一、ABI7900熒光定量PCR儀是繼7700、5700型熒光定量PCR儀之后,ABI公司推出的高通量實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)。它是兼容96孔板和384孔板的熒光定量PCR儀,也是可選手工進(jìn)樣和自動進(jìn)樣的熒光定量PCR儀。7900HT型熒光定量PCR儀可滿足從中通量到高通量實(shí)驗(yàn)的需求。
二、ABI7900熒光定量PCR儀主要特點(diǎn):
(1)高效平臺-7900HT系統(tǒng)是為支持高通量而構(gòu)建的,光學(xué)系統(tǒng)經(jīng)優(yōu)化以適用于384孔板熒光信號的激活和實(shí)時(shí)檢測。
(2)結(jié)果可靠-7900HT系統(tǒng)采用了與7700、5700相同的定量原理,利用Ct值(Ct定義為在基線上方產(chǎn)生可檢測到的統(tǒng)計(jì)學(xué)上顯著的熒光發(fā)射的這一PCR循環(huán))和起始拷貝數(shù)的對應(yīng)關(guān)系,通過外標(biāo)準(zhǔn)曲線精確計(jì)算未知樣品的起始拷貝數(shù)。
(3)高度重現(xiàn)性-7900HT系統(tǒng)的熒光檢測發(fā)生在PCR對數(shù)期的起始,因此反應(yīng)管中各組分沒有任何限制反應(yīng)因素,從而確保檢測結(jié)果都是精確并能重復(fù)的。
(4)先進(jìn)的熒光檢測技術(shù)-RISM®7900HT熒光定量PCR系統(tǒng)在不降低速度、分辨率的情況下有效提高了產(chǎn)率,這是基于先進(jìn)的熒光檢測技術(shù):一束激光掃描并激活384個(gè)孔的每一個(gè)孔里的熒光染料,熒光信號通過光柵分光,經(jīng)過分離的多色熒光同時(shí)到達(dá)CCD攝像機(jī),實(shí)現(xiàn)多色熒光同時(shí)檢測。
(5)自動進(jìn)樣裝置-7900HT系統(tǒng)配備有自動化配件可取得高效率。自動化裝置可容納84塊384孔板,機(jī)械手臂可按一定順序?qū)⒋郎y樣品板運(yùn)送至主機(jī)內(nèi),配備的條形碼閱讀器(Barcodereader)可自動識別進(jìn)入主機(jī)的樣品板編號,使你在任何時(shí)間可以在樣品行列中插入或替代樣品板。
(6)多樣的化學(xué)試劑-7900HT型熒光定量PCR儀上可使用的化學(xué)試劑包括TaqMan熒光探針法和SYBRGreen熒光染料法。TaqMan探針法具有高度的靈敏度和特異性,適用于實(shí)時(shí)定量的多重反應(yīng)或單核苷酸多態(tài)性分析(SNP)。SYBRGreen染料應(yīng)用于目標(biāo)鑒定(篩選測定)或者在只需用少數(shù)幾個(gè)反應(yīng)的測定中為理想。
(7)有效防污染-7900HT系統(tǒng)在PCR全過程中使用專門設(shè)計(jì)的和始終密閉的樣品管。在加入樣品和試劑后這些管子便立即封閉并在擴(kuò)增和檢測過程中保持這種狀態(tài),這樣就可以大大地減少污染的機(jī)會;此外,7900HT系統(tǒng)不存在PCR后處理,有效防止擴(kuò)增產(chǎn)物對實(shí)驗(yàn)環(huán)境的污染而造成的假陽性。
(8)多種定量方法-ABIPRISM®7900HT序列檢測系統(tǒng)軟件為基因表達(dá)提供一種定量化方法。定量是從一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)曲線上直接測定目標(biāo)(基因)的量。相對定量方法是通過與標(biāo)定樣品相比較而計(jì)算未知樣品的量,不需要標(biāo)準(zhǔn)曲線。
三、原理介紹:
1.定量,為了測定未知樣品中的目標(biāo)(基因)的數(shù)量,7900HT系統(tǒng)可用來測定樣品的CT,然后用一條標(biāo)準(zhǔn)曲線來測定起始的拷貝數(shù)。在標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制中,7900HT系統(tǒng)軟件首先用已知的起始拷貝數(shù)的幾種稀釋度計(jì)算它們的CT值。接著,軟件使用測得的CT值對應(yīng)于起始拷貝數(shù)的對數(shù)值作圖。至少在五個(gè)數(shù)量級范圍中兩者呈線性關(guān)系。
2.相對定量,對于基因表達(dá)研究來說,相對定量是理想的方法。這里不是應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)曲線而是相對于標(biāo)定樣品計(jì)算表達(dá)水平。用一個(gè)內(nèi)源對照來標(biāo)定樣品的量。這一方法與7900HT系統(tǒng)在一個(gè)多重反應(yīng)中能同時(shí)對目標(biāo)和內(nèi)源對照進(jìn)行定量測定的能力相結(jié)合,可實(shí)現(xiàn)高效、高通量的基因表達(dá)研究。
3.有效的SNP檢測手段,除實(shí)時(shí)定量測定以外,7900HT系統(tǒng)包括對于已知的單一核苷酸多態(tài)性(SNPS)作大規(guī)模篩選的軟件。在一對等位基因系統(tǒng)中,用對應(yīng)于兩個(gè)等位基因的兩個(gè)TaqMan探針在同一個(gè)試管中做多重PCR反應(yīng)。反應(yīng)終止時(shí)所產(chǎn)生的熒光用7900HT系統(tǒng)進(jìn)行測定,實(shí)驗(yàn)結(jié)果通過分析軟件迅速取得。
四、儀器規(guī)格和技術(shù)指標(biāo):
(1)系統(tǒng)組成,7900HT熒光定量PCR儀-384孔或96孔可更換式半導(dǎo)體控溫PCR儀,488nm長壽氬離子激光器,X,Y雙軸同步熒光掃描頭。
(2)光柵和CCD檢測裝置,自動進(jìn)樣裝置,DELLGX270電腦,Windows2000操作系統(tǒng),儀器控制,數(shù)據(jù)采集及結(jié)果分析軟件,PrimerExpress引物探針設(shè)計(jì)軟件。
(3)大產(chǎn)率,實(shí)時(shí)定量檢測-5000樣品/天(標(biāo)準(zhǔn)模式),96樣品/35分鐘(快速模式),終點(diǎn)SNP分析-30000樣品/2.5小時(shí)。
(4)裝機(jī)指標(biāo),以99.7%的置信度明確區(qū)分濃度差別兩倍(5000和10000拷貝)的樣品的定量結(jié)果試劑和消耗品。
(5)完備的通用基本試劑盒和消耗品,十二萬種TaqmanGeneExpressionAssays人、大鼠、小鼠基因組基因表達(dá)分析試劑盒,二百萬種TaqmanValidatedSNPGenotypingAssays人、大鼠、小鼠基因組SNP檢測試劑盒。
(6)Taqman低密度表達(dá)譜芯片,CustomAssays代客設(shè)計(jì)、合成引物探針服務(wù)。