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參考價: | ¥ 3165 |
訂貨量: | 1 臺 |
- 12259ES08 產(chǎn)品型號
- Yeasen/翌圣生物 品牌
- 生產(chǎn)商 廠商性質(zhì)
- 上海市 所在地
訪問次數(shù):364更新時間:2023-02-20 16:54:41
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- 網(wǎng)址:
- www.yeasen.com
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供貨周期 | 現(xiàn)貨 | 規(guī)格 | 8 T |
---|---|---|---|
貨號 | 12259ES08 | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 醫(yī)療衛(wèi)生,化工,生物產(chǎn)業(yè) |
一步快速去除核糖體(rRNA去除)試劑盒(人)
產(chǎn)品信息
產(chǎn)品名稱 | 產(chǎn)品編號 | 規(guī)格 | 價格/元 |
Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit (Human,1-100 ng) 一步快速去除核糖體(rRNA去除)試劑盒(人) | 12259ES08 | 8 T | 3165 |
12259ES24 | 24 T | 11365 | |
12259ES96 | 96 T | 37365 |
產(chǎn)品描述
Hieff NGS® One-Step rRNA Removal Kit (Human,1-100 ng)利用靶向技術(shù)在cDNA合成過程中高特異性地抑制人總RNA中的核糖體RNA的逆轉(zhuǎn)錄,而不影響信使RNA (mRNA)、非編碼RNA以及環(huán)狀RNA等非靶RNA的cDNA合成,從而在一鏈cDNA合成過程中高特異性去除核糖體RNA。這種靶向去除技術(shù)相較于傳統(tǒng)的RNase H消化法具有耗時短 (3 min)、操作簡單(一步操作)和非靶RNA保留完整等優(yōu)點,極大簡化了操作流程和提高了建庫效率,可以與市面上各類一鏈cDNA合成試劑配套。該試劑盒對于完整和部分降解的總RNA(如FFPE RNA)均具有良好的rRNA去除效果。經(jīng)rRNA去除所獲得的cDNA樣本可用于高通量測序分析mRNA和非編碼RNA,可顯著提高測序結(jié)果中有效數(shù)據(jù)比例,也可用于其它cDNA下游應(yīng)用。提供的試劑已經(jīng)過嚴(yán)格的質(zhì)量控制和功能驗證,保證了rRNA去除的穩(wěn)定性和重復(fù)性。
適用范圍
適用于人來源的1-100 ng 總RNA樣品;適用于完整或部分降解RNA(如FFPE RNA)樣品。
產(chǎn)品組分
產(chǎn)品組份 | 12259ES08 | 12259ES24 | 12259ES96 |
One-Step rRNA Removal Mix | 8 μL | 24 μL | 96 μL |
運(yùn)輸與保存方法
干冰運(yùn)輸,-20°C存放。效期兩年。
注意事項
一、 關(guān)于操作
1. 請使用無RNase污染的耗材,并對實驗區(qū)域定期進(jìn)行清理,推薦使用Thermo Fisher公司的RNAZap™ 高效核酸去除噴霧去除RNA酶污染。
2. RNA樣品應(yīng)不含基因組DNA污染,若樣品中有g(shù)DNA殘留,應(yīng)先進(jìn)行DNase I消化并純化后再用于本試劑盒。
3.若樣品體積較大,可先進(jìn)行濃縮。
4. 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
5. 本產(chǎn)品僅作科研用途!
