40213糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
【簡(jiǎn)單介紹】
品牌 | NobleRyder/諾博萊德 | 貨號(hào) | 40213 |
---|---|---|---|
規(guī)格 | 50次 | 供貨周期 | 現(xiàn)貨 |
主要用途 | 適用于快速提取各種糞便DNA | 應(yīng)用領(lǐng)域 | 環(huán)保,化工,生物產(chǎn)業(yè),農(nóng)林牧漁,制藥/生物制藥 |
糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
【詳細(xì)說(shuō)明】
糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
目錄號(hào):40213
目錄編號(hào) | 包裝單位 |
40213-50 | 50次 |
v 適用范圍:
適用于快速提取各種糞便DNA
v 試劑盒組成、儲(chǔ)存、穩(wěn)定性:
試劑盒組成 | 保存 | 50次 |
緩沖液ASL | 室溫 | 70ml |
雜質(zhì)清除劑AB | 室溫 | 5ml |
結(jié)合液CB | 室溫 | 11 ml |
抑制物去除液IR | 室溫 | 25 ml |
漂洗液WB | 室溫 | 15 ml 第一次使用前按說(shuō)明加指ding量乙醇 |
洗脫緩沖液EB | 室溫 | 15 ml |
蛋白酶K fen(可選) 20mg/ml | 室溫 | 20mg |
吸附柱AC | 室溫 | 50個(gè) |
收集管(2ml) | 室溫 | 50個(gè) |
本試劑盒在室溫儲(chǔ)存12個(gè)月不影響使用效果。
雜質(zhì)清除劑AB,短時(shí)間內(nèi)使用可以放室溫,長(zhǎng)期保存負(fù)-20℃。
儲(chǔ)存事項(xiàng):
1. 緩沖液ASL或者結(jié)合液CB低溫時(shí)可能出現(xiàn)析出和沉淀,可以在70℃水浴幾分鐘幫助重新充分溶解,恢復(fù)澄清透明后冷卻到室溫即可使用。
2. 雜質(zhì)清除劑AB常溫運(yùn)輸,短期一個(gè)月內(nèi)可4℃存放,-20℃長(zhǎng)期保存。
3. 為避免降低活性,方便運(yùn)輸,提供蛋白酶K為凍干粉狀,收到后,可短暫離心后,加入1毫升滅菌水溶解,因?yàn)榉磸?fù)凍融可能會(huì)降低酶活性,因此溶解后立即按照每次使用量(20微升)分裝凍存,-20℃保存。
4. 避免試劑長(zhǎng)時(shí)間暴露于空氣中產(chǎn)生揮發(fā)、氧化、pH值變化,各溶液使用后應(yīng)及時(shí)蓋緊蓋子。
v 產(chǎn)品介紹:
常規(guī)的DNA純化方式并不能有效地去除糞便中存在的大量抑制因子而導(dǎo)致下游實(shí)驗(yàn)的失敗,如PCR不能擴(kuò)增出所需片段。該試劑盒采用DNA吸附柱和新型du特的溶液系統(tǒng),能有效去除動(dòng)物糞便中各種影響下游實(shí)驗(yàn)(如PCR)的抑制因子,并能高效地回收糞便中的基因組DNA。動(dòng)物糞便樣品經(jīng)特殊緩沖液ASL重懸后,70℃處理5分鐘裂解細(xì)菌;離心去除不溶解的雜質(zhì),蛋白酶K消化進(jìn)一步去除蛋白和雜質(zhì);然后基因組DNA在高離序鹽狀態(tài)下選擇性吸附于離心柱內(nèi)硅基質(zhì)膜, 再通過(guò)一系列快速的漂洗-離心的步驟,抑制物去除液和漂洗液將細(xì)胞代謝物、蛋白等雜質(zhì)去除,最后低鹽的洗脫緩沖液將純凈基因組DNA從硅基質(zhì)膜上洗脫。
