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糞便預(yù)測(cè)大腸癌

時(shí)間:2015-10-19閱讀:793
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根據(jù)一項(xiàng)新的調(diào)查研究顯示,通過(guò)分析大腸癌患者病灶附近的微生物組群相比于傳統(tǒng)的血液檢測(cè)有很多的優(yōu)點(diǎn):靈敏度與特異性都要更高,而且無(wú)創(chuàng)。

“大腸癌患者體內(nèi)的微生物組群構(gòu)成一定會(huì)有相應(yīng)的改變,因?yàn)椴煌幕蛲蛔兛赡軙?huì)造成不同的癌癥類(lèi)型,這些腫瘤也會(huì)對(duì)周?chē)奈⑸锝M造成一定的影響"。來(lái)自民尼蘇達(dá)大學(xué)的Ran Blekhman博士說(shuō)到。

該研究結(jié)果發(fā)表在2015年美國(guó)人類(lèi)遺傳協(xié)會(huì)的會(huì)議上。

在該研究中,Blekhman與同事們比較了正常大腸細(xì)胞與大腸癌腫瘤細(xì)胞間的遺傳差異,他們發(fā)現(xiàn)特定的腫瘤相關(guān)基因突變與特異性的大腸寄生細(xì)菌有很大關(guān)系。  

例如,具有APC基因突變的人群易得腺瘤肉?。ㄒ活?lèi)遺傳性的癌癥),同時(shí)他們體內(nèi)腫瘤組織附近具有大量的梭桿菌。Blekhman博士指出他們實(shí)驗(yàn)室*次分析了這種腫瘤相關(guān)突變與腫瘤周?chē)⑸锝M之間的關(guān)系。

研究者們通過(guò)全基因外顯子測(cè)序的手段分析了腫瘤組織周?chē)ɑ蛘邔?duì)照正常組織周?chē)┑奈⑸锝M的組成。不同的突變往往與特定微生物類(lèi)型種群豐度有相關(guān)性。另外,同一樣品內(nèi)部如果遺傳突變?cè)蕉?,其周?chē)b定出的微生物種群類(lèi)型也就越多。

通過(guò)突變手段,作者們發(fā)現(xiàn)如果腫瘤細(xì)胞內(nèi)葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)通路被阻斷的話(huà),微生物群所需的能量消耗也就越多。這說(shuō)明在某些情況下腫瘤與周?chē)奈⑸镌诟?jìng)爭(zhēng)性地使用體內(nèi)的資源。

之后,研究者們以微生物的種類(lèi)與豐度為標(biāo)準(zhǔn)評(píng)估了一些腫瘤相關(guān)遺傳突變。這一結(jié)果能夠準(zhǔn)確預(yù)測(cè)ZFN717基因的突變。該基因能夠編碼鋅指核酸酶用于DNA的修復(fù)。該結(jié)果也表明我們可以通過(guò)分析患者糞便中的微生物成分大致預(yù)測(cè)腫瘤的類(lèi)型,而且理論上也可以通過(guò)控制腫瘤微環(huán)境預(yù)防、治療癌Dami    巨核細(xì)胞    
SPC-A-1    肺腺癌    
CHMas    肥大細(xì)胞白血病    
SGC-7901    胃腺癌    
HEL    紅細(xì)胞白血病 (Erythroleukemia)    
BGC-823    低分化胃腺癌    
HL-60    原髓細(xì)胞白血病 (Promyelocytic lenukemia)    
LoVo    結(jié)腸腺癌    
Hut-78    皮膚T細(xì)胞淋巴瘤    
Ls-174-T    結(jié)腸腺癌    
Hut-102    皮膚T細(xì)胞淋巴瘤    
HCT-8    回盲腸腺癌    
Namalwa    Burkitt`s淋巴瘤    
HCe-8693    盲腸未分化腺癌    
Jurknt. klone E6-1    白血病細(xì)胞    
HR-8348    直腸腺癌    
THP-1    單核細(xì)胞    
BEL-7402    肝癌    
U937    組織細(xì)胞淋巴瘤    
BEL-7404    肝癌    
Raji    Burkitt's淋巴瘤    
BEL-7405    肝癌    
MEG-01    成巨核細(xì)胞白血病    
HepG2    肝細(xì)胞癌    
L129    NCTC克隆929    
L-M TK    鼠胸腺激酶缺陷細(xì)胞株    
STO    鼠胚成纖維細(xì)胞系    
YAC-1    鼠T淋巴瘤細(xì)胞系    
MA-782    鼠乳腺癌細(xì)胞系    
GR    鼠成纖維細(xì)胞系    
NIH/3T3    鼠成纖維細(xì)胞系    
B16-Fo    鼠黑色素瘤細(xì)胞系    
B16-F1    鼠黑色素瘤細(xì)胞系    

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