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表觀遺傳學(xué)（Epigenetics）是研究基因的核苷酸序列不發(fā)生改變的情況下，基因表達(dá)的可遺傳變化的一門學(xué)科。DNA甲基化是哺乳動(dòng)物基因組中發(fā)生的表觀遺傳事件之一。DNA分子（胞嘧啶）的甲基化會(huì)影響基因表達(dá)。研究表明，DNA甲基化模式和臨床表型之間有著非常緊密的聯(lián)系，可以用作疾病診斷和指導(dǎo)治療的生物標(biāo)志物，甲基化失衡與腫瘤進(jìn)程關(guān)系密切。
 

賽默飛重磅推出Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測(cè)方案

為此，賽默飛推出用于癌癥研究的Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測(cè)方案，用于研究gDNA或FFPE 樣本gDNA特定基因的甲基化水平。

這一檢測(cè)方案所選擇的檢測(cè)靶點(diǎn)由BLUEPRINT聯(lián)盟所建議。BLUEPRINT聯(lián)盟基于多平臺(tái)多方法學(xué)開展一項(xiàng)大規(guī)模的研究項(xiàng)目，深入分析健康人和患者的基因激活或抑制差異，從而驗(yàn)證出癌癥生物標(biāo)志物。因此，這一檢測(cè)方案是您靶向研究癌組織DNA甲基化水平的可靠方案。

? 檢測(cè)用途：包含40個(gè)擴(kuò)增子（內(nèi)含2個(gè)對(duì)照），用于檢測(cè)38個(gè)靶標(biāo)的甲基化水平，這些靶點(diǎn)涵蓋Bock文獻(xiàn)中所涉及的與結(jié)腸癌，前列腺癌，白血病和淋巴瘤等癌種腫瘤標(biāo)志物相關(guān)的靶標(biāo)。（Bock, C. et al. Nature Biotechnology 34, 726–737 (2016)）

? 優(yōu)勢(shì)：支持FFPE樣本，低樣本起始量（10 ng）即可檢測(cè)DNA甲基化情況，靈敏度高，并配套數(shù)據(jù)解讀方案

? 樣品起始量：10-100 ng/樣本

? 通量：16 samples/530 chip

? 數(shù)據(jù)解讀：配套甲基化分析插件Methylation Analysis Plugin，用于分析每個(gè)擴(kuò)增子甲基化和未甲基化的Reads數(shù)

? 適用范圍：適用于腫瘤標(biāo)志物的開發(fā)和研究，可用于腫瘤患者的樣本，從而尋找腫瘤相關(guān)的特異性甲基化生物標(biāo)志物

客戶體驗(yàn)

加拿大皇后大學(xué)（Queen’s University）

癌癥研究中心主任

 

· Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測(cè)法能幫助您解決哪些實(shí)驗(yàn)問題？

我們的實(shí)驗(yàn)室開發(fā)用于臨床癌癥診斷和管理的生物標(biāo)記物。通過芯片法以及甲基化特異性PCR（MSP），我們已經(jīng)在前列腺癌中鑒定了許多有利于診斷和預(yù)后DNA甲基化位點(diǎn)。我們發(fā)現(xiàn)它們單獨(dú)都無法提供精確的診斷或臨床信息，但結(jié)合起來，它們具有很大的應(yīng)用前景。同時(shí)， MSP很難進(jìn)行多位點(diǎn)檢測(cè)，同時(shí)非常耗費(fèi)人力。生物芯片法需要相對(duì)大量的輸入DNA。因此，以上方法的限制使我們的研究會(huì)遺漏特別感興趣的位點(diǎn)。重要的是，這些方法提供平均甲基化水平，這意味著在癌癥中，良性細(xì)胞可以掩蓋癌細(xì)胞特異性的異常甲基化。

· 為什么您選擇Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測(cè)方案而不是其他方案?

AmpliSeq甲基化測(cè)序靈敏度高、準(zhǔn)確度高，僅需10 ng的樣本就能檢測(cè)幾十個(gè)靶點(diǎn)。除了能夠?qū)崿F(xiàn)多靶點(diǎn)檢測(cè)和性能穩(wěn)定外，賽默飛還開發(fā)了專屬數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。這些都是我們選擇這一產(chǎn)品的原因。

· Ion AmpliSeq™ 甲基化檢測(cè)法和您以前用的方法相比如何?

該方法操作簡(jiǎn)單，并提升了報(bào)告流程、準(zhǔn)確性、特異性、靈敏度和穩(wěn)定性等方面的性能。

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* 僅供研究使用,不用于診斷過程

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