v 產(chǎn)品特點(diǎn):
1. 離心吸附柱內(nèi)硅基質(zhì)膜全部采用進(jìn)口*公司特制吸附膜,柱與柱之間吸附量差異極小,可重復(fù)性好??朔藝?guó)產(chǎn)試劑盒膜質(zhì)量不穩(wěn)定的弊端。
2. 不需要使用有毒的苯fen等試劑,也不需要乙醇沉淀等步驟。
3. 快速,簡(jiǎn)捷,單個(gè)樣品操作一般可在40分鐘內(nèi)完成。
4. 多次柱漂洗確保高純度,OD260/OD280典型的比值達(dá)1.7~1.9,可直接用于PCR,Southern-blot和各種酶切反應(yīng)。
v 注意事項(xiàng):
1. 所有的離心步驟均在室溫完成,使用轉(zhuǎn)速可以達(dá)到13,000rpm的傳統(tǒng)臺(tái)式離心機(jī),如Eppendorf 5415C 或者類(lèi)似離心機(jī)。
2. 開(kāi)始實(shí)驗(yàn)前將需要的水浴先預(yù)熱到70℃?zhèn)溆谩?/span>
3. 結(jié)合液CB和抑制物去除液IR中含有刺激性化合物,操作時(shí)要戴乳膠手套,避免沾染皮膚,眼睛和衣服。若沾染皮膚、眼睛時(shí),要用大量清水或者生理鹽水沖洗。
4. 洗脫液EB不含有螯合劑EDTA, 不影響下游酶切、連接等反應(yīng)。也可以使用水洗脫, 但應(yīng)該確保pH大于7.5, pH過(guò)低影響洗脫效率。用水洗脫DNA應(yīng)該保存在-20℃。DNA如果需要長(zhǎng)期保存,可以用TE緩沖液洗脫(10mM Tris-HCl, 1mM EDTA,pH 8.0),但是EDTA可能影響下游酶切反應(yīng),使用時(shí)可以適當(dāng)稀釋。
5. PCR可能被過(guò)量的DNA(一般大于1μg)抑制,使用最小用量的洗脫DNA(適當(dāng)稀釋?zhuān)┓炊梢缘玫礁玫臄U(kuò)增。一般加入的洗脫DNA體積不要超過(guò)總PCR反應(yīng)體積的10%。我們建議在PCR反應(yīng)體系中加入終濃度0.1 μg/μl的BSA(牛血清白蛋白)有助于得到優(yōu)良擴(kuò)增效果。
v 操作步驟:(實(shí)驗(yàn)前請(qǐng)先閱讀注意事項(xiàng))
提示:第一次使用前請(qǐng)先在15ml漂洗液WB中加入60ml無(wú)水乙醇,充分混勻,加入后請(qǐng)及時(shí)在方框打鉤標(biāo)記已加入乙醇,以免多次加入!
1. 收集約200-220mg糞便到一個(gè)2ml離心管,置冰上。
如果是冰凍的標(biāo)本,加入緩沖液ASL前不能解凍,否則DNA容易降解。
2. 加1.4ml 緩沖液ASL,連續(xù)渦旋振蕩1分鐘或者直到wan全混勻均一。
注意wan全渦旋混勻,否則會(huì)嚴(yán)重降低產(chǎn)量。
3. 將重懸物70℃溫育5分鐘。
該加熱步驟可以提高3-5倍DNA產(chǎn)量,并且?guī)椭呀饧?xì)菌和寄生蟲(chóng)。對(duì)于某些難裂解的細(xì)胞(如革蘭氏陽(yáng)性菌)可以提高到95℃。
4. 渦旋振蕩15秒,室溫放置1分鐘。最高速離心1分鐘沉淀糞便顆粒。
5. 轉(zhuǎn)移900μl上清到一個(gè)1.5ml離心管,加入100μl雜質(zhì)清除劑AB,立刻渦旋振蕩1分鐘或者直到wan全混勻均一,室溫放置1分鐘。最高速離心3分鐘去除雜質(zhì)。
6. 轉(zhuǎn)移所有上清到一個(gè)1.5ml離心管,最高速離心3分鐘。
