目錄:上海烜雅生物科技有限公司>>分子生物學(xué)試劑>>試劑盒>> miRNA 染料法qRT-PCR試劑盒(polyA加尾法)
供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 25次 |
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貨號 | XY-D-1739 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 化工,生物產(chǎn)業(yè) |
主要用途 | 科研 | 英文名稱 | / |
保存條件 | -20℃ | 有效期 | 1年 |
產(chǎn)品簡介:
本試劑盒采用E.coli polyA聚合酶對miRNA加尾,然后用特異引物進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,最后用熒光定量PCR試劑盒進(jìn)行定量檢測,其原理示意圖如下:
產(chǎn)品特點(diǎn):
1.兩步法(加尾-逆轉(zhuǎn)錄、染料法 qPCR),一步完成加尾-逆轉(zhuǎn)錄,然后檢測多個 miRNA 靶分子。一次加尾-逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)得到的 cDNA 可以做上百次 PCR。
2.直接用總 RNA 為模板,不需要專門純化 miRNA,簡單快捷。
3.檢測靈敏度可以達(dá)到幾百個拷貝/反應(yīng)。
4.能區(qū)分有 2-3 個堿基不同的 miRNA。
5.既可以定性,也可以定量。定量時線性范圍至少有 5 個數(shù)量級,但需要自備標(biāo)準(zhǔn)品。
6.既可以用總 RNA 為模板,也可以用總 miRNA 為模板。
7.用戶需要自備 miRNA 專一性的一條 PCR 上游引物。
8.本產(chǎn)品足夠 25 次 20uL 體系的加尾和逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),100 次 20uL 體系的染料法qPCR。
9.miRNA 染料法qRT-PCR試劑盒(polyA加尾法)只能用于科研。
產(chǎn)品參數(shù):
成分規(guī)格包裝材料
加尾和逆轉(zhuǎn)錄 Mix
(含 dNTP 和 ATP)150 μL0.5mL 綠蓋管
miRNA-polyA RT 引物干粉0.5mL 本色管
E.coli polyA 聚合酶和
M-MLV 逆轉(zhuǎn)錄酶混合液40 μL0.5mL 紅蓋管
miRNA PCR 通用下游引物 干粉0.5mL 黃色管
2×SYBR PCR MasterMix1 mL0.5mL 棕色管
超純水1 mL2.0mL 藍(lán)蓋管
使用手冊1 份無
運(yùn)輸及保存
低溫運(yùn)輸,-20℃保存,有效期一年。
自備試劑
總 RNA、miRNA 專一性上游引物(5pmol/μL in 水中)
使用方法:
一、設(shè)計(jì)、合成和分析自備的 miRNA 專一性上游引物
1.本試劑盒需要用戶自行設(shè)計(jì)一條 miRNA 靶分子專一性的上游引物跟試劑盒提供的通用引物共同使用,用超純水稀釋到 5pmol/μL 待用。
2.miRNA 專一性上游引物的 Tm 值決定后續(xù) PCR 的復(fù)性溫度,非常重要,故
必須準(zhǔn)確??梢酝ㄟ^網(wǎng)上的在線分析軟件(如 oligoanalyzer)計(jì)算 Tm,但最好實(shí)驗(yàn)測定,做法是將 100pmol miRNA 專一性上游引物和等量的互補(bǔ)引物
(不是下游引物)在 20μL 的本試劑盒提供的 2×SYBR PCR MasterMix 反應(yīng)體系中混合(參考第 9 步,只是不加模板,其他成分都加),直接進(jìn)行溶解曲線分析,測出在本試劑盒提供的反應(yīng)體系中的 Tm 值。當(dāng)軟件計(jì)算的 Tm 值和實(shí)驗(yàn)測試的 Tm 值有差異時,以后者為準(zhǔn)。
3.miRNA 專一性上游引物最好在 3 端比 miRNA 短幾個堿基。
4.可以選擇一個所研究物種的 5.8S rRNA 作為內(nèi)參,設(shè)計(jì)一條 5.8S rRNA 專一性的引物,同時做平行實(shí)驗(yàn)。
二、準(zhǔn)備總 RNA
5.用自選方法和試劑純化總 RNA,測定其濃度,最后用超純水將其稀釋到100ng/μL???RNA 樣品中殘留的 DNA 污染由于并沒有下游通用引物
(miRNA-polyA RT 引物)的結(jié)合位點(diǎn),所以一般不會干擾基于本方法的
miRNA PCR 檢測。
三、加尾及逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)
6.按下表設(shè)置 RNA 加尾和逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),以 1 個樣品為例:
7.37℃保溫 1 小時。
8.加入 190μL 超純水使得總體積為 200μL(稀釋 20 倍),此樣品將作為 cDNA模板用于 PCR。未用完的 cDNA 20 倍稀釋樣品可以放-20℃至少兩年以上。
二、染料法 qPCR
9.按下表設(shè)置染料法 qPCR 反應(yīng),最好每個反應(yīng)設(shè)置 3 個重復(fù):
10.建議反應(yīng)程序設(shè)置如下:
11.分析溶解曲線分析所得 Tm(在 70-80℃之間一般表示擴(kuò)增是特異的),分析Ct 值,分析標(biāo)準(zhǔn)曲線的斜率和 R2(如果用陽性對照做了標(biāo)準(zhǔn)曲線反應(yīng)的話)。
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