生產(chǎn)型制備液相色譜系統(tǒng)可以用于藥物類產(chǎn)品的生產(chǎn)（天然產(chǎn)物類原料藥、發(fā)酵類藥物、多肽類藥物等）；醫(yī)藥中間體和化工中間體；食品添加劑行業(yè)；多肽蛋白分析等。

發(fā)酵液是組成非常復(fù)雜的體系，含有微生物細(xì)胞、代謝產(chǎn)物、未消耗的培養(yǎng)基等。傳統(tǒng)的工藝路線中用離心法和板框過(guò)濾，濾液質(zhì)量差，可溶性蛋白、糖類、多肽、色素等雜質(zhì)均不能被有效去除，增加后續(xù)工藝的處理負(fù)荷，影響提取工藝的整體收率，也影響了最終的產(chǎn)品質(zhì)量;而傳統(tǒng)的固定床樹脂工藝，樹脂用量大，酸堿水消耗高，成本高，環(huán)保壓力大。生產(chǎn)中的典型工藝。

生產(chǎn)型制備液相色譜系統(tǒng)多肽蛋白分析實(shí)例：脫氫睪丸激素、腺(嘌呤核)苷、縮二氨酸、抗菌素、糖肽、人胰生長(zhǎng)激素、胰蛋白酶抑制劑、β-乳球蛋白、尿酸、免疫球蛋白、類葉紅素、人胰島素B鏈、賴氨酸、蘇氨酸、色氨酸、苯丙氨酸等產(chǎn)品的分離純化。

生物工程的各個(gè)分支：基因工程、細(xì)胞工程、酶工程和發(fā)酵工程中，蛋白質(zhì)、多肽、核酸等生物大分子的分離和純化，由于這些生物大分子在分子量、疏水性、熱穩(wěn)定性、化學(xué)穩(wěn)定性、反應(yīng)性能等方面，不同于小分子和中等分子量的化合物，不能用常規(guī)的分離技術(shù)來(lái)分離這些生物大分子。