的這篇文章里面,意大利Padua大學的Renato Millioni等人利用Delta2D和 Proteomweaver兩套軟件對相同的凝膠圖像(標準凝膠、實驗?zāi)z圖像)進行分析比較,結(jié)果顯示:對于標準凝膠圖像,比起PW來,D2D的錯漏數(shù)低50%、假陽性數(shù)低77%、陽性正確率高19%,并且斑點匹配率高4%;在實驗?zāi)z圖像的比較中發(fā)現(xiàn)D2D要比PW節(jié)省30%的時間,并且人為參與的部分更少。
 
軟件:Proteomweaver  version  3.0(Bio-Rad, CA, USA)  ,Delta2D  version  4.0  (Decodon, Greifswald,  Germany)
 
凝膠圖像:
實驗?zāi)z圖像:來自Padua大學的Renato Millioni實驗室實驗?zāi)z圖像,共兩組(組A,組B,如圖1)
圖像變形:通過對軟件相關(guān)參數(shù)的設(shè)置模擬凝膠在實驗過程中因各種物理化學參數(shù)產(chǎn)生的凝膠變形。

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