7. 轉(zhuǎn)移210μl上清到一個(gè)1.5ml離心管,加入20μl蛋白酶K (20mg/ml)溶液,充分混勻,加入200μl 結(jié)合液CB,渦旋振蕩15秒,充分混勻。70℃溫育10分鐘。
如果產(chǎn)量偏低,可以轉(zhuǎn)移更多的上清,并且相應(yīng)的按比例提高蛋白酶K和結(jié)合液的和后面的異丙醇使用量。
8. 冷卻后加入100μl 異丙醇,渦旋混勻。
9. 將上一步所得溶液和可能出現(xiàn)的沉淀都加入一個(gè)吸附柱AC中,(吸附柱放入收集管中)13,000rpm離心30秒,倒掉收集管中的廢液。
10. 加入500μl抑制物去除液IR,12,000rpm 離心30秒,棄廢液。
11. 加入700μl漂洗液WB(請(qǐng)先檢查是否已加入無(wú)水乙醇!),12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。
12. 加入500μl漂洗液WB,12,000rpm 離心30秒,棄掉廢液。
13. 將吸附柱AC放回空收集管中,13,000rpm離心2分鐘,盡量除去漂洗液, 以免漂洗液中殘留乙醇抑制下游反應(yīng)。
14. 取出吸附柱AC,放入一個(gè)干凈的離心管中,在吸附膜的中間部位加100-150μl洗脫緩沖液EB(洗脫緩沖液可事先在 65-70℃水浴中預(yù)熱), 室溫放置2分鐘,12,000rpm 離心1分鐘。將得到的溶液重新加入離心吸附柱中,室溫放置2分鐘,12,000rpm離心1分鐘。
洗脫體積越大,洗脫效率越高,如果需要DNA濃度較高,可以適當(dāng)減少洗脫體積, 但是最小體積不應(yīng)少于50μl,體積過(guò)小降低DNA洗脫效率,減少DNA產(chǎn)量。
15. DNA可以存放在2-8℃,如果要長(zhǎng)時(shí)間存放,可以放置在-20℃。
v 問(wèn)題與解決方法:
問(wèn)題 | 評(píng)論與建議 |
洗脫液沒(méi)有 DNA或者產(chǎn)量低 | *樣品儲(chǔ)存不當(dāng)-建議:樣品應(yīng)該儲(chǔ)存在4℃或者-20℃ *在緩沖液ASL中渦旋勻漿不充分-建議:樣品在ASL中充分的渦旋直到均一。 *和結(jié)合液CB混勻不充分-建議:上清和結(jié)合液CB立即充分間斷渦旋混勻。 *上離心柱前忘記加異丙醇-建議:記住加異丙醇 * DNA洗脫不充分-建議:洗脫前在室溫放5分鐘 *第一次使用前,漂洗液WB中忘記加無(wú)水乙醇-建議:在漂洗液WB中加入指ding量無(wú)水乙醇。 |
A260/A280 比值異常高 | *殘留RNA過(guò)高-建議:洗脫緩沖液加RNase A,室溫10-30分鐘。 |
DNA下游 反應(yīng)不正常 | * BSA沒(méi)有加到PCR反應(yīng)體系-建議:PCR反應(yīng)體系中加入終濃度0.1 μg/μl的BSA。 *下游反應(yīng)中使用的DNA過(guò)量了-建議:假如DNA使用太多,可能會(huì)抑制PCR反應(yīng),因此可減少洗脫DNA使用量 *非特異性擴(kuò)增條帶-建議:洗脫液中目的DNA量太低,背景DNA過(guò)高,可以考慮使用熱啟動(dòng)PCR聚合酶 *某些目的細(xì)胞裂解困難,不充分導(dǎo)致產(chǎn)量低-建議:可以把裂解液溫育時(shí)間提高到95℃ *沒(méi)有足夠DNA洗脫下來(lái)-建議:查看上面可能的原因 |
最初的離心步驟 第4步驟后沒(méi)有 見(jiàn)到多少上清 | *離心力不夠-建議:可以嘗試14000rpm離心5分鐘 |
糞便基因組DNA快速提取試劑he(離心柱型)
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