二、自備材料
1. qRT-PCR質(zhì)檢rRNA去除效率:Hieff® qPCR SYBR Green Master Mix(No Rox) (Cat#11201)或其他等效產(chǎn)品;
2. 其他材料:無菌超純水、低吸附槍頭、PCR管、PCR儀等。
使用方法
一、操作流程
圖1. 使用快速去除核糖體RNA試劑盒+RNA建庫試劑盒進(jìn)行RNA建庫流程
二、操作步驟
方案1:在逆轉(zhuǎn)錄體系中去除rRNA。
1. 使用翌圣生物的Hifair® Ⅱ 1st Strand cDNA Synthesis Kit (Cat#11119)進(jìn)行本試劑盒rRNA去除效率測試,其他逆轉(zhuǎn)錄試劑盒也可以用于本測試。
2. 逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)體系配制(20 μL體系)
RNA不片段化體系 | RNA片段化體系 | |||
Total RNA | 1-100 ng | Total RNA | 1-100 ng | |
Random Primers N6 (50 μM) | 1 μL | Random Primers N6 (50 μM) | 1 μL | |
One-Step rRNA Removal Mix | 1 μL | One-Step rRNA Removal Mix | 1 μL | |
RNase free ddH2O | To 14 μL | 5×Hifair® Ⅱ Buffer | 4 μL | |
混勻后瞬離,按照下列反應(yīng)程序進(jìn)行反應(yīng): | RNase free ddH2O | To 18 μL | ||
75℃ | 1 min | 混勻后瞬離,按照下列反應(yīng)程序進(jìn)行反應(yīng): | ||
50℃ | 2 min | 94℃(片段化溫度和時間可根據(jù)需求自行調(diào)整) | 5 min | |
4℃ | Hold | 75℃ | 1 min | |
50℃ | 2 min | |||
上述反應(yīng)體系 | 14 μL | 4℃ | Hold | |
5×Hifair® Ⅱ Buffer | 4 μL | |||
Hifair® Ⅱ Enzyme Mix | 2 μL | 上述反應(yīng)體系 | 18 μL | |
Total | 20 μL | Hifair® Ⅱ Enzyme Mix | 2 μL | |
混勻后瞬離,按照下列反應(yīng)程序進(jìn)行反應(yīng): | Total | 20 μL | ||
25℃ | 5 min | 混勻后瞬離,按照下列反應(yīng)程序進(jìn)行反應(yīng): | ||
42℃ | 30 min | 25℃ | 5 min | |
85℃ | 5 min | 42℃ | 15 min | |
85℃ | 5 min |
3. qPCR檢測rRNA去除效果。
圖2.qPCR驗證一步rRNA快速去除試劑盒的去除效果
方案2:在RNA NGS文庫構(gòu)建中去除rRNA。
1. 使用翌圣生物的Hieff NGS® Dual-mode RNA Library Prep Kit (Cat#12252 for Illumina, 13333 for MGI)進(jìn)行本試劑盒rRNA去除效率測試。
RNA片段化 | |
組份 | 體積 |
Total RNA | 1-100 ng |
2×Frag/Prime Buffer | 8.5 μL |
One-Step rRNA Removal Mix | 1 μL |
DEPC H2O | to 17 μL |
混勻后瞬離,按照下列反應(yīng)程序進(jìn)行反應(yīng): | |
溫度 | 時間 |
94℃(片段化溫度和時間可根據(jù)需求自行調(diào)整) | 5 min |
75℃ | 1 min |
50℃ | 2 min |
4℃ | Hold |
組份 | 體積 |
上述反應(yīng)體系 | 17 μL |
Strand Specificity Reagent | 6 μL |
1st Strand Enzyme Mix | 2 μL |
Total | 25 μL |
混勻后瞬離,按照下列反應(yīng)程序進(jìn)行反應(yīng): | |
溫度 | 時間 |
25℃ | 10 min |
42℃ | 15 min |
70℃ | 15 min |
接Step 2第二鏈cDNA的合成/末端修復(fù)/加A |
圖3. 二代測序驗證一步rRNA快速去除試劑盒的去除效果
2. 使用New England Biolabs的NEBNext Ultra II Directional RNA Library Prep Kit for Illumina (Cat#E7760)聯(lián)合本試劑盒進(jìn)行rRNA去除方案。
RNA片段化 | |
組份 | 體積 |
Total RNA | 1-100 ng |
First Strand Synthesis Reaction Buffer (5×) | 4 μL |
Random Primers | 1 μL |
One-Step rRNA Removal Mix | 1 μL |
DEPC H2O | to 10 μL |
混勻后瞬離,按照下列反應(yīng)程序進(jìn)行反應(yīng): | |
溫度 | 時間 |
94℃(片段化溫度和時間可根據(jù)需求自行調(diào)整) | 5 min |
75℃ | 1 min |
50℃ | 2 min |
4℃ | Hold |
接下游一鏈合成體系 |
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HB210923