多年來，腫瘤專家根據(jù)每個患者腫瘤的DNA測序結(jié)果制定靶向治療方案。而近年來，研究發(fā)現(xiàn)，通過RNA測序也能為提供有效的關(guān)鍵信息，且在一些關(guān)鍵基因檢測上更具臨床意義。目前，歐洲的一個研究小組的研究證實，DNA測序的同時進行RNA的測序可以幫助臨床醫(yī)生以更快的速度、更低的成本進行更準(zhǔn)確的癌癥診斷。
該研究項目覆蓋3000例晚期NSCLC腫瘤患者
該回顧性研究是迄今為止同類研究中大的，自2014年7月到2018年4月，對3000例晚期非小細胞肺癌（NSCLC）患者進行了DNA和RNA水平的分析。
據(jù)海德堡大學(xué)醫(yī)院（Heidelberg University Hospital）病理研究所分子病理學(xué)中心主任Albrecht Stenzinger博士介紹，與傳統(tǒng)的單基因測試相比，高通量測序（NGS）所需的組織樣本更少，速度更快，成本更低。Stenzinger博士主持了這項研究，該研究成果最近發(fā)表在國際癌癥雜志中（International Journal of Cancer）。
DNA測序+RNA測序優(yōu)勢顯著
Stenzinger博士與來自德國幾家研究機構(gòu)的多學(xué)科臨床研究團隊開展合作研究。研究結(jié)果表明，同時進行DNA和RNA靶向測序，并依據(jù)其結(jié)果進行腫瘤的診斷，在多方面都優(yōu)于國際臨床診療指南的推薦。他們在研究中所使用的檢測和分析方法經(jīng)過精心設(shè)計，有利于幫助腫瘤專家制定更多樣化的治療方案。
該團隊研究方案是基于Ion AmpliSeq技術(shù)所設(shè)計的，針對實體腫瘤進行分析，利用Ion Torrent測序平臺將周轉(zhuǎn)時間平均縮短到6個工作日（國際指南目前推薦10個工作日）。當(dāng)腫瘤組織量不足時，會存在一定的組織丟棄率；在實驗優(yōu)化過程中，該研究的組織丟棄率從6.5%下降到3.4%，平均所需樣本量為10ng DNA和20ng RNA。
其研究目標(biāo)是為盡可能多的患者獲取合適的診斷信息，NGS尤其是基于Ampliseq技術(shù)的NGS，集多種優(yōu)勢，讓研究者們更易于實現(xiàn)他們的目標(biāo)。他們還強調(diào)了在常規(guī)臨床環(huán)境中，應(yīng)用該方法在病人護理和臨床及轉(zhuǎn)化研究中的個體化治療有很好的可行性。
"RNA檢測至關(guān)重要！"——Stenzinger博士
海德堡大學(xué)醫(yī)院病理研究所分子病理學(xué)中心主任
Albrecht Stenzinger博士
Stenzinger博士說：
我們實驗研究證明了這種一站式的檢測方法，可以從少量的活檢組織中同時提取DNA和RNA，然后對它們進行測序，使我們不僅有機會了解DNA水平上的突變，還可以了解轉(zhuǎn)錄水平的基因融合。 舉個例子，我們不僅可以檢測到一個腫瘤存在ALK基因的易位，也可以檢測到因轉(zhuǎn)錄活躍而產(chǎn)生的ALK-ELM4融合。
雖然目前的指南建議通過熒光原位雜交實驗（FISH）來進行RNA分析，但Stenzinger博士的研究表明，在NSCLC治療中，一些已知的與預(yù)后和療效預(yù)測密切相關(guān)的基因融合，如采用RNA測序檢測，方法學(xué)上更優(yōu)更好?；蛉诤习l(fā)生于兩條染色體上DNA片段的移位；然而，只有轉(zhuǎn)錄成RNA的融合體才有可能被表達并可能導(dǎo)致癌癥。因此，該團隊的研究成果可以幫助醫(yī)生更有效地為患者確定積極的治療和監(jiān)測方案。 Stenzinger博士繼續(xù)說道：
你能立刻知道病人在基因水平發(fā)生了什么問題，以及確定其基因微環(huán)境是否在疾病進展中起到了真正的作用。我們知道TP53突變會影響ALK陽性NSCLC患者的療效和預(yù)后。舉例來說，ALK基因融合某一變體會導(dǎo)致非常低的生存率。 Stenzinger解釋道：
對DNA和RNA同時進行測序，可以為臨床醫(yī)生提供更多信息用于治療方案的選擇和制定。
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